基于紫娟茶叶片转录组的SSR引物开发

doi:10.7668/hbnxb.2016.S1.025

华北农学报 ›› 2016, Vol. 31 ›› Issue (S1): 140-145. doi: 10.7668/hbnxb.2016.S1.025

所属专题： 生物技术；

• 作物遗传育种·种质资源·生物技术 • 上一篇下一篇

基于紫娟茶叶片转录组的SSR引物开发

周萌^1,2, 宋维希^1,2, 鄢文光^1,2, 李晓霞^1,2, 陈继伟^1,2, 夏丽飞^1,2, 梁家斌^1,2, 陈林波^1,2

1. 云南省农业科学院茶叶研究所, 云南勐海 666201;
2. 云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心, 云南勐海 666201

收稿日期:2016-06-28 出版日期:2016-12-28
作者简介:周萌(1989-),男,云南昆明人,研究实习员,主要从事茶叶检测和生物技术研究。
基金资助:
云南科技厅重大专项（2013BB006）；国家自然科学基金项目（31460216；31560200）；云南省农业科学院专项基金项目（YAAS2014JC012）；云南省人才培养计划项目（2015HB105）

SSR Primers Development Based on Zijuancha Leaves' Transcription Group

ZHOU Meng^1,2, SONG Weixi^1,2, YAN Wenguang^1,2, LI Xiaoxia^1,2, CHEN Jiwei^1,2, XIA Lifei^1,2, LIANG Jiabin^1,2, CHEN Linbo^1,2

1. Tea Research Institute, Yunnan Academy of Agricultural Sciences, Menghai 666201, China;
2. Yunnan Technology Engineering Research Center of Tea Germplasm Innovation and Supporting Cultivation, Menghai 666201, China

Received:2016-06-28 Published:2016-12-28

摘要/Abstract

摘要： 以稀有茶树品种紫娟茶为研究对象，进行SSR引物开发的研究，从紫娟茶叶片转录组中筛选重复基元最多的SSR，设计并筛选紫娟茶的SSR引物。通过从已测序的紫娟茶叶片转录组中设计SSR引物共87对，通过对紫娟茶以及随机采摘的3份不同品种茶树提取DNA后进行PCR扩增，1%琼脂糖凝胶电泳分析，在紫外凝胶成像仪中观察拍照，判断是否扩增出目标条带。通过试验筛选出可以扩增出清晰目标条带的引物63对，有效率达72.4%，其中有33对表现出多态性，占有效SSR引物的52.4%。结果表明，从紫娟茶叶片转录组中设计引物是可行的。下一步研究将从这63对引物中开发紫娟茶的特异引物。

关键词: 紫娟茶, SSR, 引物开发

Abstract: To develop SSR Markers from a rare tea variety Zijuancha,Zijuancha leaves' transcriptome which had the highest number of SSR repeats were used to design and select Zijuancha SSR Markers.In this study,designed primers from sequence of transcription group of Zijuancha's leaves,and got 87 primer pairs.Took DNA from Zijuancha and 3 other tea accessions,PCR by each primer,and analyzed in 1% agarose gel electrophoresis.Results showed 63 primer pairs could amplify bands,with the effective amplification rate of 72.4%.33 primer pairs demonstrated the polymorphic characteristics,accounting for 52.4% of all effective primer pairs.According to this study,to designed primer pairs from sequence of Zijuancha transcription group was viable.To picked up specific primers of Zijuancha from those 63 primer pairs will be performed in the next study.

Key words: Zijuancha, SSR, Primer development

中图分类号:

S572.03

周萌, 宋维希, 鄢文光, 李晓霞, 陈继伟, 夏丽飞, 梁家斌, 陈林波. 基于紫娟茶叶片转录组的SSR引物开发[J]. 华北农学报, 2016, 31(S1): 140-145. doi: 10.7668/hbnxb.2016.S1.025.

ZHOU Meng, SONG Weixi, YAN Wenguang, LI Xiaoxia, CHEN Jiwei, XIA Lifei, LIANG Jiabin, CHEN Linbo. SSR Primers Development Based on Zijuancha Leaves' Transcription Group[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2016, 31(S1): 140-145. doi: 10.7668/hbnxb.2016.S1.025.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2016/V31/IS1/140

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