华北农学报 ›› 2014, Vol. 29 ›› Issue (6): 6-10. doi: 10.7668/hbnxb.2014.06.002

所属专题: 水稻

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水稻中脉缺陷突变体dl-6的遗传分析与精细定位

王军1, 王婧2, 杨杰1, 赵祥强2, 朱金燕1, 范方军1, 李文奇1, 王芳权1, 仲维功1   

  1. 1. 江苏省农业科学院 粮食作物研究所, 国家水稻改良中心南京分中心, 江苏 南京 210014;
    2. 南通大学 生命科学院, 江苏 南通 226007
  • 收稿日期:2014-08-26 出版日期:2014-12-28
  • 通讯作者: 仲维功(1954-),男,江苏兴化人,研究员,主要从事水稻遗传育种研究。
  • 作者简介:王 军(1981-),男,江苏盐城人,副研究员,在读博士,主要从事水稻分子遗传育种研究。
  • 基金资助:
    国家科技支撑计划重大项目(2011BAD16B03);江苏省研究生创新工程项目(CXZZ12_0906);江苏省农业自主创新资金项目(CX(12)1003);江苏省自然科学基金项目(BK20130725);江苏省科技支撑计划项目(BE2012309)

Genetic Analysis and Gene Fine Mapping of a Midrib-deficient Mutant dl-6 in Rice

WANG Jun1, WANG Jing2, YANG Jie1, ZHAO Xiang-qiang2, ZHU Jin-yan1, FAN Fang-jun1, LI Wen-qi1, WANG Fang-quan1, ZHONG Wei-gong1   

  1. 1. Institute of Food Crops, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Nanjing Branch of Chinese National Center for Rice Improvement, Nanjing 210014, China;
    2. School of Life Sciences, Nantong University, Nantong 226007, China
  • Received:2014-08-26 Published:2014-12-28

摘要: 为了克隆 DL-6 基因,以dl-6与9311配制正反杂交组合进行性状分析发现,dl-6 突变性状受1对隐性核基因控制,利用SSR分子标记将控制dl-6性状的基因 DL-6 初步定位在水稻第3染色体的短臂上,进一步利用新发展的InDel标记将 DL-6 基因精细定位在I3-5和I3-8之间85 kb的物理距离内。对该区段内存在的开放阅读框(ORF)进行分析,发现其中ORF9编码的 YABBY 基因是一个与叶脉发育相关的基因,对突变体dl-6和野生型中 YABBY 基因进行测序,将测序结果与数据中日本晴序列进行比对发现,突变体dl-6中 YABBY 基因的第1个外显子存在1个单碱基突变,该突变导致野生型中编码的半胱氨酸突变为突变体中的精氨酸;同时突变体dl-6在 YABBY 基因的3'端还存在8个碱基的缺失。这2个突变位点哪个是导致dl-6突变的功能区目前还不确定,有待进一步研究。

关键词: 水稻, 中脉缺陷, 基因定位, dl-6

Abstract: To clone the DL-6 locus,positive and negative cross combinations were developed between dl-6 and 9311,and genetic analysis found that drooping leaf was controlled by one recessive nuclear gene DL-6. DL-6 was primarily mapped on the short arm of chromosome 3 with SSR markers.With newly developed markers DL-6 was finally fine mapped in 85 kb region between markers I3-5 and I3-8.Open reading frame (ORF) analysis revealed that ORF9 might be a drooping leaf related gene.ORF9 both in mutant dl-6 and in wild type were sequenced and 1 bp mutation was found in first exon in dl-6 when blasted with Nipponbare.Cysteine mutated into arginine in dl-6.Meanwhile,8 bp deletion was also found at 3' end of YABBY.These two mutations which one is the functional mutation of DL-6 is still uncertain and need deeply research.

Key words: Rice, Midrib-deficient, Gene mapping, dl-6

中图分类号: 

引用本文

王军, 王婧, 杨杰, 赵祥强, 朱金燕, 范方军, 李文奇, 王芳权, 仲维功. 水稻中脉缺陷突变体dl-6的遗传分析与精细定位[J]. 华北农学报, 2014, 29(6): 6-10. doi: 10.7668/hbnxb.2014.06.002.

WANG Jun, WANG Jing, YANG Jie, ZHAO Xiang-qiang, ZHU Jin-yan, FAN Fang-jun, LI Wen-qi, WANG Fang-quan, ZHONG Wei-gong. Genetic Analysis and Gene Fine Mapping of a Midrib-deficient Mutant dl-6 in Rice[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2014, 29(6): 6-10. doi: 10.7668/hbnxb.2014.06.002.

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