华北农学报 ›› 2011, Vol. 26 ›› Issue (1): 99-104. doi: 10.7668/hbnxb.2011.01.021

所属专题: 玉米 生物技术

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玉米寡肽转运蛋白基因(ZmOPT0212)的克隆及其生物信息学分析

高慧, 刘海军, 黄亚群, 陈景堂, 祝丽英, 赵永锋, 张祖新   

  1. 河北农业人学国家玉米改良中心河北分中心,河北保定071001
  • 收稿日期:2010-12-07 出版日期:2011-02-28
  • 通讯作者: 黄亚群(1962- ),女,辽宁桓仁人,教授,主要从事植物营养遗传研究。
  • 作者简介:高慧(1985- ),女,内蒙古巴彦淖尔人,硕士研究生,主要从事作物遗传育种研究。
  • 基金资助:
    转基因重大专项(2008ZX003-002);河北省自然基金项目(C2008000319)

Cloning and Bioinformatic Analysis of OligopeptideTransporter Gene of Maize

GAO Hui, LIU Hai-jun, HUANG Ya-qun, CHEN Jing-tang, ZHU Li-ying, ZHAO Yong-feng, ZHANG Zu-xin   

  1. Hebei Branch of Chinese National Maize Improvement Center, Hebei Agricultural University, Baoding 071001, China
  • Received:2010-12-07 Published:2011-02-28

摘要: 根据玉米B73和水稻的寡肽转运蛋白全长序列设计引物,通过RT-PCR直接扩增的方法从玉米自交系478中克隆到了寡肽转运蛋白基因,命名为ZmOPT0212(Accessionnumber:HM021150)。ZmOPT0212开放阅读框为2151bp,编码716个氨基酸残基,等电点8.87,相对分子质量为77.4kDa。预测由该基因转录的寡肽转运蛋白其二级结构约含43.85%的α-螺旋、13.27%的延伸链、3.91%的β-转角和38.97%的不规则卷曲,含有14个连续的疏水片断,其中12个可能构成跨膜螺旋;预测该转运蛋白不存在信号肽,亚细胞定位存在于细胞膜上。同源性和进化树的预测分析显示,ZmOPT0212蛋白与水稻、拟南芥、毛果杨和蓖麻等高等植物的寡肽转运蛋白同源性分别达到了99%,96%,92%和92%,所转运的底物除有寡肽外,还包含有金属离子、金属离子-烟草胺的螯合物等。

关键词: 玉米, 寡肽转运蛋白(OPT), 克隆, 生物信息学分析

Abstract: The largest open readingframe of gene has 2151 by in length and encoded a polypeptide of 716 amino acid residues. The esti-mated molecular weight and isoelectric point of the putative protein. The pre-dieted secondary structure composition for the protein has about 43.85% alpha helixes,13.27% extended strand,3.91% beta turn and 38.97% random coil.

Key words: Maize, Oliopeptide transporter(OPT), Cloning, Bioinformatics

中图分类号: 

引用本文

高慧, 刘海军, 黄亚群, 陈景堂, 祝丽英, 赵永锋, 张祖新. 玉米寡肽转运蛋白基因(ZmOPT0212)的克隆及其生物信息学分析[J]. 华北农学报, 2011, 26(1): 99-104. doi: 10.7668/hbnxb.2011.01.021.

GAO Hui, LIU Hai-jun, HUANG Ya-qun, CHEN Jing-tang, ZHU Li-ying, ZHAO Yong-feng, ZHANG Zu-xin. Cloning and Bioinformatic Analysis of OligopeptideTransporter Gene of Maize[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2011, 26(1): 99-104. doi: 10.7668/hbnxb.2011.01.021.

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