东北雅罗鱼微卫星分子标记的筛选及特征分析

doi:10.7668/hbnxb.2011.01.019

华北农学报 ›› 2011, Vol. 26 ›› Issue (1): 87-93. doi: 10.7668/hbnxb.2011.01.019

所属专题： 水产；

东北雅罗鱼微卫星分子标记的筛选及特征分析

刘金亮^1,2, 常玉梅¹, 徐丽华^1,2, 刘春雷^1,2, 梁利群¹, 韩国苍³, 高玉奎³, 柳玉海³

1. 中国水产科学院黑龙江水产研究所，黑龙江哈尔滨150070;
2. 上海海洋人学水产与生命学院，上海201306;
3. 赤峰市克什克腾旗达里诺日渔场，内蒙古赤峰024000

收稿日期:2010-12-12 出版日期:2011-02-28
通讯作者: 梁利群(1963－ )，女，黑龙江哈尔滨人，研究员，博士，主要从事水产动物功能基因研究。
作者简介:刘金亮(1984－ )，男，山东枣庄人，硕士研究生，主要从事色类基因工程育种研究。
基金资助:
国家“863”计划项目(2007AA10Z186)；水产分子育种共性技术的建立与应用项目(200903045)

Isolation and Characterization of Microsatellite from Genome of Leuciscus waleckii Dybowski

LIU Jin-liang^1,2, CHANG Yu-mei¹, XU Li-hua^1,2, LIU Chun-lei^1,2, LIANG Li-qun¹, HAN Guo-cang³, GAO Yu-kui³, LIU Yu-hai³

1. Heilongjiang River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Harbin 150070, China;
2. College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China;
3. Dalinuori of Fishery of Keshiketeng Banner, Chifeng 024000, China

Received:2010-12-12 Published:2011-02-28

摘要/Abstract

摘要： 通过磁珠富集法筛选东北雅罗鱼的微卫星分子标记。采用限制性内切酶Sau3AI对东北雅罗鱼基因组DNA进行酶切，选取400～900bp的片段进行PCR全基因组扩增，并利用生物素标记的(CAG)8、(TGA)8、(AGAT)6、(GATT)64个探针进行微卫星片段的富集。将得到的片段与T载体连接后转入DH5α大肠杆菌中，然后以SaulA为引物对长出的菌落进行PCR扩增，挑取扩增后片段大小符合条件的菌落送生物公司测序。结果表明:1416个阳性克隆中有1047个克隆含有重复次数大于5次的微卫星序列，完美型占67.99%，非完美型为15.31%；混合性标记占16.70%。从中选出160个微卫星序列设计105对引物并合成，经过筛选，56对引物可扩增出清晰条带，其中23对具有多态性。选取18对多态性引物对达里湖东北雅罗鱼群体进行扩增，结果显示等位基因数为3～11，多态信息含量(PIC)为0.2077～0.8820，67%(12对/18对)的位点处于高度多态水平(PIC>0.5)。

关键词: 东北雅罗鱼, 微卫星, 磁珠富集

Abstract: Magnetic beads enriched method was used to isolate microsatellite DNA from Leuciscus waleckii Dy-bowski genome.We design 105 pairs of primersfrom 160 microsatellite sequence and compose them.

Key words: Leucascus waleckaa Dybowski, Microsatellite, Enrichment by magnetic bead

中图分类号:

S917.4

刘金亮, 常玉梅, 徐丽华, 刘春雷, 梁利群, 韩国苍, 高玉奎, 柳玉海. 东北雅罗鱼微卫星分子标记的筛选及特征分析[J]. 华北农学报, 2011, 26(1): 87-93. doi: 10.7668/hbnxb.2011.01.019.

LIU Jin-liang, CHANG Yu-mei, XU Li-hua, LIU Chun-lei, LIANG Li-qun, HAN Guo-cang, GAO Yu-kui, LIU Yu-hai. Isolation and Characterization of Microsatellite from Genome of Leuciscus waleckii Dybowski[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2011, 26(1): 87-93. doi: 10.7668/hbnxb.2011.01.019.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2011/V26/I1/87

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