水稻直立穗突变体<em>ep7</em>的鉴定及其候选基因分析

doi:10.7668/hbnxb.2014.04.008

华北农学报 ›› 2014, Vol. 29 ›› Issue (4): 44-48. doi: 10.7668/hbnxb.2014.04.008

所属专题： 水稻；生物技术；

水稻直立穗突变体ep7的鉴定及其候选基因分析

朱海涛, 柯善文, 冯小龙, 邹龙海, 曾秀瑜, 张向前

华南农业大学农学院, 广东省植物分子育种重点实验室, 广东广州 510642

收稿日期:2014-05-11 出版日期:2014-08-28
通讯作者: 张向前（1975-），男，河南汝州人，副教授，博士，主要从事植物分子育种研究。
作者简介:朱海涛（1978-），男，广东梅州人，实验师，硕士，主要从事植物分子育种研究。
基金资助:
国家自然科学基金项目（30900884）；广东省自然科学基金项目（9451064201003804）；高等学校博士学科点专项科研基金项目（20094404120011）

Identification of an Erect Panicle Mutant ep7 in Rice and Analysis of the Candidate Gene

ZHU Hai-tao, KE Shan-wen, FENG Xiao-long, ZOU Long-hai, ZENG Xiu-yu, ZHANG Xiang-qian

Guangdong Key Laboratory of Plant Molecular Breeding, College of Agronomy, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China

Received:2014-05-11 Published:2014-08-28

摘要/Abstract

摘要： 在粳稻中花11的组培后代中发现1个突变体 ep7，其稻穗直立，且株高、有效穗、粒长和千粒质量等均显著降低；利用该突变体与籼稻华粳籼74 构建F₂ 分离群体对突变体进行遗传分析，结果表明，该突变表型由1对核隐性基因控制，并用分子标记将该基因定位于第7染色体长臂上，命名为 EP7，其与InDel标记ID5198-2和ID4309-1的遗传距离分别为0.7 cM 和0.5 cM；生物信息学和序列多态性分析表明，可能是大片段的DNA插入造成候选基因功能缺失，导致该突变表型的产生。

关键词: 水稻, 穗部性状, 直立穗突变体, 基因定位

Abstract: A rice mutant erect panicle 7(ep7),obtained from tissue culture of a japonica variety Zhonghua 11,showed a dense and erect panicle and significantly reduced plant height,effective panicle number per plant,grain length and 1000-grain weight.The genetic analysis of a F₂ segregation population derived from the cross between ep7 and an indica variety Huajingxian 74 demonstrated that the mutant phenotype was controlled by a single recessive gene on the long arm of chromosome 7,termed EP7,between two InDel markers ID5198-2 and ID4309-1 with 0.7 cM and 0.5 cM genetic distance,respectively.Morever,bioinformatic analysis and sequence polymorphorism revealed that the mutant phenotype might be caused by a large DNA fragment insertion in EP7 gene.

Key words: Rice, Panicle trait, Erect panicle mutant, Gene mapping

中图分类号:

朱海涛, 柯善文, 冯小龙, 邹龙海, 曾秀瑜, 张向前. 水稻直立穗突变体ep7的鉴定及其候选基因分析[J]. 华北农学报, 2014, 29(4): 44-48. doi: 10.7668/hbnxb.2014.04.008.

ZHU Hai-tao, KE Shan-wen, FENG Xiao-long, ZOU Long-hai, ZENG Xiu-yu, ZHANG Xiang-qian. Identification of an Erect Panicle Mutant ep7 in Rice and Analysis of the Candidate Gene[J]. journal1, 2014, 29(4): 44-48. doi: 10.7668/hbnxb.2014.04.008.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2014/V29/I4/44

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