华北农学报 ›› 2008, Vol. 23 ›› Issue (4): 110-114. doi: 10.7668/hbnxb.2008.04.026

所属专题: 西瓜

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三种瓜类作物SSR扩增的通用性与多态性分析

李楠1,2, 张海英2, 陈年来1, 王永健2, 许勇2, 宫国义2, 郭绍贵2   

  1. 1. 甘肃农业大学 农学院,甘肃 兰州 730070;
    2. 北京市农林科学院 蔬菜研究中心,北京 100097
  • 收稿日期:2008-02-26 出版日期:2008-08-28
  • 通讯作者: 张海英(1969-),女,北京海淀人,副研究员,博士,主要从事瓜类作物分子育种工作
  • 作者简介:李楠(1983-),女,山西朔州人,在读硕士,主要从事植物生理与分子生物学研究
  • 基金资助:
    北京市自然科学基金(5050001,5062008);国家“863”计划(2006AA100108,2006AA10Z1A8);国家自然科学基金(30471186,30570997);北京市优秀人才项目(20061D0200500051)

Comparison of Versatility and Polymorphism of SSRs in Three Cucurbitaceae

LI Nan1,2, ZHANG Hai-ying2, CHEN Nian-lai1, WANG Yong-jian2, XU Yong2, GONG Guo-yi2, GUO Shao-gui2   

  1. 1. Agronomy College,Gansu Agricultural University,Lanzhou 730070,China;
    2. Beijing Vegetable Research Center,Beijing 100097,China
  • Received:2008-02-26 Published:2008-08-28

摘要: 利用940对SSR引物,对甜瓜、黄瓜和西瓜三套重组自交系群体的作图亲本DNA进行PCR扩增,分析SSR引物在不同瓜类作物间的通用性与多态性。结果表明,上述SSR引物在甜瓜、黄瓜和西瓜等不同瓜类作物间具有一定的通用性,最小通用率超过24%,说明不同瓜类作物基因组间存在一定的相似性。但瓜类SSR引物的种属特异性很强,能够检测的多态率很低,三套作图亲本之间能够共用的多态性SSR引物比例甚至不足1%。

关键词: 瓜类作物, SSR, 通用性, 多态性

Abstract: In this study,by PCR amplification with the genomic DNA of three mapping parents,940 SSRs primers were tested for analysis their versatility and polymorphism in melon,cucumber and watermelon. The results indicated that these SSR primers had some versatility in the above crops. The minimum SSR transferability was higher than 24 %,show-ing some similarity in the genome of these crops.But these SSR primers also had strongly genus specialty,their polymor-phism level was very low,the ratio of common polymorphism SSR primers among these crops was lower than 1 %.

Key words: Cucurbitaceae, SSR, Transferability, Polymorphism

中图分类号: 

引用本文

李楠, 张海英, 陈年来, 王永健, 许勇, 宫国义, 郭绍贵. 三种瓜类作物SSR扩增的通用性与多态性分析[J]. 华北农学报, 2008, 23(4): 110-114. doi: 10.7668/hbnxb.2008.04.026.

LI Nan, ZHANG Hai-ying, CHEN Nian-lai, WANG Yong-jian, XU Yong, GONG Guo-yi, GUO Shao-gui. Comparison of Versatility and Polymorphism of SSRs in Three Cucurbitaceae[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2008, 23(4): 110-114. doi: 10.7668/hbnxb.2008.04.026.

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