基于高通量芯片的小麦抗赤霉病基因高效KASP标记开发和育种应用

doi:10.7668/hbnxb.20195775

摘要/Abstract

摘要：

小麦赤霉病是严重威胁小麦安全生产的真菌性病害,利用分子标记辅助选择聚合抗病基因已成为当前抗赤霉病育种的快速有效策略。为建立小麦抗赤霉病基因的高通量筛选体系、创制抗赤霉病新种质并提升四川小麦赤霉病抗性,利用100K SNP芯片对14个四川小麦品种(系)和3个抗赤霉病种质进行全基因组基因型分析。基于已报道的主效抗赤霉病基因Fhb2、Fhb4、Fhb5的遗传连锁区间,筛选获得与目标基因连锁(Fhb2、Fhb4)或共分离(Fhb5)的SNP位点,并据此开发特异性KASP标记。结果显示,基于100K SNP芯片,17份小麦品种(系)按遗传相似性可以划分为两大类:含有北方小麦遗传背景的抗病种质NMAS070和NMAS069独立成簇,与四川小麦品种(系)间亲缘关系较远;其余15份品种(系)聚为一类并进一步分为2个亚类。功能基因检测揭示抗病亲本携带赤霉病抗性位点,而农艺亲本则富集产量与品质相关优异等位变异。通过SNP位点筛选,在Fhb2、Fhb4连锁区间及Fhb5共分离区间内共鉴定出8个关键SNP位点,据此成功开发4对Fhb2、2对Fhb4和2对Fhb5的特异性KASP标记。验证试验表明,所有KASP标记均能实现精准分型,并已有效应用于赤霉病抗病分子育种实践。开发的小麦抗赤霉病基因Fhb2、Fhb4、Fhb5高效KASP标记体系为小麦赤霉病抗性改良提供了重要技术支撑,对提升西南麦区小麦品种赤霉病抗性具有重要应用价值。

关键词: 小麦, 小麦赤霉病, KASP标记, 分子标记选择, 抗赤霉病育种

Abstract:

Fusarium head blight(FHB)is a devastating fungal disease that seriously threatens the safety of wheat production.Marker-assisted selection(MAS)and pyramiding of resistance genes represent efficient strategies for FHB-resistant breeding.To establish a high-throughput screening system for FHB resistance genes and enhance wheat resistance in Sichuan Province,we performed genome-wide genotyping using a 100K SNP array on 14 Sichuan wheat varieties(lines)along with three FHB-resistant genetic materials.Based on the reported genetic linkage intervals of major FHB resistance genes(Fhb2,Fhb4,Fhb5),we identified SNPs co-segregating with Fhb5 or linked to Fhb2,Fhb4,and subsequently developed kompetitive allele-specific PCR(KASP)markers.Results showed that the genetic relationship of 17 wheat varieties(lines)could be clustered into two major groups:two northern wheat-derived resistant materials(NMAS070 and NMAS069)formed an independent cluster distinct from the Sichuan varieties(lines)while the remaining 15 varieties(lines)were clustered together and subdivided into two subgroups.Functional gene profiling revealed FHB-resistant parents carried superior resistance loci,whereas agronomic parents harbored favorable alleles for yield and quality traits.Through SNP screening,we identified 8 critical SNPs within the linkage intervals of Fhb2,Fhb4 and the co-segregation region of Fhb5.These SNPs enabled the successful development of 4,2,and 2 high-specificity KASP marker systems for Fhb2,Fhb4 and Fhb5,respectively.Validation experiments confirmed all KASP markers achieved precise genotyping and were effectively implemented in molecular breeding for FHB-resistance.This study established a high-efficiency KASP marker system for Fhb2,Fhb4 and Fhb5,providing a robust technical platform for improving FHB resistance breeding of wheat varieties in Southwest China.

Key words: Wheat, Fusarium head blight(FHB), KASP marker, Marker selection, FHB-resistance breeding

中图分类号:

邓清燕, 罗江陶, 郑建敏, 蒲宗君. 基于高通量芯片的小麦抗赤霉病基因高效KASP标记开发和育种应用[J]. 华北农学报, 2025, 40(4): 175-184. doi: 10.7668/hbnxb.20195775.

DENG Qingyan, LUO Jiangtao, ZHENG Jianmin, PU Zongjun. Development and Application of High Efficiency KASP Markers of Wheat Fusarium Head Blight Resistance Genes Based on High Throughput Chip[J]. Acta Agriculturae Boreali-Sinica, 2025, 40(4): 175-184. doi: 10.7668/hbnxb.20195775.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2025/V40/I4/175

图/表 8

参考文献 38

[1]	马忠华, 陈云, 尹燕妮. 小麦赤霉病流行成灾原因分析及防控对策探讨[J]. 中国科学基金, 2020, 34(4):464-469.doi:10.16262/j.cnki.1000-8217.2020.04.012.
	Ma Z H, Chen Y, Yin Y N. Epidemiological analysis and management strategies of Fusarium head blight of wheat[J]. Bullein of National Natural Science Foundation of China, 2020, 34(4):464-469.
[2]	张爱民, 阳文龙, 李欣, 孙家柱. 小麦抗赤霉病研究现状与展望[J]. 遗传, 2018, 40(10):858-873.doi:10.16288/j.yczz.18-252.
	Zhang A M, Yang W L, Li X, Sun J Z. Current status and perspective on research against Fusarium head blight in wheat[J]. Hereditas, 2018, 40(10):858-873.
[3]	段亚冰, 周明国. 我国小麦赤霉病流行与化学防控现状及控病降毒关键技术理论创新与应用[J]. 现代农药, 2024, 23(2):13-21.doi:10.3969/j.issn.1671-5284.2024.02.002.
	Duan Y B, Zhou M G. The current status of wheat scab epidemic and chemical control and theoretical innovation and application of key technologies for disease control and mycotoxin reduction in China[J]. Modern Agrochemicals, 2024, 23(2):13-21.
[4]	Przemieniecki S W, Kurowski T P, Korzekwa K. Chemotypes and geographic distribution of the Fusarium graminearum species complex[J]. Environmental Biotechnology, 2014, 10(2):45-54.doi:10.14799/ebms241.
[5]	张立勇, 夏明聪, 徐文, 王琦, 张洁, 孙润红, 潘娅梅, 陈瑞雪, 吴坤, 杨丽荣. 拮抗小麦赤霉病内生细菌YB-144的鉴定及其对DON的影响[J]. 华北农学报, 2020, 35(6):172-179.doi:10.7668/hbnxb.20191619.
	Zhang L Y, Xia M C, Xu W, Wang Q, Zhang J, Sun R H, Pan Y M, Chen R X, Wu K, Yang L R. Identification of antagonistic endophytic bacterium YB-144 strain from Fusarium head blight against and its effect on DON[J]. Acta Agriculturae Boreali-Sinica, 2020, 35(6):172-179.
[6]	高先悦, 高淑敏, 刘少杰, 张莉, 于金凤. 山东省小麦赤霉病菌的种群组成及毒素化学型分析[J]. 华北农学报, 2017, 32(S1):37-42.doi:10.7668/hbnxb.2017.S1.007.
	Gao X Y, Gao S M, Liu S J, Zhang L, Yu J F. Analysis on the species composition and mycotoxin chemotypes of wheat Fusarium head blight in Shandong Province[J]. Acta Agriculturae Boreali-Sinica, 2017, 32(S1):37-42.
[7]	Jia H Y, Zhou J Y, Xue S L, Li G Q, Yan H S, Ran C F, Zhang Y D, Shi J X, Jia L, Wang X, Luo J, Ma Z Q. A journey to understand wheat Fusarium head blight resistance in the Chinese wheat Landrace Wangshuibai[J]. The Crop Journal, 2018, 6(1):48-59.doi:10.1016/j.cj.2017.09.006.
[8]	Cuthbert P A, Somers D J, Thomas J, Cloutier S, Brulé-Babel A. Fine mapping Fhb1,a major gene controlling Fusarium head blight resistance in bread wheat(Triticum aestivum L.)[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2006, 112(8):1465-1472.doi:10.1007/s00122-006-0249-7.
[9]	Xue S L, Li G Q, Jia H Y, Xu F, Lin F, Tang M Z, Wang Y, An X, Xu H B, Zhang L X, Kong Z X, Ma Z Q. Fine mapping Fhb4,a major QTL conditioning resistance to Fusarium infection in bread wheat(Triticum aestivum L.)[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2010, 121(1):147-156.doi:10.1007/s00122-010-1298-5.
[10]	Qi L L, Pumphrey M O, Friebe B, Chen P D, Gill B S. Molecular cytogenetic characterization of alien introgressions with gene Fhb3 for resistance to Fusarium head blight disease of wheat[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2008, 117(7):1155-1166.doi:10.1007/s00122-008-0853-9.
[11]	Zhang F P, Zhang H J, Liu J L, Ren X M, Ding Y P, Sun F Y, Zhu Z Z, He X, Zhou Y, Bai G H, Ni Z F, Sun Q X, Su Z Q. Fhb9,a major QTL for Fusarium head blight resistance improvement in wheat[J]. Journal of Integrative Agriculture, 2024.doi:10.1016/j.jia.2024.03.045.
[12]	刘方方, 张琪琪, 万映秀, 曹文昕, 李耀, 李炎, 张平治. 分子标记辅助选育抗赤霉病小麦新品系[J]. 植物遗传资源学报, 2023, 24(6):1805-1815.doi:10.13430/j.cnki.jpgr.20230523001.
	Liu F F, Zhang Q Q, Wan Y X, Cao W X, Li Y, Li Y, Zhang P Z. Molecular marker-assisted selection of wheat lines with resistance to Fusarium head blight[J]. Journal of Plant Genetic Resources, 2023, 24(6):1805-1815.
[13]	马红勃, 刘东涛, 冯国华, 王静, 朱雪成, 张会云, 刘静, 刘立伟, 易媛. 黄淮麦区Fhb1基因的育种应用[J]. 作物学报, 2022, 48(3):747-758.doi:10.3724/SP.J.1006.2022.11019.
	Ma H B, Liu D T, Feng G H, Wang J, Zhu X C, Zhang H Y, Liu J, Liu L W, Yi Y. Application of Fhb1 gene in wheat breeding programs for the Yellow-Huai Rivers valley winter wheat zone of China[J]. Acta Agronomica Sinica, 2022, 48(3):747-758.
[14]	张一铎, 李国强, 孔忠新, 王玉泉, 李小利, 茹振钢, 贾海燕, 马正强. 基因聚合选育抗赤霉病小麦新品系百农4299[J]. 作物学报, 2022, 48(9):2221-2227.doi:10.3724/SP.J.1006.2022.11085.
	Zhang Y D, Li G Q, Kong Z X, Wang Y Q, Li X L, Ru Z G, Jia H Y, Ma Z Q. Breeding of FHB-resistant wheat line Bainong 4299 by gene pyramiding[J]. Acta Agronomica Sinica, 2022, 48(9):2221-2227.
[15]	刘建军, 李豪圣, 陈雪燕, 贾海燕, 翟胜男, 郭军, 程敦公, 刘成, 曹新有, 刘爱峰, 宋健民, 刘佳, 楚秀生, 马正强. 利用分子标记辅助选择创制抗赤霉病小麦新品系[J]. 山东农业科学, 2021, 53(5):74-79.doi:10.14083/j.issn.1001-4942.2021.05.012.
	Liu J J, Li H S, Chen X Y, Jia H Y, Zhai S N, Guo J, Cheng D G, Liu C, Cao X Y, Liu A F, Song J M, Liu J, Chu X S, Ma Z Q. Creation of new wheat lines with Fusarium head blight resistance through molecular marker-assisted selection[J]. Shandong Agricultural Sciences, 2021, 53(5):74-79.
[16]	李静静, 史娜溶, 杨孟于, 王金鹏, 孙道杰, 冯毅, 张玲丽. 抗赤霉病小麦优异新种质的分子标记辅助选择[J]. 麦类作物学报, 2020, 40(3):261-269.doi:10.7606/j.issn.1009-1041.2020.03.01.
	Li J J, Shi N R, Yang M Y, Wang J P, Sun D J, Feng Y, Zhang L L. Marker-assisted selection for Fusarium head blight resistance of wheat germplasms with excellent agronomy traits and seed quality[J]. Journal of Triticeae Crops, 2020, 40(3):261-269.
[17]	Su Z Q, Bernardo A, Tian B, Chen H, Wang S, Ma H X, Cai S B, Liu D T, Zhang D D, Li T, Trick H, St Amand P, Yu J M, Zhang Z Y, Bai G H. A deletion mutation in TaHRC confers Fhb1 resistance to Fusarium head blight in wheat[J]. Nature Genetics, 2019, 51(7):1099-1105.doi:10.1038/s41588-019-0425-8.
[18]	Li G Q, Zhou J Y, Jia H Y, et al. Mutation of a histidine-rich calcium-binding-protein gene in wheat confers resistance to Fusarium head blight[J]. Nature Genetics, 2019, 51(7):1106-1112.doi:10.1038/s41588-019-0426-7.
[19]	Wang H W, Sun S L, Ge W Y, et al. Horizontal gene transfer of Fhb7 from fungus underlies Fusarium head blight resistance in wheat[J]. Science, 2020, 368(6493):eaba5435.doi:10.1126/science.aba5435.
[20]	Semagn K, Babu R, Hearne S, Olsen M. Single nucleotide polymorphism genotyping using Kompetitive Allele Specific PCR(KASP):overview of the technology and its application in crop improvement[J]. Molecular Breeding, 2014, 33(1):1-14.doi:10.1007/s11032-013-9917-x.
[21]	赵传超, 丛森, 梁思怡, 谢华斌, 陆文宇, 肖武名, 黄明, 郭涛, 王加峰. 水稻抗稻瘟病基因Pi2的KASP标记开发与应用[J]. 华南农业大学学报, 2023, 44(5):725-734.doi:10.7671/j.issn.1001-411X.202304026.
	Zhao C C, Cong S, Liang S Y, Xie H B, Lu W Y, Xiao W M, Huang M, Guo T, Wang J F. Development and application of KASP marker for rice blast resistance gene Pi2[J]. Journal of South China Agricultural University, 2023, 44(5):725-734.
[22]	李玮, 孔淑鑫, 宋国琦, 李玉莲, 张淑娟, 张荣志, 高洁, 李吉虎, 樊庆琦, 李根英. 31份小麦材料中抗旱基因的KASP检测[J]. 麦类作物学报, 2023, 43(10):1241-1247.doi:10.7606/j.issn.1009-1041.2023.10.03.
	Li W, Kong S X, Song G Q, Li Y L, Zhang S J, Zhang R Z, Gao J, Li J H, Fan Q Q, Li G Y. Analysis of drought resistant genes in 31 wheat breeding materials by KASP marker[J]. Journal of Triticeae Crops, 2023, 43(10):1241-1247.
[23]	钟婷婷, 郭诗芬, 卢文斌, 肖钢. 甘蓝型油菜抗根肿病KASP标记开发和利用[J]. 华北农学报, 2021, 36(4):184-190.doi:10.7668/hbnxb.20192042.
	Zhong T T, Guo S F, Lu W B, Xiao G. Development and utilization of KASP marker for Brassica napus clubroot resistance breeding[J]. Acta Agriculturae Boreali-Sinica, 2021, 36(4):184-190.
[24]	张强, 张涛, 常晓轲, 韩娅楠, 程志芳, 刘卫, 王彬, 姚秋菊. 一个辣椒胞质雄性不育SCAR标记的KASP转化及其应用[J]. 华北农学报, 2019, 34(5):93-98.doi:10.7668/hbnxb.20190131.
	Zhang Q, Zhang T, Chang X K, Han Y N, Cheng Z F, Liu W, Wang B, Yao Q J. Transformation and application of one molecular marker from SCAR to KASP in pepper CMS[J]. Acta Agriculturae Boreali-Sinica, 2019, 34(5):93-98.
[25]	张敬敬, 张海英, 潘秀清, 许勇, 任毅, 高秀瑞, 李冰, 史宇凡, 党继革, 杨明珠, 武彦荣. 河北省130份西瓜品种与种质资源抗病基因KASP检测分析[J]. 华北农学报, 2019, 34(2):110-116.doi:10.7668/hbnxb.201751582.
	Zhang J J, Zhang H Y, Pan X Q, Xu Y, Ren Y, Gao X R, Li B, Shi Y F, Dang J G, Yang M Z, Wu Y R. KASP assays of disease resistance genes from 130 watermelon varieties and germplasms in Hebei Province[J]. Acta Agriculturae Boreali-Sinica, 2019, 34(2):110-116.
[26]	Ma Z Q, Sorrells M E. Genetic analysis of fertility restoration in wheat using restriction fragment length polymorphisms[J]. Crop Science, 1995, 35(4):1137-1143.doi:10.2135/cropsci1995.0011183x003500040037x.
[27]	Li H. Aligning sequence reads,clone sequences and assembly contigs with BWA-MEM[J]. arXiv, 2013,1303:3997.doi:10.48550/arXiv.1303.3997.
[28]	Bradbury P J, Zhang Z W, Kroon D E, Casstevens T M, Ramdoss Y, Buckler E S. TASSEL:software for association mapping of complex traits in diverse samples[J]. Bioinformatics, 2007, 23(19):2633-2635.doi:10.1093/bioinformatics/btm308.
[29]	Ma S W, Wang M, Wu J H, Guo W L, Chen Y M, Li G W, Wang Y P, Shi W M, Xia G M, Fu D L, Kang Z S, Ni F. WheatOmics:a platform combining multiple omics data to accelerate functional genomics studies in wheat[J]. Molecular Plant, 2021, 14(12):1965-1968.doi:10.1016/j.molp.2021.10.006.
[30]	Su Z Q, Jin S J, Zhang D D, Bai G H. Development and validation of diagnostic markers for Fhb1 region,a major QTL for Fusarium head blight resistance in wheat[J]. Theoretical and Applied Genetics, 2018, 131(11):2371-2380.doi:10.1007/s00122-018-3159-6.
[31]	张善磊, 王卫军, 吕春华, 刘晓飞, 赖尚科, 崔小平. 赤霉病抗性基因Fhb1和Fhb7在江苏省淮北小麦新品系中的分布研究[J]. 北方农业学报, 2021, 49(5):93-99.doi:10.12190/j.issn.2096-1197.2021.05.13.
	Zhang S L, Wang W J, Lyu C H, Liu X F, Lai S K, Cui X P. Distribution of Fusarium head blight resistance genes Fhb1 and Fhb7 in novel wheat lines from Huaibei,Jiangsu Province[J]. Journal of Northern Agriculture, 2021, 49(5):93-99.
[32]	李正玲, 张煜, 韩留鹏, 王永霞, 方宇辉, 胡琳, 许为钢. 黄淮南部麦区小麦抗赤霉病育种技术体系优化[J]. 河南农业科学, 2022, 51(2):28-36.doi:10.15933/j.cnki.1004-3268.2022.02.004.
	Li Z L, Zhang Y, Han L P, Wang Y X, Fang Y H, Hu L, Xu W G. Optimization of wheat breeding technology system for resistance to Fusarium head blight in south Huang-Huai wheat region[J]. Journal of Henan Agricultural Sciences, 2022, 51(2):28-36.
[33]	代旭冉, 黄义文, 李腾, 邓云, 苏研, 买春艳, 于立强, 于广军, 李辉利, 刘宏伟, 杨丽, 周阳, 张宏军, 李洪杰. 利用Fhb1基因分子标记辅助回交育种法改良黄淮冬小麦赤霉病抗性[J]. 麦类作物学报, 2021, 41(9):1081-1089.doi:10.7606/j.issn.1009-1041.2021.09.04.
	Dai X R, Huang Y W, Li T, Deng Y, Su Y, Mai C Y, Yu L Q, Yu G J, Li H L, Liu H W, Yang L, Zhou Y, Zhang H J, Li H J. Improvement of resistance to Fusarium head blight by Fhb1 molecular marker-assisted backcrossing in the Huang-Huai River valley winter wheat region[J]. Journal of Triticeae Crops, 2021, 41(9):1081-1089.
[34]	张志清, 郑有良, 魏育明, 吴卫, 周永红, 刘登才, 兰秀锦. 四川主栽小麦品种遗传多样性的SSR标记研究[J]. 麦类作物学报, 2002, 22(2):5-9.doi:10.3969/j.issn.1009-1041.2002.02.002.
	Zhang Z Q, Zheng Y L, Wei Y M, Wu W, Zhou Y H, Liu D C, Lan X J. Analysis on genetic diversity among Sichuan wheat cultivars based on SSR markers[J]. Journal of Triticeae Crops, 2002, 22(2):5-9.
[35]	Deng Q Y, Kong Z X, Wu X X, Ma S W, Yuan Y, Jia H Y, Ma Z Q. Cloning of a COBL gene determining brittleness in diploid wheat using a MapRseq approach[J]. Plant Science, 2019,285:141-150.doi:10.1016/j.plantsci.2019.05.011.
[36]	高德荣, 胡文静, 张勇, 别同德, 吕国峰, 蒋正宁, 程顺和. 小麦抗赤霉病遗传育种研究进展及思考[J]. 长江大学学报(自然科学版), 2021, 18(5):66-77.doi:10.16772/j.cnki.1673-1409.2021.05.006.
	Gao D R, Hu W J, Zhang Y, Bie T D, Lyu G F, Jiang Z N, Cheng S H. Research progress and thinking on genetics and breeding of resistance to Fusarium head blight in wheat[J]. Journal of Yangtze University(Natural Science Edition), 2021, 18(5):66-77.
[37]	陆成彬, 程顺和, 吴荣林, 胡云花, 范金平, 王朝顺, 张伯桥. 扬麦13抗赤霉病品系的分子标记辅助选育[J]. 麦类作物学报, 2010, 30(6):1058-1064.doi:10.7606/j.issn.1009-1041.2010.06.014.
	Lu C B, Cheng S H, Wu R L, Hu Y H, Fan J P, Wang C S, Zhang B Q. Breeding the lines with resistance to fusarium head blight of wheat cultivar Yangmai 13 by molecular marker assisted selection[J]. Journal of Triticeae Crops, 2010, 30(6):1058-1064.
[38]	Zhang Y D, Yang Z B, Ma H C, Huang L Y, Ding F, Du Y Y, Jia H Y, Li G Q, Kong Z X, Ran C F, Gu Z Z, Ma Z Q. Pyramiding of Fusarium head blight resistance quantitative trait loci,Fhb1,Fhb4,and Fhb5,in modern Chinese wheat cultivars[J]. Frontiers in Plant Science, 2021,12:694023.doi:10.3389/fpls.2021.694023.

性状 Trait type	基因/QTL Gene/QTL	NMAS069	NMAS070	NMAS071	川麦625 Chuanmai 625	21pin3-9	川麦704 Chuanmai 704	21pin4-3	21pin6-5	川麦614 Chuanmai 614	川麦618 Chuanmai 618	川麦620 Chuanmai 620	川麦623 Chuanmai 623	川麦702 Chuanmai 702	川麦914 Chuanmai 914	绵麦60 Mianmai 60	内麦175 Neimai 175	蜀麦1925 Shumai 1925
赤霉病	Fhb1^†	+	+	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Fusarium	Fhb2^†	+	-	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
head blight	Fhb4^†	+	+	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
	Fhb5^†	-	+	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
	Qfhb.caas-3BL	-	-	-	-	+	+	-	-	+	+	-	+	+	+	-	+	-
	QFhb.hbaas-5AS	-	-	-	+	+	-	+	-	-	-	+	-	-	-	-	+	-
	QFhb.hbaas-5AL	-	-	+	-	-	-	+	-	+	-	-	-	+	+	-	-	-
	QFhb.caas-5AL	+	-	-	+	-	+	-	+	+	+	+	+	+	+	+	-	+
千粒质量	TaSus2-2B	高	低	高	高	高	低	高	高	低	低	低	低	低	高	高	高	高
1000-grain	Tabas1	高	低	低	高	低	高	低	高	高	高	高	高	高	高	高	低	高
weight	TaGS5-A1	杂合	高	低	高	低	高	高	高	高	高	高	高	高	高	高	低	高
	TaGW2-6A	高	高	高	高	高	高	高	NA	高	高	高	高	高	高	NA	NA	高
	TaCwi-A1	低	低	高	高	低	高	高	高	高	高	高	高	高	高	高	高	高
	TaT6P	低	低	低	低	低	高	高	高	高	高	低	高	低	低	低	低	低
品质	Glu-B3h	-	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Quality	TaLCYE-B1	低	高	低	高	低	高	低	高	高	高	高	高	高	高	高	高	低
株高	Rht-B1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	+	-	NA
Plant	Rht-D1	+	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
height	RHT-8	+	+	-	+	-	-	+	-	-	-	+	-	-	-	-	-	+
	Rht24_AP2	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
	αPht-2D	-	-	+	+	+	-	+	+	+	-	+	-	+	+	-	+	-

性状 Trait type	基因/QTL Gene/QTL	NMAS069	NMAS070	NMAS071	川麦625 Chuanmai 625	21pin3-9	川麦704 Chuanmai 704	21pin4-3	21pin6-5	川麦614 Chuanmai 614	川麦618 Chuanmai 618	川麦620 Chuanmai 620	川麦623 Chuanmai 623	川麦702 Chuanmai 702	川麦914 Chuanmai 914	绵麦60 Mianmai 60	内麦175 Neimai 175	蜀麦1925 Shumai 1925
赤霉病	Fhb1^†	+	+	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Fusarium	Fhb2^†	+	-	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
head blight	Fhb4^†	+	+	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
	Fhb5^†	-	+	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
	Qfhb.caas-3BL	-	-	-	-	+	+	-	-	+	+	-	+	+	+	-	+	-
	QFhb.hbaas-5AS	-	-	-	+	+	-	+	-	-	-	+	-	-	-	-	+	-
	QFhb.hbaas-5AL	-	-	+	-	-	-	+	-	+	-	-	-	+	+	-	-	-
	QFhb.caas-5AL	+	-	-	+	-	+	-	+	+	+	+	+	+	+	+	-	+
千粒质量	TaSus2-2B	高	低	高	高	高	低	高	高	低	低	低	低	低	高	高	高	高
1000-grain	Tabas1	高	低	低	高	低	高	低	高	高	高	高	高	高	高	高	低	高
weight	TaGS5-A1	杂合	高	低	高	低	高	高	高	高	高	高	高	高	高	高	低	高
	TaGW2-6A	高	高	高	高	高	高	高	NA	高	高	高	高	高	高	NA	NA	高
	TaCwi-A1	低	低	高	高	低	高	高	高	高	高	高	高	高	高	高	高	高
	TaT6P	低	低	低	低	低	高	高	高	高	高	低	高	低	低	低	低	低
品质	Glu-B3h	-	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Quality	TaLCYE-B1	低	高	低	高	低	高	低	高	高	高	高	高	高	高	高	高	低
株高	Rht-B1	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	+	-	NA
Plant	Rht-D1	+	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
height	RHT-8	+	+	-	+	-	-	+	-	-	-	+	-	-	-	-	-	+
	Rht24_AP2	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
	αPht-2D	-	-	+	+	+	-	+	+	+	-	+	-	+	+	-	+	-

基因 Gene	SNP位置 SNP position	NMAS069	NMAS070	NMAS071	川麦614 Chuanmai 614	21pin 3-9	21pin 4-3	川麦702 Chuanmai 702	21pin 3-3	绵麦60 Mianmai 60	內麦175 Neimai 175	川麦620 Chuanmai 620	川麦623 Chuanmai 623	川麦618 Chuanmai 618	21pin 4-1	21pin 6-5	蜀麦1925 Shumai 1925	川麦914 Chuanmai 914
Fhb2	chr6B:118879886	GG	GG	CC	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG
Fhb2	chr6B:152096128	CC	TT	CT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT
Fhb2	chr6B:165725747	TT	CC	TT	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC
Fhb2	chr6B:169959743	AA	CC	AA	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC
Fhb4	chr4B:463122524	AA	GG	GG	GG	GG	AA	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG
Fhb4	chr4B:545511172	TT	TT	TT	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC
Fhb5	chr5A:191466469	GG	AA	AA	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG
Fhb5	chr5A:209001461	GG	AA	AA	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG

基因 Gene	SNP位置 SNP position	NMAS069	NMAS070	NMAS071	川麦614 Chuanmai 614	21pin 3-9	21pin 4-3	川麦702 Chuanmai 702	21pin 3-3	绵麦60 Mianmai 60	內麦175 Neimai 175	川麦620 Chuanmai 620	川麦623 Chuanmai 623	川麦618 Chuanmai 618	21pin 4-1	21pin 6-5	蜀麦1925 Shumai 1925	川麦914 Chuanmai 914
Fhb2	chr6B:118879886	GG	GG	CC	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG
Fhb2	chr6B:152096128	CC	TT	CT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT	TT
Fhb2	chr6B:165725747	TT	CC	TT	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC
Fhb2	chr6B:169959743	AA	CC	AA	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC
Fhb4	chr4B:463122524	AA	GG	GG	GG	GG	AA	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG
Fhb4	chr4B:545511172	TT	TT	TT	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC	CC
Fhb5	chr5A:191466469	GG	AA	AA	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG
Fhb5	chr5A:209001461	GG	AA	AA	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG	GG

标记 Marker	扩增基因 Amplified gene	染色体位置 Chrmosome position	引物名 Primer name	引物序列(5'-3') Primer sequence(5'-3')	扩增片段/bp Amplified fragment
DQK004	Fhb2	chr6B:165725747	Forward-FAM	GAAGGTGACCAAGTTCATGCTACAGAACTTCCTAGATCATTTGT	100
			Forward-HEX	GAAGGTCGGAGTCAACGGATTACAGAACTTCCTAGATCATTTGC
			Reverse	GGAACCAGATGTTTTGGACTCA
DQK008	Fhb2	chr6B:169959743	Forward-FAM	GAAGGTGACCAAGTTCATGCTAAGGAATCAGCTGGGCAATT	70
			Forward-HEX	GAAGGTCGGAGTCAACGGATTAAGGAATCAGCTGGGCAATG
			Reverse	GCTTGCGAAAGAAGAGAGAAGG
DQK009	Fhb2	chr6B:118879886	Forward-FAM	GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGTCCAATGTTGTCCGTTCTAC	121
			Forward-HEX	GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGTCCAATGTTGTCCGTTCTAG
			Reverse	GTAACTGCGTGCCTCCTC
DQK011	Fhb2	chr6B:152096128	Forward-FAM	GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGACCAGTAAAAAATCCGTCG	68
			Forward-HEX	GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGACCAGTAAAAAATCCGTCA
			Reverse	CAGAAGGGTGGTTAGACTGC
DQK005	Fhb4	chr4B:463122524	Forward-FAM	GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGACATGATCACGGCCCGA	63
			Forward-HEX	GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGACATGATCACGGCCCGG
			Reverse	ACCACCTAGGGATAGTTGCAC
DQK007	Fhb4	chr4B:545511172	Forward-FAM	GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGCTGACACCAACGTAGCTGAT	100
			Forward-HEX	GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGCTGACACCAACGTAGCTGAC
			Reverse	AGAGATTCAACGACGGAAAGTC
DQK001	Fhb5	chr5A:191466469	Forward-FAM	GAAGGTGACCAAGTTCATGCTTCCAAGAAAAAGAGAAACAGAAACT	97
			Forward-HEX	GAAGGTCGGAGTCAACGGATTTCCAAGAAAAAGAGAAACAGAAACC
			Reverse	AGGATTACTTGCTGCTGCTTTTA
DQK002	Fhb5	chr5A:209001461	Forward-FAM	GAAGGTGACCAAGTTCATGCTAAGCGCGCGAGAACCCGT	81
			Forward-HEX	GAAGGTCGGAGTCAACGGATTAAGCGCGCGAGAACCCGC
			Reverse	GAGCTCCGCTTGGAACGT

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