直接扩增甜瓜小卫星DNA指纹图谱

doi:10.3321/j.issn:1000-7091.2006.03.018

华北农学报 ›› 2006, Vol. 21 ›› Issue (3): 77-80. doi: 10.3321/j.issn:1000-7091.2006.03.018

所属专题： 甜瓜；

直接扩增甜瓜小卫星DNA指纹图谱

王掌军^1,2, 王建设¹, 刘玲¹, 刘生祥², 陈素生², 许勇¹, 王永健¹

1. 国家蔬菜工程技术研究中心, 北京 100089;
2. 宁夏大学农学院, 宁夏银川 750021

收稿日期:2005-07-23 出版日期:2006-06-28
通讯作者: 王建设
作者简介:王掌军（1978- ），男，甘肃天水人，硕士，主要从事分子遗传育种研究工作。
基金资助:
国家863高科技发展计划项目（2002AA₂44021）；北京市重大科技合同项目（H022020130130）

Direct Amplification Minisatellite DNA Fingerprinting on Melon(Cucumis melo L)

WANG Zhang-jun^1,2, WANG Jian-she¹, LIU Ling¹, LIU Sheng-xiang², CHEN Su-sheng², XU Yong¹, WANG Yong-jian¹

1. National Engineering Research Center for Vegetables, Beijing 100089, China;
2. Agricutural College of Ningxia University, Yinchuan 750021, China

Received:2005-07-23 Published:2006-06-28

摘要/Abstract

摘要： 以小卫星DNA YNZ22核心序列为引物，甜瓜DNA为模板，在甜瓜上研究了直接扩增小卫星DNA（DAMD）的优化反应体系，结果表明：在20μL的反应体系中，5种主要成分Taq DNA聚合酶、Mg²⁺、引物、模板DNA和dNTPs的最适浓度分别为1U，2.5mmol/L，0.5mmol/L，30ng，5mmol/L。在优化的DAMD-PCR反应体系下，利用该引物在28个甜瓜品种上构建了直接扩增小卫星DNA（DAMD）的指纹图谱，分析结果表明，该引物在28个甜瓜品种上共扩增出13位点，其中9位点具有多态性，多态性条带比率为69%，可一次性从28个甜瓜品种中鉴别出其中的21个，鉴别率高达75%。

关键词: 甜瓜, 小卫星DNA, 指纹图谱

Abstract: The optimal reaction of DAMD(Direct Amplification of Minisatellite DNA by PCR) in melon was studied with a minisatellite primer YNZ22 and melon template DNA.The results showed that the optimum concentration of five important components i.e.Taq DNA polymerase,Mg²⁺,primer,template DNA and dNTPs in 20μL reaction system were 1U,2.5mmol/L,0.5mmol/L,30 ng,5mmol/L respectively.The minisatellite DNA fingerprinting of 28 melon cultivars were established by using optimum system with primer YNZ22.The primer could produce 13 bands,and 9 bands were polymorphic bands,the percentage of polymorphic bands(PPB) was 69%.The primer could identify 21 of 28 cultivars at once,its identification rate was 75%.

Key words: Cucumis melo, Minisatellite DNA, Fingerprinting map

中图分类号:

S652

王掌军, 王建设, 刘玲, 刘生祥, 陈素生, 许勇, 王永健. 直接扩增甜瓜小卫星DNA指纹图谱[J]. 华北农学报, 2006, 21(3): 77-80. doi: 10.3321/j.issn:1000-7091.2006.03.018.

WANG Zhang-jun, WANG Jian-she, LIU Ling, LIU Sheng-xiang, CHEN Su-sheng, XU Yong, WANG Yong-jian. Direct Amplification Minisatellite DNA Fingerprinting on Melon(Cucumis melo L)[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2006, 21(3): 77-80. doi: 10.3321/j.issn:1000-7091.2006.03.018.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2006/V21/I3/77

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