辣椒细胞质雄性不育系和保持系线粒体DNA差异的SRAP分析

doi:10.3969/j.issn.1000-7091.2012.06.014

华北农学报 ›› 2012, Vol. 27 ›› Issue (6): 62-66. doi: 10.3969/j.issn.1000-7091.2012.06.014

所属专题： 甜椒辣椒；

辣椒细胞质雄性不育系和保持系线粒体DNA差异的SRAP分析

袁稳^1,2, 吴国平^1,2, 王述彬², 刁卫平², 刘金兵², 潘宝贵², 戈伟²

1. 南京农业大学园艺学院, 江苏南京 210095;
2. 江苏省农业科学院蔬菜研究所, 江苏南京 210014

收稿日期:2012-08-12 出版日期:2012-12-28
通讯作者: 王述彬(1963-)，男，江苏姜堰人，研究员，博士，主要从事辣椒育种研究。
作者简介:袁稳(1988-)，女，山东菏泽人，在读硕士，主要从事辣椒遗传育种研究。
基金资助:
国家大宗蔬菜产业技术体系淮安综合试验站项目(CARS-25-G-14);江苏省自然科学基金项目(BK2010464);国家科技支撑计划(2012BAD02B02);江苏省农业科技自主创新基金项目(CX(11)1004)

Mitochondrial DNA Difference Analysis between CMS and Its Maintainer Line of Pepper through SRAP

YUAN Wen^1,2, WU Guo-ping^1,2, WANG Shu-bin², DIAO Wei-ping², LIU Jin-bing², PAN Bao-gui², GE Wei²

1. College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China;
2. Institute of Vegetable Crops, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Nanjing 210014, China

Received:2012-08-12 Published:2012-12-28

摘要/Abstract

摘要： 以辣椒细胞质雄性不育系21A及其保持系21B的线粒体DNA为材料进行SRAP分析,结果表明,从128对引物扩增获得了1 440条100～1 000 bp的条带,多态性位点仅有9个,占0.63%,其中7条多态性条带位于21A中;对多态性条带回收、克隆和测序分析后发现,9个克隆在GenBank中找到了相似的功能,绝大部分与能量代谢有关;利用21A中的多态性序列特点设计SCAR引物,对21A和21B的基因组DNA进行扩增验证,3对引物在21A中扩增出目的条带,表明已成功地将SRAP标记转化为SCAR标记,是新发现的与辣椒细胞质雄性不育基因相关的片段。

关键词: 辣椒, 细胞质雄性不育, 线粒体DNA, SRAP

Abstract: SRAP ( Sequence-related amplified polymorphism) was analyzed between mitochondrial DNA of cytoplasm male sterility line 21A and its maintainer line 21B of pepper． The analysis showed that a total of 1 440 amplified fragments and nine polymorphic fragments between 100-1 000 bp were detected by applying 128 SRAP primer combinations; the polymorphic fragment percentage was 0． 63%; seven of the polymorphic fragments was detected in male sterility line 21A． The polymorphic fragments were isolated，cloned and sequenced，blast of the 9 clones in GenBank showed that it all have homologous with energy metabolism genes． According to the sequences， three specific primers were designed to transform the SRAP marker to more stable SCAR markers，and they only detected in the 21A line， this suggested that the newly detected fragments related to cytoplasm male sterility．

Key words: Pepper, CMS, Mitochondrial DNA, SRAP

中图分类号:

S641.03

袁稳, 吴国平, 王述彬, 刁卫平, 刘金兵, 潘宝贵, 戈伟. 辣椒细胞质雄性不育系和保持系线粒体DNA差异的SRAP分析[J]. 华北农学报, 2012, 27(6): 62-66. doi: 10.3969/j.issn.1000-7091.2012.06.014.

YUAN Wen, WU Guo-ping, WANG Shu-bin, DIAO Wei-ping, LIU Jin-bing, PAN Bao-gui, GE Wei. Mitochondrial DNA Difference Analysis between CMS and Its Maintainer Line of Pepper through SRAP[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2012, 27(6): 62-66. doi: 10.3969/j.issn.1000-7091.2012.06.014.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2012/V27/I6/62

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