为全面了解苹果基因组中热激转录因子（Hsf）的序列特征及进化，采用生物信息学手段，在苹果全基因组水平上鉴定出50个MdHsf基因，并对其系统发育关系、序列特征、表达情况以及选择压力进行详细分析。系统发育与序列分析显示：与拟南芥和水稻相似，50个MdHsf基因可分为A、B、C 3个亚族；2个或多个MdHsf基因位于同一个末端进化支，说明该基因家族在苹果中发生了物种特异性扩增；尽管MdHsf基因的内含子数目和长度变异较大，但其蛋白的保守基序和功能结构域具有较高的保守性，这可能与功能约束有关。基于EST数目，可推知：除了MdHsfA2a和MdHsfA3a/b/c等14个基因没有相应的EST外，其余72%的基因都有转录活性。选择压力检测和结构建模分析显示：在36个MdHsf蛋白的选择压力检测中，位点模型未鉴定到正选择位点的存在；而在显著水平下（P<0.05），分支-位点模型在d和e进化分支上，共检测到5个正选择位点，它们是28R、30L、35D、51M、67V，其中28R和30L位于Hsf结构域中，35D、51M和67V位于Hsf结构域之外，这说明除了MdHsfA4d/e和MdHsfC1a/b发生快速进化外，其他成员受控于纯净选择，具有高度保守性。综合以上研究结果，苹果基因组中存在多种热激转录因子，其蛋白的保守基序和功能结构域具有较高保守性，大多具有转录活性，在进化上该家族受纯净选择主导。

为了研究葡萄抗逆基因(CAN70200.1)的表达特性,采用PCR技术从葡萄中克隆了CAN70200.1基因上游一段长度为1354 bp的启动子片段,命名为P_CAN。采用PlantCARE和PLACE启动子在线预测工具分析表明,P_CAN启动子序列具有CAAT-box、TATA-box基本的顺式作用元件和一些参与非生物胁迫、光和植物激素应答相关的顺式作用元件。为验证启动子的表达特性,将P_CAN启动子连接到pCAMBIA1391Z载体GUS基因的上游,构建成植物表达载体p1391Z-CAN,并通过农杆菌介导法转化烟草,经PCR鉴定,获得转基因植株。对转基因烟草植株进行逆境胁迫处理发现,在干旱处理120 min后,P_CAN启动子活性达到最强;而4℃低温处理30~60 min时,P_CAN启动子活性达到最强,表明P_CAN启动子具有低温和干旱胁迫诱导表达特性。

为获得苹果砧木逆境胁迫相关转录因子,以QZ1(平邑甜茶(Malus hupehensis Rehd.)×柱型苹果株系CO(Malus domestica Borkh.)和M26为试材,利用同源克隆法克隆得到苹果SBP基因cDNA的全长序列,命名为MdSBP20。对扩增得到的cDNA序列进行生物信息学分析,结果表明,该序列全长1362bp,包含完整开放阅读框1362bp,编码454个氨基酸,具有明显的SBP结构域,包含2个锌指结构Zn-1、Zn-2和双向核定位信号区NLS。系统进化树分析,结果表明MdSBP20与白梨(XM_009339726.1)和苹果(XM_008376435.1)亲缘关系较近。实时荧光定量分析结果表明,MdSBP20基因在低温、干旱、盐害中发挥一定功能,推测QZ1的耐寒性、耐旱性及耐盐性均强于M26。研究表明,MdSBP20基因在苹果响应非生物逆境胁迫中具有重要调控作用。

为了研究葡萄肌醇半乳糖苷合成酶基因家族的特性，以抗低温品种左优红组培苗为材料，通过同源克隆技术，获得VvGolS2、VvGolS3和VvGolS4全长CDS，对其序列进行了生物信息学分析，同时利用实时定量PCR技术探究了3个基因的组织表达特性和响应逆境因子及相关信号分子的特性。结果显示：3个基因cDNA大小分别为954，978，1 011 bp，分别编码317，325，336个氨基酸序列；3个蛋白分子量分别为36.65，36.97，38.12 kDa；等电点分别为5.12，5.33和5.16，且均在C端含有一个疏水的五肽APXAA；实时荧光定量PCR证明，3个GolSs在葡萄不同组织中表达情况不同，VvGolS2和VvGolS4在叶片中表达量最高，而VvGolS3则在花和卷须中表达量最高；不同逆境因子及逆境信号分子均会影响VvGolS2、VvGolS3和VvGolS4基因的表达量，其中VvGolS2和VvGolS4基因的表达受盐诱导最明显，VvGolS3基因的表达受低温诱导最明显；另外，胁迫信号分子乙烯、过氧化氢和脱落酸均可诱导VvGolS2基因表达量上升，而VvGolS3基因的表达受脱落酸和乙烯的诱导，乙烯、过氧化氢和硫化氢则均可诱导VvGolS4基因表达量上升。综上推测，3个VvGolSs均与葡萄抵御逆境胁迫相关，但各自功能可能有所不同。

为研究木质素合成相关基因（PAL1、PAL2、CAD、POD、4CL）在大果水晶梨褐色果皮突变体中的表达特性，并为研究梨褐色果皮形成机制奠定基础。按照RNA试剂盒法提取果皮、花、叶片、果肉、枝条韧皮部中总RNA；利用DNAMAN和Primer 5.0软件设计特异引物；使用实时荧光定量PCR技术研究基因的表达。结果表明，PAL1、PAL2、CAD、POD、4CL的最高相对表达量均出现在果皮中；果皮和果肉中POD的相对表达量极显著高于其他基因，花、叶片和枝条韧皮部中CAD的相对表达量极显著高于其他基因。综上所述，大果水晶梨褐色果皮突变体木质素合成相关的5个酶基因在果皮、果肉、叶片、花和枝条韧皮部中的表达具有明显的组织特异性，这些基因可能与大果水晶梨褐色果皮的形成关系密切。

为探讨开张型、直立型、垂枝型、帚形、矮化型和紧凑型不同生长型桃树叶脉结构与树体结构的关系，为桃矮化密植栽培、早期选择提供理论依据。以6种不同生长型桃为试材，对其树体结构特征和叶片形态、叶脉结构进行研究，并对树体结构与叶脉结构的关系进行分析。结果表明：6种生长型桃的叶片角度大小为62.76°~73.50°，没有显著差异，而分枝角度存在显著差异。其中对一级枝基角而言，垂枝型93.92°最大，矮化型36.75°最小，其他4种生长型居中；而一级枝腰角和梢角的变化规律在6种生长型中表现出相似规律，即垂枝型最大，开张型居中，其他4种次之且相互之间差异不显著。在叶片结构特征方面，直立型的叶片长度11.01 cm为最小，但叶柄长2.41 cm最大，紧凑型叶片长度16.20 cm、叶宽4.57 cm、叶面积47.28 cm²均最大，6种生长型的叶脉均为真曲行羽状脉；直立型二级脉数量最多，垂枝型二级脉数量最少；开张型二级脉角度最大，矮化型二级脉角度最小。6种生长型桃叶脉结构和树体结构相关性分析结果表明：开张型、矮化型、紧凑型中，二级脉数量与一级枝梢角之间存在负相关关系，且仅在开张型中两者相关性达到显著水平，相关系数为-0.970，而在直立型、垂枝型和帚型中，二级脉数量与一级枝梢角之间有正相关关系；在开张型、矮化型、紧凑型中二级脉角度与一级枝梢角呈正相关，且紧凑型中两者相关性达到显著水平，相关系数为0.953，其余生长型中两者之间有负相关关系。桃叶脉的二级脉角度和二级脉数量的差异在一定程度上可以反映不同生长型桃树体结构的变化，可作为早期选择桃不同生长型的一项直观形态标记。

旨在研究常温条件下短波紫外线（UV-C）照射处理结合不同保鲜剂的单一或复合涂膜处理对水蜜桃果实的保鲜效果，以期发现最适宜的处理方式延长其货架期。以江苏省张家港市的凤凰水蜜桃为试验材料，采用20 W的紫外灯进行处理（照射剂量：1 kJ/m²，照射距离：25 cm，照射时间：3 min），UV-C处理后的桃果实分组分别进行溶菌酶、抗坏血酸、海藻酸钠以及这3种保鲜剂复合共4种溶液涂膜处理，常温（28±3）℃条件保存，试验跨度为14 d，每隔2 d测相关生理生化指标。UV-C处理结合保鲜剂涂膜均能有效减少果实腐烂，明显延缓丙二醛（MDA）、多酚氧化酶（PPO）的上升趋势，并保存果实的可溶性固形物，单一保鲜剂处理之间效果差异不明显；“UV-C+抗坏血酸+海藻酸钠+溶菌酶”复合处理的水蜜桃保鲜效果最好，腐烂指数、失重率和可溶性固形物在第14天分别低于对照组73.02%，67.16%，27.97%，呼吸高峰由4 d推迟至10 d，硬度、MDA增长和PPO活性增强速率分别低于对照组69.37%，45.06%，19.65%。UV-C处理结合抗坏血酸、海藻酸钠和溶菌酶复合保鲜剂处理的方法在常温条件下能够有效降低桃果实的腐烂程度，延缓丙二醛（MDA）、多酚氧化酶（PPO）的上升，明显推迟呼吸高峰，可作为一种新型水蜜桃果实常温保鲜方法进行推广使用。

为进一步研究JsWRKY1的生物学功能,构建JsWRKY1的植物超表达载体并转入烟草中过表达。再生的JsWRKY1转基因烟草与野生型烟草在表型上无明显差异。JsWRKY1过表达上调了转基因烟草体内几个防卫相关基因MnSOD、Cu/ZnSOD、CN、NADPHoxidase和PR1的转录水平。与野生型烟草相比,JsWRKY1转基因烟草体内的超氧化物歧化酶、过氧化物酶和抗坏血酸过氧化物酶活性在正常生长以及胶孢炭疽菌接种后均显著增强。平板抑菌试验结果显示,JsWRKY1转基因烟草叶片总蛋白对病原真菌葡萄座腔菌、串珠状赤霉菌、胶孢炭疽菌和尖孢镰刀菌的菌丝生长具有不同程度的抑制作用。此外,用胶孢炭疽菌接种烟草叶片,转基因烟草对胶孢炭疽菌的抗性明显增强。显然,JsWRKY1是漾濞大泡核桃中正调控病害防卫反应的转录因子。

为了明确不同中间砧嘎啦苹果幼树的树体形态和不同径级根系养分分布特征，揭示树体矮化与根系矿质营养分布和积累之间的关系，选取GM256、辽砧2号、SH1、SH6、SH38和SH40矮化中间砧和乔砧的3年嘎啦苹果盆栽幼树为试材，测定树体的形态指标和根系结构特征，将根系分不同径级解析后，测定矿质营养含量和养分累积量。结果表明，与乔砧嘎啦苹果相比，不同中间砧嘎啦苹果的树体高度和干截面积明显减小，致矮程度由强到弱依次为：SH38、SH1、SH6、GM256、SH40和辽砧2号。不同矮化中间砧、不同径级根系矿质营养的含量存在明显的差异，矮化中间砧嘎啦苹果<0.5 mm根系中矿质营养含量最高，随着根系直径的增加，矿质营养含量呈递减趋势，SH38中间砧嘎啦苹果根系对K和Mg的吸收能力较强，SH1中间砧嘎啦苹果根系对Cu、Fe和Zn的吸收能力强。GM256中间砧嘎啦苹果各径级根系中P、Ca、Fe累积量以及直径>3 mm粗根中的K、Mg、Zn累积量最高，辽砧2号直径<3 mm细根中的K、Mg和Zn累积量高于乔砧和其他中间砧。生长势较弱的SH38、SH1和SH6嘎啦苹果根系养分的累积量较低，可作为冷凉气候苹果产区嘎啦苹果适宜的矮化中间砧。实际应用中应当充分考虑果园的立地条件、土壤供肥能力以及不同砧穗组合的营养需求特性，以实现苹果的优质高效生产。

为探究外源GA₃和PBZ处理对黄水蜜桃新梢生长及赤霉素合成代谢和信号转导途径相关基因表达的影响。对1年生黄水蜜桃枝条进行外源GA₃和PBZ喷施处理，测定新梢生长量，并利用qRT-PCR对GA合成代谢和信号传导途径中8个相关基因的表达量进行测定。结果表明：外源GA₃处理后新梢净生长量在处理8 d时显著高于对照，GA合成代谢相关基因KO和GA3-ox的表达量呈现出处理前期先升高后降低，处理后期逐渐升高的趋势，而GA信号转导相关基因DELLA、GID1c、SLY1的表达量呈现出在处理前期受抑制，后期迅速升高的趋势，且在处理后14 d时表达量达到峰值；外源PBZ处理后新梢净生长量在多个时期显著低于对照，并在处理后17 d时达极显著水平，GA合成代谢相关基因KO、GA20-ox、GA2-ox的表达量在整个处理过程中呈现出先逐渐升高随后降低的趋势，而GA3-ox基因在处理后整个时期近乎不表达，GA信号转导相关基因DELLA、GID1c、SLY1、ERF11的表达量在整个处理过程中均略低于对照，推测PBZ处理在转录水平上通过抑制活性GA的合成进而影响GA信号转导途径相关基因的表达来调节植物生长；外源GA₃逆转处理能显著解除PBZ对植物生长的抑制作用，且信号转导相关基因GID1c的表达量呈现出先升高后降低的趋势，DELLA基因的表达呈现出大多时期被抑制的情况。

探究白藜芦醇合酶（Resveratrol synthase，Rs）在巨峰葡萄果实发育中的潜在作用。对其序列进行结构及功能分析，并鉴定其在果实不同发育时期的时空表达特异性。采用生物信息学分析及qRT-PCR的方法，对巨峰葡萄Rs基因序列进行分析，并对其结构和亚细胞定位进行预测，以及分析果实不同时期不同组织的表达情况。克隆得到的Rs基因cDNA全长1 539 bp，开放阅读框（ORF）为1 179 bp，编码392个氨基酸，预测蛋白分子质量42.88 ku，理论等电点（pI）为6.09，且该基因含有查耳酮和二苯乙烯合酶活性位点以及完整的芪合酶家族特征位点；蛋白互作预测发现，Rs和OMT2.1具有互作，后者可催化白藜芦醇生物合成紫檀芪；亚细胞预测结果表明，Rs基因主要在细胞质和叶绿体中表达；启动子分析发现，Rs基因表达可能受光照、MYB、真菌和激素的调控并存在一定的组织特异性。qRT-PCR表达分析显示，葡萄Rs基因在果皮和果肉中不同时期均有表达，但在花后25 d的青皮中表达量最高。结合Rs基因在白藜芦醇积累的作用，可以推测可能在果实发育前期的果皮中白藜芦醇有较高积累。巨峰葡萄Rs基因在进化过程中具有较高的保守性，其表达可能受环境、真菌和激素的调控且与OMT2.1具有互作效应。而且在不同的组织和时期存在一定的特异性。