基于MultiNA微芯片电泳系统的56份玉米骨干自交系的遗传多样性分析

doi:10.7668/hbnxb.2015.06.016

华北农学报 ›› 2015, Vol. 30 ›› Issue (6): 105-111. doi: 10.7668/hbnxb.2015.06.016

所属专题： 玉米；

基于MultiNA微芯片电泳系统的56份玉米骨干自交系的遗传多样性分析

蔡苗苗¹, 宋希云^2,3, 蔡春梅¹, 裴玉贺^2,3, 赵美爱^1,3

1. 青岛农业大学生命科学学院, 植物生物技术重点实验室, 山东青岛 266109;
2. 青岛农业大学农学与植物保护学院, 山东青岛 266109;
3. 青岛市主要农作物种质创新与应用重点实验室, 山东青岛 266109

收稿日期:2015-09-13 出版日期:2015-12-28
通讯作者: 赵美爱(1974-),女,吉林磐石人,副教授,博士,主要从事玉米分子育种研究.
作者简介:蔡苗苗(1989-),女,山东泰安人,在读硕士,主要从事作物遗传育种研究.
基金资助:
国家自然基金项目(31372636);山东省现代农业产业技术体系玉米产业创新团队项目(SDAIT-01-022-01);青岛市应用基础研究计划项目(14-2-4-13-jch);山东省农业生物资源创新利用项目;山东省2013年度农业重大应用技术创新课题

The Genetic Diversity of 56 Maize Inbred Lines on MultiNA Microchip Electrophoresis Technology

CAI Miao-miao¹, SONG Xi-yun^2,3, CAI Chun-mei¹, PEI Yu-he^2,3, ZHAO Mei-ai^1,3

1. College of Life Science, Qingdao Agricultural University, Key Lab of Plant Biotechnology in University of Shandong Province, Qingdao 266109, China;
2. College of Agronomy and Plant Protection, Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109, China;
3. Qingdao Key Lab of Germplasm Innovation and Application of Major Crops, Qingdao 266109, China

Received:2015-09-13 Published:2015-12-28

摘要/Abstract

摘要： 为了研究56份玉米骨干自交系的遗传多样性,充分挖掘种质资源的遗传潜力,用MultiNA微芯片电泳系统通过36对多态性SSR分子标记对56份玉米自交系进行遗传多样性分析,通过 PowerMarker V3.25与 Structure V2.3.4 等软件揭示其基因多样性与群体结构.结果表明:在56份自交系中,36对SSR标记所检测到的等位变异为8 ~39个,平均为24.694个;基因多样性为0.758 ~0.968,平均为0.918;PIC为0.722 ~0.967,平均为0.911.聚类分析表明,K=7时,ΔK值最大,即这些自交系可以划分为7个类群,依次为旅大红骨群、兰卡斯特群、瑞德群、P群、塘四平头群、综合种选亚群、热带种质.研究结果为供试材料的利用提供了理论依据.

关键词: SSR, 玉米, 自交系, 高通量, 遗传多样性

Abstract: In order to study the genetic diversity of 56 maize inbred lines,fully tap the genetic potential of the germplasm,the genetic diversity of 56 maize inbred lines were analyzed on MultiNA Microchip Electrophoresis Technology by 36 pairs of Polymorphic SSR markers and their genetic diversity and population structure was revealed by PowerMarker V3.25 and Structure V2.3.4 software.The results showed that:The detected alleles of 36 SSR primers ranged from 8 to 39,with an average of 24.694;genetic diversity ranged from 0.758 to 0.968,with an average of 0.918;the polymorphism information index(PIC)ranged from 0.722 to 0.967,with an average of 0.911.These inbred lines could be divided into seven groups,followed by Lüdahonggu group,Lancaster group,Reid group,P group,Tangsipingtou group,Integrated species subgroup and Tropical germplasm.Because the cluster analysis showed that when K was seven the ΔK value was the maximum.These results provided basis for the test material parental material selection.

Key words: SSR, Maize, Inbred lines, High throughput, Genetic diversity

中图分类号:

S513.03

蔡苗苗, 宋希云, 蔡春梅, 裴玉贺, 赵美爱. 基于MultiNA微芯片电泳系统的56份玉米骨干自交系的遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2015, 30(6): 105-111. doi: 10.7668/hbnxb.2015.06.016.

CAI Miao-miao, SONG Xi-yun, CAI Chun-mei, PEI Yu-he, ZHAO Mei-ai. The Genetic Diversity of 56 Maize Inbred Lines on MultiNA Microchip Electrophoresis Technology[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2015, 30(6): 105-111. doi: 10.7668/hbnxb.2015.06.016.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2015/V30/I6/105

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