利用BSA法检测水稻条纹叶枯病高效应抗性位点

doi:10.7668/hbnxb.2014.02.016

华北农学报 ›› 2014, Vol. 29 ›› Issue (2): 85-88. doi: 10.7668/hbnxb.2014.02.016

所属专题： 水稻；

利用BSA法检测水稻条纹叶枯病高效应抗性位点

张云辉, 张所兵, 林静, 汪迎节, 方先文

江苏省农业科学院粮食作物研究所江苏南京 210014

收稿日期:2013-12-23 出版日期:2014-04-28
通讯作者: 方先文(1967-),男,江苏高邮人,研究员,博士,主要从事水稻品种资源研究。
作者简介:张云辉(1987-),男,江苏高淳人,助理研究员,博士,主要从事水稻品种资源研究。
基金资助:
江苏省农业科技自主创新基金项目[CX(12)2024]

Detection of High Effect Site for Resistance to Rice Stripe Virus by BSA

ZHANG Yun-hui, ZHANG Suo-bing, LIN Jing, WANG Ying-jie, FANG Xian-wen

Institute of Food Crops, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Nanjing 210014, China

Received:2013-12-23 Published:2014-04-28

摘要/Abstract

摘要： 通过前期对江苏水稻地方品种抗条纹叶枯病资源的筛选获得的一份高抗条纹叶枯病水稻品种旱稻,配制其与条纹叶枯病感病品种武育粳3号杂交组合,采用田间自然接种鉴定方法,以病情指数为表型值,对141个F₂单株的F_2:3株系进行了条纹叶枯病抗性鉴定。同时利用群体分离分析法(Bulked segregant analysis,BSA法)对抗/感DNA池分析发现第11染色体SSR标记RM209、RM21与条纹叶枯病抗性有明显的连锁关系。利用基于完备复合区间作图方法的QTL检测软件(QTL IciMapping V3.2)在第11染色体上检测到一个条纹叶枯病抗性相关QTL,位于SSR标记RM209和RM21之间,LOD值为13.25,可解释表型变异38.39%,加性效应为负值,表明该数量性状基因座对水稻条纹叶枯病的抗性来自抗病亲本旱稻。

关键词: 水稻, 条纹叶枯病, 群体分离分析法, QTL定位

Abstract: The Jiangsu landrace rice variety Handao was previously identified as high resistance to rice stripe disease (RSV) . A total of 141 F_2:3 lines derived from the cross of Handao and Wuyujing 3, a variety high sensitive to RSV, were investigated by natural infection method in field, and the disease rating index was scored. Analysis of the resistant/sensitive pools by bulked segregant analysis indicated that the SSR markers RM209 and RM21 on rice chromosome 11 obviously linked to RSV resistance. A QTL for RSV was detected on rice chromosome 11 between RM209 and RM21 by the software QTL IciMapping V3. 2 based on the principle of inclusive composite interval mapping (ICIM) with the maximum LOD score 13. 25, which explained 38. 39% of the trait variance. Additive effects of qSTV11^HD was negative, indicating that the resistance allele was inherited from Handao.

Key words: Rice, Rice stripe virus, Bulked segregant analysis, QTL mapping

中图分类号:

S435.111.4+2

张云辉, 张所兵, 林静, 汪迎节, 方先文. 利用BSA法检测水稻条纹叶枯病高效应抗性位点[J]. 华北农学报, 2014, 29(2): 85-88. doi: 10.7668/hbnxb.2014.02.016.

ZHANG Yun-hui, ZHANG Suo-bing, LIN Jing, WANG Ying-jie, FANG Xian-wen. Detection of High Effect Site for Resistance to Rice Stripe Virus by BSA[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2014, 29(2): 85-88. doi: 10.7668/hbnxb.2014.02.016.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2014/V29/I2/85

参考文献

[1] 潘学彪, 梁国华, 陈宗祥, 等. 江苏抗水稻条纹叶枯病育种策略[J]. 江苏农业科学,2005(5):22-23.
[2] 王才林. 江苏省水稻条纹叶枯病抗性育种研究进展[J]. 江苏农业科学,2006(3):1-5.
[3] 孙黛珍,江玲,张迎信, 等. 水稻抗条纹叶枯病数量性状座位分析[J]. 中国水稻科学,2007,21(1):95-98.
[4] 丁秀兰, 江玲, 张迎信, 等. 利用回交重组自交群体检测水稻条纹叶枯病抗性位点[J]. 作物学报, 2005,31(8):1041-1046.
[5] Zhang Y X, Wang Q, Jiang L, et al. Fine mapping ofqSTV11 KAS, a major QTL for rice stripe disease resistance[J]. Theor Appl Genet,2011,122(8):1591-1604.
[6] Zhang Y X, Wang Q, Jiang L, et al. Detection and finemapping of two quantitative trait loci for partial resistanceto stripe virus in rice (Oryza sativa L. ) [J]. Mol Breed,2012,30(3):1379-1391.
[7] Michelmore R W, Paran I, Kesseli R V. Identification ofmarkers linked to disease-resistance genes by bulkes seg-regant analysis: a rapid method to detect markers in spe-cific genomic regions by using segregating populations[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 1991, 88 (21 ): 9828 -9832.
[8] 方宣钧, 吴为人, 唐纪良. 作物 DNA 标记辅助育种[M]. 北京: 科学出版社,2001:60-61.
[9] Korol A, Frenkel Z, Cohen L, et al. Fractioned DNA poo-ling: a new cost-effective strategy for fine mapping ofquantitative trait loci[J]. Genetics,2007,176(4):2611 -2623.
[10] Zhang Q, Shen B Z, Dai X K, et al. Using bulked ex-tremes and recessive class to map genes for photoperiod-sensitive genic male sterility in rice[J]. Proc Natl AcadSci USA,1994,91(18):8675-8679.
[11] Wang G L, Paterson A H. Assessment of DNA poolingstrategies for mapping of QTLs[J]. Theor Appl Genet,1994,88(3-4):355-361.
[12] Zhang J,Stewart J M D. Identification of molecular mark-ers linked to the fertility restorer genes for CMS-D8 incotton[J]. Crop Science,2004,44(4):1209-1217.
[13] Ji H S, Chu S H, Jiang W Z, et al. Characterization andmapping of a shattering mutant in rice that correspondsto a block of domestication genes [J]. Genetics, 2006,173(2):955-1005.
[14] Washio O, Ezuka A, Toriyama K, et al. Testing methodfor genetic of and breeding for resistance to rice stripedisease[J]. Bull Chugoku Agric Exp Sta Ser,1968,16:39-197.
[15] Wang J K, Wan X Y, Li H H, et al. Application of iden-tified QTL-maker associations in rice quality improve-ment through a design-breeding approach[J]. Thero Ap-pl Genet,2007,115(1):87-100.
[16] McCouch S R, Cho Y G, Yano M, et al. Report on QTLnomenclature[J]. Rice Genet Newsl,1997 (14):11-13.
[17] Hayano-Saito Y, Saito K, Nakamura S, et al. Fine physi-cal mapping of the rice stripe resistance gene locus, Stv-bi[J]. Theor Appl Genet,2000,101(1-2):59-63.
[18] Wang B X, Jiang L, Zhang Y X, et al. Genetic dissectionof the resistance to Rice stripe virus present in the indicarice cultivar 'IR 24'[J]. Genome, 2011, 54(8): 611 -619.
[19] Wu X J, Zuo S M, Chen Z X, et al. Fine mapping ofqSTV11 TQ, a major gene conferring resistance to ricestripe disease[J]. Theor Appl Genet, 2011, 122 (5 ):915-923.

选择文件类型/文献管理软件名称

选择包含的内容

利用BSA法检测水稻条纹叶枯病高效应抗性位点

Detection of High Effect Site for Resistance to Rice Stripe Virus by BSA

PDF

可视化

被引次数

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

[1]	李霞, 罗丽卉, 周娅, 杨定清, 王棚, 李森. 秸秆还田对水稻-油菜轮作体系土壤活性有机碳组分及酶活性的影响[J]. 华北农学报, 2022, 37(5): 124-131.
[2]	王亚, 王越涛, 申关望, 王付华, 王生轩, 白涛, 尹海庆. *聚合R基因Pigm和非R基因bsr-d1改良水稻稻瘟病抗性*[J]. 华北农学报, 2022, 37(5): 157-165.
[3]	韩政宏, 段宇轩, 徐善斌, 王敬国, 刘化龙, 杨洛淼, 贾琰, 辛威, 郑洪亮, 邹德堂. *利用CRISPR/Cas9技术敲除GS3和GS9基因改良水稻粒型性状*[J]. 华北农学报, 2022, 37(2): 9-17.
[4]	周丽平, 赵秋, 张新建, 宁晓光, 袁亮, 李燕婷, 赵秉强. 新型增效复合肥料对水稻养分吸收和产量的影响[J]. 华北农学报, 2022, 37(2): 112-120.
[5]	梁玉刚, 周晶, 余政军, 李静怡, 黄璜, 赵正洪. 稻鸭共育对直播水稻田间杂草群落组成及多样性的影响[J]. 华北农学报, 2022, 37(2): 160-170.
[6]	陈子琪, 王伟苹, 赵宏强, 王皓, 韩笑, 杨洛淼, 辛威, 刘化龙, 郑洪亮, 王敬国. 利用籼粳交RIL群体进行水稻发芽期与芽期耐冷性QTL分析[J]. 华北农学报, 2022, 37(1): 50-57.
[7]	刘俊峰, 李漪濛, 梁超, 周婵婵, 王术, 贾宝艳, 黄元财, 王岩, 王韵. 施氮方式与行距配置对水稻冠层结构及产量的影响[J]. 华北农学报, 2022, 37(1): 77-85.
[8]	静莉丽, 彭廷, 赵亚帆, 赵帅兵, 王童童, 李源, 程远, 杜彦修, 张静, 孙红正, 赵全志. 灌浆充实调节剂对大穗型水稻弱势籽粒灌浆的调控效应[J]. 华北农学报, 2022, 37(1): 86-94.
[9]	徐令旗, 郭晓红, 张佳柠, 赵洋, 李晓蕾, 刘绍峰, 崔致远, 安懿亮, 吕艳东. 不同有机肥对旱直播水稻品质的影响[J]. 华北农学报, 2022, 37(1): 137-146.
[10]	董林林, 沈明星, 全坚宇, 闻育琴, 沈园, 陶玥玥, 施林林, 陆长婴. 基肥正位深施对直播水稻产量和化肥利用的影响[J]. 华北农学报, 2021, 36(S1): 222-230.
[11]	张鹏, 吴佩聪, 单颖, 邹刚华, 丁哲利, 钱永德, 赵凤亮. 秸秆还田对热带土壤-水稻种植系统N₂O排放的影响[J]. 华北农学报, 2021, 36(S1): 260-266.
[12]	魏吉平, 代航, 李振勇, 丁紫苏, 唐凌, 栾鑫, 柯善文, 张向前. *水稻叶早衰突变体osles3的基因定位及其生物信息学分析*[J]. 华北农学报, 2021, 36(6): 45-53.
[13]	隆艳喜, 罗雁茹, 竺正航, 廖芷依, 王兰. 四倍体水稻蛋白质含量和谷蛋白基因表达研究[J]. 华北农学报, 2021, 36(6): 78-87.
[14]	彭立功, 龚静, 兰艳, 王锦, 隋晓东, 丁春邦, 李天. 水分胁迫对宜香优2115籽粒淀粉合成及产量的影响[J]. 华北农学报, 2021, 36(5): 77-86.
[15]	李静怡, 王忍, 孟祥杰, 梁玉刚, 龚向胜, 黄璜, 魏海林. 免耕半固态直播对水稻剑叶生理特性的影响[J]. 华北农学报, 2021, 36(5): 87-98.

模态框（Modal）标题

选择文件类型/文献管理软件名称

选择包含的内容

利用BSA法检测水稻条纹叶枯病高效应抗性位点

Detection of High Effect Site for Resistance to Rice Stripe Virus by BSA

PDF

可视化

被引次数

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价