白粉菌诱导的番茄叶片AD-cDNA文库的构建及初步分析

doi:10.7668/hbnxb.2015.02.009

华北农学报 ›› 2015, Vol. 30 ›› Issue (2): 47-50. doi: 10.7668/hbnxb.2015.02.009

所属专题： 番茄；

白粉菌诱导的番茄叶片AD-cDNA文库的构建及初步分析

刘严^1,2, 张怡², 康静敏^1,2, 刘柯², 张超², 李鹏坤², 安一博², 周晗², 黄辉², 李成伟²

1. 郑州大学生命科学学院, 河南郑州 450001;
2. 周口师范学院植物遗传与分子育种重点实验室, 河南周口 466001

收稿日期:2015-02-20 出版日期:2015-04-28
通讯作者: 李成伟(1972-),男,河南商丘人,教授,博士,博士生导师,主要从事植物与微生物互作研究。
作者简介:刘严(1989-),女,河南鹤壁人,硕士,主要从事植物与微生物互作研究。
基金资助:
国家自然科学基金项目(31071807;31272168)

Construction and Primary Analysis of Tomato Leaf AD-cDNA Library Induced by Powdery Mildew Fungus

LIU Yan^1,2, ZHANG Yi², KANG Jing-min^1,2, LIU Ke², ZHANG Chao², LI Peng-kun², AN Yi-bo², ZHOU Han², HUANG Hui², LI Cheng-wei²

1. School of Life Sciences, Zhengzhou University, Zhengzhou 450001, China;
2. Key Laboratory of Plant Genetics and Molecular Breeding, Zhoukou Normal University, Zhoukou 466001, China

Received:2015-02-20 Published:2015-04-28

摘要/Abstract

摘要： 为了研究番茄白粉菌与番茄相互作用的分子机制,以白粉菌诱导的番茄叶片为材料,利用SMART技术构建了番茄的AD-cDNA文库。该文库总库容量为3.77×10¹⁰ cfu,重组率达到96%,插入片段长400～2 000 bp,平均长度约为1 000 bp。随机挑取50个克隆进行测序,利用生物信息学软件进行初步分析,表明获得的文库质量较高。

关键词: 番茄, 番茄白粉菌, SMART技术, AD-cDNA文库

Abstract: In order to study the interaction between powdery mildew fungus and tomato, the AD-cDNA library of tomato leaves infected by Oidium neolycopersici was constructed using SMART technology.The titer of the constructed cDNA library was 3.77×10¹⁰ cfu, and the recombination rate of the library was about 96%, the insert fragments ranged from 400 bp to 2 000 bp, and the average length of the library was about 1 000 bp.Fifty clones were randomly picked from the library for sequencing and functional analysis.The results indicated that the library was qualified for the study on the interaction between powdery mildew fungus and tomato.

Key words: Tomato, Oidium neolycopersici, SMART technology, AD-cDNA library

中图分类号:

Q78
S436.412

刘严, 张怡, 康静敏, 刘柯, 张超, 李鹏坤, 安一博, 周晗, 黄辉, 李成伟. 白粉菌诱导的番茄叶片AD-cDNA文库的构建及初步分析[J]. 华北农学报, 2015, 30(2): 47-50. doi: 10.7668/hbnxb.2015.02.009.

LIU Yan, ZHANG Yi, KANG Jing-min, LIU Ke, ZHANG Chao, LI Peng-kun, AN Yi-bo, ZHOU Han, HUANG Hui, LI Cheng-wei. Construction and Primary Analysis of Tomato Leaf AD-cDNA Library Induced by Powdery Mildew Fungus[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2015, 30(2): 47-50. doi: 10.7668/hbnxb.2015.02.009.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2015/V30/I2/47

参考文献

[1] Ariizumi T,Shinozaki Y,Ezura H.Genes that influence yield in tomato[J].Breeding Science,2013,63(1):3-13.
[2] Jones H,Whipps J M,Guu S J.The tomato powdery mildew fungus Oidium neolycopersici[J].Molecular Plant Pathology,2001(2):303-309.
[3] Lindhout P,Beek H,Pet G.Wild Lycopersicon species as sources for resistance to powdery mildew (Oidium lycopersicum):mapping of the resistance gene Ol- 1 on chromosome 6 of L.hirsutum[J].Acta Hort,1993(376):387-394.
[4] Huibers R P,Loonen A M,Gao D,et al.Powdery mildew resistance in tomato by impairment of SlPMR4and SlDMR1[J].PLoS One,2013,8(6):e67467.
[5] 贾菊生.新疆番茄病害一新记录——番茄白粉病[J].植物保护,1990,16(4):54.
[6] 程志明.黑龙江番茄新病害——番茄白粉病[J].北方园艺,1992(6):40.
[7] 王媛媛,陈立杰,段玉玺,等.沈阳地区温室番茄发生白粉病[J].植物保护,2004,30(5):91-91.
[8] 刘微,刘淑艳,李玉,等.番茄白粉病的病原菌鉴定[J].植物病理学报,2009,39(1):11-15.
[9] 李成伟.番茄与白粉菌互作的细胞学和转录组学分析[D].北京:中国农业科学院,2007.
[10] Kiss L,Cook R A,Saenz G S,et al.Identification of two powdery mildew fungi,Oidium neolycopersici sp.nov.and O.lycopersici,infecting tomato in different parts of the world[J].Mycological Research,2001,105(6):684-697.
[11] Spanu P D,Abbott J C,Amselem J,et al.Genome expansion and gene loss in powdery mildew fungi reveal tradeoffs in extreme parasitism[J].Science,2010,330(610):1543-1546.
[12] Colin P L,Nprris S R,Wheeler G L,et al.Genetic evidence for the role of GDP-mannose in plant ascorbic acid (vitaminec) biosynthesis [J].Proe Natl Acad Sci USA,1999(96):4198-4203.
[13] 蔡宁波,黄湘文,庄伟建.花生种子全长cDNA文库的构建和鉴定[J].花生学报,2007,36(2):1-5.
[14] 朱利军,长孙东亭,罗素兰.全长cDNA文库构建方法及应用研究[J].海南大学学报:自然科学版,2009,27(2):185-190.
[15] 张冲,蔡铁城,陈华,等.青枯菌诱导的烟草叶片全长cDNA文库的构建和初步分析[J].分子植物育种,2013,11(5):624-629.
[16] Ezaki J,Ezaki M T,Koike M,et al.Characterizations of Cln3p,the gene product responsible for juvenile neuronal ceroid lipofuscinosis,as a lysosomal integral membrane glycoprotein[J].J Neurochem,2003(87):1296-1308.
[17] Ezaki J,Tanida I,Kanehagi N,et al.Alysosomal proteinase,the late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis gene(CLN2)product,is essential for degradation of a hydrophobic protein,the subunit c of ATP synthase[J].Journal of Neurochemistry,1999,72(6):2573-2583.
[18] Golabek A A,Kida E,Walus M,et al.CLN3 proteins regulates lysosomal pH and alters intracellular processing of Alzheimer's amyloid-β protein precursor and cathepsin D in human cells[J].Mol Genet Metab,2000(70):203-213.
[19] Puranam K L,Guo W X,Qian W H,et al.CLN3 defines a novel antiapototic pathway operative in neurodegeneration and mediated by ceramide[J].Mol Genet Metab,1999(66):294-308.
[20] 彭强,吴昌银.水稻抽穗期基因酵母双杂交cDNA文库的构建及分析[J].华中农业大学学报,2012,31(4):404-409.
[21] Zhu Y Y,Machleder E M,Chenchik A,et al.Reverse transcriptase template switching:a SMART approach for full-length cDNA library construction[J].BioTechniques,2001,30(4):892-897.
[22] Wellenreuther R,Schupp I,Poustka A,et al.SMART amplification combined with cDNA size fractionation in order to obtain large full-length clones[J].BMC Genomics,2004,5(1):36.
[23] 张娟,张军鸽,李秀花,等.芜菁夜蛾斯氏线虫G26侵染期幼虫cDNA文库的构建及表达序列标签分析[J].华北农学报,2008,23(6):72-76.
[24] 许延芳,潘丽娜,刘晓颖,等.小麦cDNA文库构建方法的改进及优化[J].天津农业科学,2012,18(3):22-25.
[25] 王清连,石明旺.野生大豆种子cDNA文库构建及其球蛋白基因克隆[J].河南农业科学,2006(1):29-32.
[26] Sato S,Tabata S,Hirakawa H,et al.The tomato genome sequence provides insights into fleshy fruit evolution[J].Nature,2012,485(740):635-641.
[27] 程宇,蔺瑞明,欧阳宏雨,等.小麦条锈菌诱导性小麦cDNA文库的构建及其质量评价[J].分子植物育种,2009,7(1):184-187.

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[1]	李万星, 李丹, 李小霞, 曹晋军, 靳鲲鹏, 韩文清, 苏秀敏, 王佼, 黄学芳, 刘永忠. 不同轮作模式对旱地番茄品质、产量及土壤真菌多样性的影响[J]. 华北农学报, 2022, 37(4): 82-89.
[2]	贾志强, 许云玉, 高雪, 陶宏征, 陈增敏, 刘雅婷, 李永忠. *辣椒CaWRKY30转录因子的克隆、亚细胞定位及番茄斑萎病毒侵染下的表达分析*[J]. 华北农学报, 2022, 37(3): 186-192.
[3]	史建磊, 熊自立, 苏世闻, 王克磊, 宰文珊. 基于RNA-seq的番茄青枯病响应基因鉴定与表达分析[J]. 华北农学报, 2022, 37(2): 171-182.
[4]	吴红红, 段学粉, 郭仰东, 张喜春. *转录因子SlMYB-related 2对番茄耐冷性的影响*[J]. 华北农学报, 2022, 37(1): 35-41.
[5]	宋雅欣, 赵同科, 安志装, 马茂亭. 有机无机肥料配施对设施番茄产量及土壤养分含量的影响[J]. 华北农学报, 2021, 36(S1): 306-311.
[6]	杨官凯, 武育芳, 曹行行, 王晓东, 张雪艳. 微咸水灌溉对玉米秸秆有机复合基质番茄生长及品质特性的影响[J]. 华北农学报, 2021, 36(S1): 81-88.
[7]	金凤媚, 薛俊, 孙海波, 郝志愚. 基于小RNA技术的天津地区番茄花叶病毒分子检测与基因组部分序列分析[J]. 华北农学报, 2021, 36(5): 176-183.
[8]	代惠洁, 程琳, 曹慧, 竺晓平, 赵静. 烟粉虱取食ToCV侵染番茄对其解毒酶和保护酶基因表达的影响[J]. 华北农学报, 2021, 36(4): 172-183.
[9]	耿鑫鑫, 于丽杰, 陈超, 金晓霞. *番茄SlUDP基因的克隆及其在镉、干旱和盐胁迫中的响应分析*[J]. 华北农学报, 2021, 36(2): 46-53.
[10]	王茹, 陈超, 于丽杰, 金晓霞. *番茄SlWRKY6基因克隆及其在重金属胁迫下的表达分析*[J]. 华北农学报, 2021, 36(1): 54-62.
[11]	刘子记, 刘维侠, 牛玉, 杨衍. 嫁接对黄色樱桃番茄果实风味物质的影响[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 176-182.
[12]	何世朋, 梁斌, 武德军, 王群艳, 李俊良. 设施菜地番茄的养分需求规律[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 282-288.
[13]	李丽梅, 杨超沙, 张立永, 尹庆珍, 毛向宏. 优质番茄种质资源品质分析及综合评价[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 85-92.
[14]	姜莉莉, 王开运, 武玉国, 王开元, 王红艳. 施用生物有机肥对番茄果实品质及土壤生物学特性的影响[J]. 华北农学报, 2020, 35(6): 141-147.
[15]	杨向云, 刘方, 赵芊, 宋水山, 张利平. N-3-羰基十四烷酰基高丝氨酸内酯诱导番茄对灰霉病抗性机制初探[J]. 华北农学报, 2020, 35(4): 169-176.

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