枣与酸枣的SSR遗传多样性研究

doi:10.7668/hbnxb.2015.02.027

华北农学报 ›› 2015, Vol. 30 ›› Issue (2): 150-155. doi: 10.7668/hbnxb.2015.02.027

枣与酸枣的SSR遗传多样性研究

张鹏飞¹, 尉东峰², 刘亚令³, 宋美玲³, 张茹³, 雍鹏⁴

1. 山西农业大学园艺学院, 山西太谷 030801;
2. 山西省阳高县林业局, 山西阳高 038100;
3. 山西农业大学生命科学学院, 山西太谷 030801;
4. 山西省林业科学研究院, 山西太原 030012

收稿日期:2014-12-17 出版日期:2015-04-28
通讯作者: 雍鹏(1978-),男,山西交城人,工程师,硕士,主要从事枣树良种选育研究。
作者简介:张鹏飞(1979-),男,山西阳城人,讲师,硕士,主要从事果树生长与发育调控研究。
基金资助:
山西省科技攻关项目(20110311012-1)

Genetic Diversity of Ziziphus jujuba Mill.and Z.jujuba var. spinosa Based on SSR Markers

ZHANG Peng-fei¹, YU Dong-feng², LIU Ya-ling³, SONG Mei-ling³, ZHANG Ru³, YONG Peng⁴

1. College of Horticulture, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, China;
2. Forestry Bureau in Yanggao County, Yanggao 038100, China;
3. College of Life Science, Shanxi Agricultural University, Taigu 030801, China;
4. Shanxi Academy of Forestry, Taiyuan 030012, China

Received:2014-12-17 Published:2015-04-28

摘要/Abstract

摘要： 为了探讨枣与酸枣资源的遗传多样性以及两者的亲缘关系,采用7对SSR引物,对16份枣品种(系)和17份酸枣的遗传多样性进行分析。结果表明:16份枣样品共扩增出56个等位基因,有效等位基因数(Ne)为3.798~10.000,平均为6.953,Shannon's信息指数(I)为1.984,期望杂合度(He)为0.837;17份酸枣样品扩增后共检测出73个等位基因,等位基因的有效数目(Ne)为3.273~11.840,平均为7.398,Shannon's信息指数(I)为2.105,期望杂合度(He)为0.843;枣和酸枣的遗传多样性都很丰富,酸枣的遗传多样性水平高于枣;GenAlEx分析得出,枣和酸枣居群种间遗传分化系数(F_st)为0.055,居群种间基因流(Nm)平均值为4.295,说明居群间基因交流比较频繁。NTSYSpc聚类分析表明,SSR分子标记可以将枣和酸枣划分为枣类、酸枣类和过渡类3个类群。

关键词: 枣, 酸枣, SSR, 遗传多样性

Abstract: To know the genetic diversity and the genetic relationship of Ziziphus jujuba Mill. and Z.jujuba var.spinosa germplasm resources, 7 pairs of SSR molecular markers were used to analyze the genetic diversity of 16 Ziziphus jujuba Mill.and 17 Z.jujuba var. spinosa in this experiment.The results showed that 56 alleles were amplified in 16 jujbe samples, and number of effective alleles (Ne)ranged from 3.798 to 10.000 and averaged at 6.953, Shannon's information index (I) was 1.984, expected heterozygosity (He) was 0.837.Moreover, 73 alleles were amplified in 17 wild jujube samples, Ne ranged from 3.273 to 11.840 and averaged at 7.398, I was 2.105, He was 0.843.So, genetic diversity of both of jujube and wild jujube were rich, and the wild jujube level of genetic diversity was higher than that of jujube.And, the GenALEx analysis showed that gene flow between populations exchanged frequently, and population genetic differentiation percentage (F_st) of jujube and wild jujube was 0.055, the average value of gene flow among populations (Nm) was 4.295.Furthermore, NTSYSpc cluster analysis showed that jujube and wild jujube could be divided into three groups of jujube, wild jujube and transition group using SSR molecular markers.

Key words: Ziziphus jujuba Mill., Z.jujuba var.spinosa, SSR, Genetic relationship

中图分类号:

S665.1

张鹏飞, 尉东峰, 刘亚令, 宋美玲, 张茹, 雍鹏. 枣与酸枣的SSR遗传多样性研究[J]. 华北农学报, 2015, 30(2): 150-155. doi: 10.7668/hbnxb.2015.02.027.

ZHANG Peng-fei, YU Dong-feng, LIU Ya-ling, SONG Mei-ling, ZHANG Ru, YONG Peng. Genetic Diversity of Ziziphus jujuba Mill.and Z.jujuba var. spinosa Based on SSR Markers[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2015, 30(2): 150-155. doi: 10.7668/hbnxb.2015.02.027.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2015/V30/I2/150

参考文献

[1] 曲泽洲,王永蕙.中国果树志-枣卷[M].北京:中国林业出版社,1993.
[2] 刘孟军,汪民.中国枣种质资源[M].北京:中国林业出版社,2009.
[3] 张春梅,殷晓,李新岗,等.黄河沿岸酸枣遗传多样性研究[J].西北农林科技大学学报:自然科学版,2013,41(12):107-112,119.
[4] 刘孟军.枣属植物分类学研究进展[J].园艺学报,1999,26(5):302-308.
[5] 彭建营,束怀瑞,孙仲序,等.中国枣种质资源的RAPD分析[J].园艺学报,2000,27(3):171-176.
[6] 赵锦,刘孟军.枣树品种、品系及其近缘种的RAPD分析[J].中国农业科学,2003,36(5):590-594.
[7] 贺润平,渠云芳,雷海英.枣树不同品种遗传多样性的RAPD分析[J].中国农学通报,2010,26(22):50-53.
[8] 刘平,彭建营,彭士琪,等.应用RAPD标记技术探讨枣与酸枣的分类学关系[J].林业科学,2005,41(2):182-185.
[9] 王永康,田建保,王永勤,等.枣树品种品系的AFLP分析[J].果树学报,2007,24(2):146-150.
[10] 谢永波,冯殿齐,赵进红,等.基于AFLP技术的枣树主栽品种亲缘关系的研究[J].中国农学通报,2014,30(13):137-141.
[11] 陈浩东,肖才升,李庠,等.基于 SSR 标记的短季棉品种 DNA 指纹图谱构建及遗传多样性分析[J].华北农学报,2014,29(4):98-104.
[12] 许兰杰,侯起岭,侯春雨,等.不同抗蚜性小麦品种(系)的遗传多样性 SSR 标记分析[J].华北农学报,2014,29(5):119-124.
[13] 马庆华,王贵禧,梁丽松.枣选择性扩增微卫星体系的建立及优化[J].中国农业科学,2010,43(2):371-379.
[14] 麻丽颖,孔德仓,刘华波,等.36份枣品种SSR指纹图谱的构建[J].园艺学报,2012,39(4):647-654.
[15] 殷晓,张春梅,李新岗,等.陕北枣品种群遗传结构的SSR分析[J].西北农林科技大学学报:自然科学版,2014,42(6):152-160,167.
[16] Rogers S O,Bendich A J.Extraction of DNA from milligram amounts of fresh,herbarium and mummified plant tissues[J].Plant Molecular Biology,1985,5(2):69-76.
[17] Peakall R,Smouse P E.GENALEX 6:genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research[J].Molecular Ecology Notes,2006,6(1):288-295.
[18] Slatkin M,Barton N H.A comparison of three indirect methods for estimating average levels of gene flow[J].Evolution,1989,43:1349-1368.
[19] Rohlf F J.NTSYS-PC:Numerical taxonomy and multivariate analysis system version 1.80[M].Setauket,New York:Distribution by Exeter Software,1994.
[20] Doebley J F,Gaut B S,Smith B D.The molecular genetics of crop domestication[J].Cell,2006,127(7):1309-1321.
[21] Wang H,Nussbaum-Wagler T,Li B L,et al.The origin of the naked grains of maize[J].Nature,2005,436(751):714-719.
[22] 李瑞环,李新岗,黄建,等.枣和酸枣亲缘关系的RAPD分析[J].果树学报,2012,29(3):366-373.
[23] 殷晓.基于SSR标记的中国枣遗传多样性研究[D].杨凌:西北农林科技大学,2013.
[24] 柴美清,原佳敏.SSR分子标记在玉米种质研究中的应用[J].山西农业科学,2011,39(9):1017-1019.
[25] 李俊芳,孙世贤,王守才.国家玉米主产区预试品种的SSR分析Ⅱ.预试品种的遗传多样性[J].玉米科学,2007,15(1):16-20.
[26] 李莉,彭建营,白瑞霞.中国枣属植物亲缘关系的SRAP分析[J].中国农业科学,2009,42(5):1713-1719.
[27] 冯宝春,陈学森,杨红花,等.蒙山脆枣与枣及酸枣亲缘关系的研究[J].石河子大学学报:自然科学版,2004,22(4):311-315.

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[2]	凌晨, 赵洪, 颜军, 马莹雪, 冯艳芳, 张靖立, 李波, 邓超, 徐振江. 基于SSR标记的莴苣品种鉴定体系的建立及应用[J]. 华北农学报, 2022, 37(4): 34-44.
[3]	李曼, 史晓蕾, 邸锐, 刘志芳, 孟庆民, 付才, 杨春燕, 王冬梅, 张孟臣, 张洁, 闫龙. 大豆长片段插入/缺失标记的开发与应用[J]. 华北农学报, 2022, 37(1): 18-26.
[4]	张馨方, 张树航, 李颖, 郭燕, 王广鹏. 基于SSR标记构建燕山板栗核心种质[J]. 华北农学报, 2021, 36(S1): 31-38.
[5]	董丽, 石海春, 赵长云, 余学杰, 柯永培. 玉米矮秆突变体K718d的遗传鉴定[J]. 华北农学报, 2021, 36(6): 71-77.
[6]	李靓, 于卓, 于肖夏, 杨东升, 卢倩倩, 李景伟, 李佳奇, 刘宇飞. 6个马铃薯新品系的细胞学及SSR分析[J]. 华北农学报, 2021, 36(2): 74-80.
[7]	冯俊彦, 康乐, 郎涛, 张聪, 李明, 赵珊, 蒲志刚. 基于SCoT分子标记的甘薯及其野生种遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2021, 36(1): 18-26.
[8]	伊六喜, 萨如拉, 王树彦, 李志伟, 斯钦巴特尔, 李强. 亚麻木酚素含量的SSR关联分析[J]. 华北农学报, 2021, 36(1): 63-70.
[9]	付静, 崔林开, 付伟, 乔莉娟. 河南省烟草疫霉遗传多样性与遗传结构的RAPD分析[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 342-346.
[10]	张久坤, 齐阳阳, 李立竹, 宁哓霜, 刘志华, 姜振峰, 李文滨. 利用BSA法定位大豆全基因组株高QTL及候选基因分析[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 1-10.
[11]	魏薇, 贾彦丽, 吴硕, 智福军. 水分胁迫下枣裂果的全长转录组分析[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 63-71.
[12]	杨振立, 王广鹏, 张树航, 郭燕, 张馨方, 李颖. 燕山板栗15个花序相关表型性状遗传多样性研究[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 93-101.
[13]	高源, 王大江, 王昆, 李连文, 朴继成. 基于叶绿体片段序列的苹果属植物遗传多样性[J]. 华北农学报, 2020, 35(6): 42-51.
[14]	吕冰冰, 代畅, 彭正松, YAMAMOTO Naoki, 吴一超, 魏淑红, 杨在君. 一组新的小麦EST-SSR标记开发及其在遗传图谱构建中的应用[J]. 华北农学报, 2020, 35(4): 57-63.
[15]	易红梅, 任洁, 王璐, 王蕊, 葛建镕, 王凤格, 赵久然, 徐明良. 2014-2019年国家玉米区域试验参试组合DNA指纹检测及遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2020, 35(3): 87-93.

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