茌梨果实内切-β-1,4-葡聚糖酶基因的克隆及生物信息学分析

doi:10.3969/j.issn.1000-7091.2013.03.010

华北农学报 ›› 2013, Vol. 28 ›› Issue (3): 53-57. doi: 10.3969/j.issn.1000-7091.2013.03.010

所属专题： 梨；生物技术；

茌梨果实内切-β-1,4-葡聚糖酶基因的克隆及生物信息学分析

张晓菲, 张夏南, 王然, 张新富, 杨绍兰

青岛农业大学园林园艺学院, 山东青岛 266109

收稿日期:2013-03-07 出版日期:2013-06-28
通讯作者: 杨绍兰(1978-)，女，山东招远人，副教授，博士，主要从事果实采后生理与分子生物学研究
作者简介:张晓菲(1987-) ，女，山东淄博人，在读硕士，主要从事果实采后生理与分子生物学研究
基金资助:
国家自然科学基金项目(31201608);国家现代农业(梨)产业技术体系建设专项(nycytx-29-06);山东省高等学校科技计划项目(J09LC13);山东省优秀中青年科学家科研奖励基金项目(BS2010NY009);青岛农业大学高层次人才启动基金项目(630803);青岛市科技计划项目(621268)

The Gene Cloning and Bioinformatics Analysis of Endo-β-1，4 -glucanas Gene of Chili Pear

Zhang Xiaofei, Zhang Xianan, Wang Ran, Zhang Xinfu, Yang Shaolan

College of Horticulture,Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109,China

Received:2013-03-07 Published:2013-06-28

摘要/Abstract

摘要： 以成熟的莱阳茌梨果实为试材,应用同源克隆和RACE方法从茌梨果肉中克隆到内切-β-1,4-葡聚糖酶基因的一个同源基因cDNA的全长序列,命名为PbEG,其碱基长度为1 971 bp,PbEG的开放阅读框编码493个氨基酸,相对分子量为54.596 1 kDa,等电点为9.14;PbEG编码的蛋白属于糖基水解酶第9家族,不含有跨膜区域但在N-端含有一段信号肽。其编码氨基酸同源性分析表明,茌梨PbEG基因与蓖麻EG基因同源性较高,达到84%,其次是豌豆和葡萄。

关键词: 茌梨, 内切-&beta, -1, 4-葡聚糖酶基因, 生物信息学

Abstract: One full-length cDNA sequence of homologous gene endo-β-1，4-glucanas from Pyrus bretschneideri Rehd． Cv． Chili pear was cloned by polymerase chain reaction ( PCR) and RACE method，which was named as PbEG． The PbEG was 1 971 bp and the open reading frame encoded 493 amino acids，while the estimated molecular weight and isoelectric point of the putative protein were 54． 596 1 kDa and 9． 14． The protein encoded by PbEG belonged to Glycosyl-hydrolases-family-9． There was no membrane-spanning domain in the protein but a signal peptide in the N-terminus． And the deduced amino acids homology analysis indicated that PbEG has a high homology with RcEG(84%).

Key words: Pear, Endo-β-1, 4-glucanas, Bioinformatics

中图分类号:

张晓菲, 张夏南, 王然, 张新富, 杨绍兰. 茌梨果实内切-β-1,4-葡聚糖酶基因的克隆及生物信息学分析[J]. 华北农学报, 2013, 28(3): 53-57. doi: 10.3969/j.issn.1000-7091.2013.03.010.

Zhang Xiaofei, Zhang Xianan, Wang Ran, Zhang Xinfu, Yang Shaolan. The Gene Cloning and Bioinformatics Analysis of Endo-β-1，4 -glucanas Gene of Chili Pear[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2013, 28(3): 53-57. doi: 10.3969/j.issn.1000-7091.2013.03.010.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2013/V28/I3/53

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