茌梨果实内切-&beta;-1,4-葡聚糖酶基因的克隆及生物信息学分析

doi:10.3969/j.issn.1000-7091.2013.03.010

摘要/Abstract

摘要： 以成熟的莱阳茌梨果实为试材,应用同源克隆和RACE方法从茌梨果肉中克隆到内切-β-1,4-葡聚糖酶基因的一个同源基因cDNA的全长序列,命名为PbEG,其碱基长度为1 971 bp,PbEG的开放阅读框编码493个氨基酸,相对分子量为54.596 1 kDa,等电点为9.14;PbEG编码的蛋白属于糖基水解酶第9家族,不含有跨膜区域但在N-端含有一段信号肽。其编码氨基酸同源性分析表明,茌梨PbEG基因与蓖麻EG基因同源性较高,达到84%,其次是豌豆和葡萄。

关键词: 茌梨, 内切-&beta, -1, 4-葡聚糖酶基因, 生物信息学

Abstract: One full-length cDNA sequence of homologous gene endo-β-1，4-glucanas from Pyrus bretschneideri Rehd． Cv． Chili pear was cloned by polymerase chain reaction ( PCR) and RACE method，which was named as PbEG． The PbEG was 1 971 bp and the open reading frame encoded 493 amino acids，while the estimated molecular weight and isoelectric point of the putative protein were 54． 596 1 kDa and 9． 14． The protein encoded by PbEG belonged to Glycosyl-hydrolases-family-9． There was no membrane-spanning domain in the protein but a signal peptide in the N-terminus． And the deduced amino acids homology analysis indicated that PbEG has a high homology with RcEG(84%).

Key words: Pear, Endo-β-1, 4-glucanas, Bioinformatics

中图分类号:

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http://www.hbnxb.net/CN/Y2013/V28/I3/53

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The Gene Cloning and Bioinformatics Analysis of Endo-β-1，4 -glucanas Gene of Chili Pear

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