利用ISSR标记研究鹅观草属种质资源的遗传多样性

doi:10.7668/hbnxb.2007.04.034

摘要/Abstract

摘要： 为进一步了解鹅观草属种质资源的遗传背景和拓宽牧草育种的遗传基础，科学指导鹅观草属种质资源的收集、评价和利用，利用ISSR(Inter simple sequence repeat marker)标记对鹅观草属20个种，6个变种，共60份材料进行了遗传多样性检测。结果发现，被测材料间ISSR标记的多态性较高，在20个引物中，有16个引物可扩增出清晰且重复性好的DNA片段，共产生12条DNA片段，其中104条具有多态性，多态性比率为83.20%；每个引物可扩增出6～10条DNA片段，平均7.81条，材料间遗传相似系数GS变幅为0.188～0.879，平均值为0.37；聚类分析表明，在遗传相似系数为0.441的水平上，60份材料可以聚为类，属于同种、同组、同系的不同材料首先聚在一起，然后再与其他种的材料聚在一起，此外，材料的聚类还表现出一定的地域性规律。

关键词: 鹅观草, ISSR标记, 种质资源, 遗传多样性

Abstract: In order to acquire more information about genetic backgrounds on Roegneria and broaden genetic bases for forage breeding, and give more exactly guide on Roegneria germplasm collection, evalution and utilization, genetic diversity of 60 accessions of Roegneria genera representing 20 species and 6 subspecies was evaluated using inter-simple sequence repeat (ISSR) markers in this paper. Twenty ISSR primers were used for the PCR amplification of genomic DNA and 16 primers could produce clear and polymorphic bands. A total of 125 bands were amplified from 16 primers, of which 104 bands (83.20%) were polymorphic. 6 to 10 polymorphic bands could be amplified from each primer, with an average 7.81. The mean genetic similarity (GS) value based on ISSR markers among 60 accession of Roegneria genera was 0.375, ranging from 0.188 to 0.879. Cluster analysis showed all materials could be classified into 5 groups, the different accessions belongs to the same species could be clustered together at first, and then combined with other accessions, the accessions from the same origin also could be classified into the same groups first. These results suggested that ISSR markers could be used as an effective molecular technique for forage germplasm diversity research and species identification.

Key words: Roegneria, ISSR marker, Germplasm resources, Genetic diversity

中图分类号:

S543.235.3

肖海峻, 徐柱, 李临航, 马玉宝, 曹授俊. 利用ISSR标记研究鹅观草属种质资源的遗传多样性[J]. 华北农学报, 2007, 22(4): 146-150. doi: 10.7668/hbnxb.2007.04.034.

XIAO Hai-jun, XU Zhu, LI Lin-hang, MA Yu-bao, CAO Shou-jun. Genetic Diversity of Roegneria Genera Studied by ISSR Markers[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2007, 22(4): 146-150. doi: 10.7668/hbnxb.2007.04.034.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2007/V22/I4/146

参考文献

[1] McGregor C E, Lambert C A, Greyling M M, et al, A comparative assessment of DNA fingerprinting techniques(RAPD, ISSR, AFLP and SSR) in tetraploid potato(Solanum tuberosum L. ) germplasm[J]. Euphytica, 2000, 113: 135-144.
[2] 高凤云, 张辉, 斯钦正特尔. 亚麻分子标记技术研究进展[J]. 内蒙古农业科技, 2006(2): 30-31.
[3] 肖海峻, 孟利前, 李玉冰. ISSR分子标记及其在植物遗传育种中的应用[J]. 内蒙古农业科技, 2006(4): 31-33.
[4] 钱韦, 葛颂, 洪德元, 等. 采用RAPD和ISSR标记探讨中国疣粒野生稻的遗传多样性[J]. 植物学报, 2000, 42(7): 741-750.
[5] Wolhf K, Zietkie Wicz E, Hofstra H, et al. Identification of chrysanthemum cultivars and stability of fingerprint patterns[J]. Theor Appli Genet, 1995, 91: 439-447.
[6] Joshi S P. Gupta V S, Aggarwal R K, et al. Genetic diversity and phylogenetic relationship as revealed by inter simple sequence repeat polymorphism in the genus Oryza[J]. Theor Appl Genet, 2000, 100: 1311-1320.
[7] Kojima T, Nagaoka T, Noda K, et al. Genetic linkage map of ISSR and RAPD markers in eikorn wheat in relation to that of RFLP markers[J]. Theor Appl Genet, 1998, 96: 37-45.
[8] 周福平, 孙黛珍, 王曙光, 等. 六倍体小黑麦种质资源遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2006, 21(6): 33-36.
[9] 郭光艳, 李瑞芬, 张敬原, 等. 利用SSR鉴定普通小麦-多枝赖草二体异附加系Line24中外源染色体同源群的归属[J]. 华北农学报, 2004, 19(4): 14-17.
[10] 耿以礼, 陈守良. 国产鹅观草属之订正[J]. 南京大学学报, 1963, 3: 1-92.
[11] 郭本兆. 中国植物志[M]. 第9卷, 第3分册. 北京: 科学出版社, 1987, 9(3): 7-104.
[12] 蔡联炳. 中国鹅观草属的分类研究[J]. 植物分类学报, 1997, 35(2): 148-177.
[13] 顾佳清. 小麦赤霉病抗性遗传的研究[J]. 中国农业科学, 1983, 20(6): 61-64.
[14] 翁益群, 刘大钧. 鹅观草与普通小麦属间杂种F1的形态、赤霉病抗性和细胞遗传学研究[J]. 中国农业科学, 1989, 22(5): 1-7.
[15] 卢宝荣. 小麦族遗传资源的多样性及其保护[J]. 生物多样性, 1995, 3(2): 63-68.
[16] 蔡联炳. 根据外部形态特征试论鹅观草属的亲缘演化关系[J]. 西北植物学报, 1988, 18(4): 606-612.
[17] 杨瑞武, 周永红, 郑有良. 披碱草属, 鹅观草属何猬草属模式种的形态学变异和酯酶同工酶分析[J]. 四川农业大学学报, 2000, 18(4): 291-295.
[18] 卢宝荣, 颜济, 杨俊良. 鹅观草属三个种的染色体分析与同工酶分析[J]. 云南植物研究, 1988, 10(3): 261-270.
[19] 卢宝荣, 颜济, 杨俊良. 分布于日本和中国的鹅观草及其杂种的形态学和细胞学研究[J]. 云南植物研究, 1990, 12(3): 237-246.
[20] 周永红, 郑有良. 小麦特异种质资源研究[M]. 成都: 四川科学技术出版社, 1999: 111-135.
[21] 周永红, 杨俊良, 郑有良, 等. 用RAPD分子标记探讨鹅观草属的种间关系[J]. 植物学报, 1999, 41(10): 1076-1081.
[22] 侯永翠, 颜泽洪, 兰秀锦, 等. 利用RAMP和ISSR标记分析大麦种质资源的遗传多样性[J]. 中国农业科学, 2005, 38(12): 2555-2565.
[23] 张木清, 洪艺, 李奇伟, 等. 中国斑茅种质资源分子多态性分析[J]. 植物资源与环境学报, 2004, 13(1): 1-6.
[24] 尚海英, 郑有良, 魏育明, 等. 应用ISSR标记研究黑麦草属植物遗传多样性[J], 西南农业学报, 2004, 17(3): 273-277.
[25] 杜金昆, 姚颖垠, 倪中福, 等. 普通小麦、斯卑尔脱小麦、密穗小麦和轮回选择后代材料ISSR分子标记遗传差异研究[J]. 遗传学报, 2002, 29(5): 445-452.
[26] Prevost A, Wilkinson J. A new system of comparing PCR primers applied to ISSR fingerprinting of potato cultivars[J]. Theor Appl Genet, 1998, 98: 107.

选择文件类型/文献管理软件名称

选择包含的内容