利用微卫星标记鉴定扁蓿豆种质资源

doi:10.7668/hbnxb.2008.03.018

华北农学报 ›› 2008, Vol. 23 ›› Issue (3): 67-71. doi: 10.7668/hbnxb.2008.03.018

利用微卫星标记鉴定扁蓿豆种质资源

李鸿雁^1,2, 李志勇², 米福贵¹, 卢新雄³, 师文贵²

1. 内蒙古农业大学, 内蒙古, 呼和浩特, 010010;中国农业科学院, 草原研究所, 内蒙古呼和浩特, 010010;
2. 中国农业科学院, 草原研究所, 内蒙古呼和浩特, 010010;
3. 内蒙古农业大学, 内蒙古, 呼和浩特, 010010;
4. 中国农业科学院, 作物品种资源研究所, 北京, 100081

收稿日期:2008-03-20 出版日期:2008-06-28
通讯作者: 米福贵(1959- ).男.内蒙古凉城人.教授.博士生导师.主要从事牧草遗传育种研究。
作者简介:李鸿雁(1964-),女,辽宁锦州人,副研究员,在读博士,主要从事牧草种质资源的研究.
基金资助:
国家科技基础条件平台建设项目(2006DKA21001-26);农业部作物种质资源保护项目(NB307-2130135-42)

Appraisal of Medicago Ruthenica Germplasms by SSR Markers

LI Hong-yan^1,2, LI Zhi-yong², MI Fu-gui¹, LU Xin-xiong³, SHI Wen-gui²

1. Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010010, China;
2. Grassland Institute of Chinese Academy of Agriculture Sciences, Hohhot 010010, China;
3. Institute of Crop Science, Chinese Academy of Agriculture Sciences, Beijing 100081, China

Received:2008-03-20 Published:2008-06-28

摘要/Abstract

摘要： 对扁蓿豆种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析,为育种者选择亲本和种质资源的开发提供理论依据。采用微卫星分子标记对来自内蒙古野生扁蓿豆种质资源50份材料进行鉴定。用8份扁蓿豆基因组DNA从89对截形苜蓿SSR引物中鉴定筛选出扩增带单一、稳定清晰且多态性强的18对引物。用这18对引物,对扁蓿豆材料的DNA进行SSR扩增,以研究其遗传多态性。结果共检测到109个等位位点,平均每对引物扩增出6.1个等位位点。6对SSR引物BI4BO3,MTIC272,MAL369471,MTIC237,MTIC188和MTIC27对于检测扁蓿豆遗传变异最有效。供试材料间遗传距离介于0.023 6~0.807 5,平均遗传距离为0.177 8。聚类分析构建了亲缘关系树状图,大致分为9大类。

关键词: 扁蓿豆, 微卫星标记, 多态性聚类分析

Abstract: Eighteen reproducible and informative SSR primer pairs were selected from the 89 pairs of primers of Medicago truncatula.In 8 genome DNA of Medicago ruthenica.And a representative set of 50 wild Medicago ruthenica genetic resources from Inner Mongolian were analyzed by SSR methodology using the informative primer paris for their diversity of genetic.The results showed a total of 109 alleles were detected with an average of 6.1 alleles per SSR primer pair.According to integrated evaluation,6 SSR primer pair,BI4BO3,MTIC272,MAL369471,MTIC237,MTIC188 and MTIC27 were most effective for genetic diversity studies on Medicago ruthenica.The genetic distances among the germplasms ranged between 0.023 6 and 0.807 5 with their average at 0.177 8.By cluster analysis with sum of squares for microsatellite showed that 50 accessions can be divided into 9 groups with different characteristics which could afford reference in deeper research on Medicago ruthenica.

Key words: Medicago ruthenica, M icrosatellite, Polymorphism, Cluster anlysis

中图分类号:

李鸿雁, 李志勇, 米福贵, 卢新雄, 师文贵. 利用微卫星标记鉴定扁蓿豆种质资源[J]. 华北农学报, 2008, 23(3): 67-71. doi: 10.7668/hbnxb.2008.03.018.

LI Hong-yan, LI Zhi-yong, MI Fu-gui, LU Xin-xiong, SHI Wen-gui. Appraisal of Medicago Ruthenica Germplasms by SSR Markers[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2008, 23(3): 67-71. doi: 10.7668/hbnxb.2008.03.018.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2008/V23/I3/67

参考文献

[1] Panaud O,Chen X,Mccouch S R,Frequeney of microsatellite sequence in rice (Oryza sativa L.)[J].Mogengenet,1995,38:1170-1176.

[2] 赵君,苏翻身,于长虹,等.几种常用的分子标记技术的比较[J].内蒙古农业科技,1999(3):32-33.

[3] Bryan G J,Collins A J,Stephenson P,et al.Isolation and characterization of micro satellite from bexaploid breed wheat[J].Theor Appl Genet,1997,5(94):557-563.

[4] Bryan G J,Collns A J,Stephenso N P,et al.Isolation and characterization of micro satellite from hexaploid breed wheat[J].Theor Appl Genet,1997,5(94):557-563.

[5] 王铁固,库丽霞,陈彦惠,等.利用SSR分析玉米群体的遗传变异[J].华北农学报,2005,20(5):13-16.

[6] Rongwe N J,Akkaya M S,Bhagwat A A,et al.The use of mi-crosatellite DNA marker for soybean genotype identifi-cation[J].Tbeor Appl Genet,1995,90:43-48.

[7] 魏臻武.利用SSR、ISSR和RAPD技术构建苜蓿基因组DNA指纹图谱[J].草业学报,2004,13(3):62-67.

[8] 刘志鹏,杨青川,呼天明,等.用SSR标记研究不同耐盐特性四倍体紫花苜蓿的遗传多样性[J].作物学报,2006,32(4):630-632.

[9] 李恋.生物技术在植物育种上的新应用[J].内蒙古农业科技,2006(3):52-54,56.

[10] 肖海峻,孟利前,李玉冰.ISSR分子标记及其在植物遗传育种中的应用[J].内蒙古农业科技,2006(4):31-33.42.

[11] 宁布,杜一民,陈山.内蒙古扁蓿豆属植物研究草地生物多样性保护研究[M].呼和浩特:内蒙古大学出版社,1995.

[12] 杨青川,耿华珠,孙彦.十种扁蓿豆生态型的研究/[J].草业科学,1995(2):13-16.

[13] 石凤翎,郭晓霞,高翠萍.扁蓿豆抗旱形态解剖结构观察与分析[J].干旱地区农业研究,2005,23(2):115-119.

[14] 额尔敦嘎日迪.内蒙古中东部野生扁蓿豆形态特征多变量分析[J].中国草地学报,2006,28(4):87-90.

[15] 乌日娅,雍世鹏,包贵平.扁蓿豆生态生物学特性的比较研究[J].中国草地,1994(2):1-7.

[16] 李红,罗新义,王殿魁,等.扁蓿豆与肇东苜蓿杂交育种的研究[J].中国草地,1990(6):20-23.

[17] Sambreok J,Russell D W.分子克隆试验指南[M].黄培常,译.3版.北京:科学出版社,2002.

[18] 韩文革,于晓春.聚类分析在鹰嘴豆农艺性状分类上的应用[J].内蒙古农业科技,2006(6):40-41,45.

[19] Condit R,Hubbell.Abundance and DNA sequence of two base repeat regions in tropical tree genomes[J].Genomes,1991,32:66-71.

[20] 孙建萍,袁庆华.利用微卫星分子标记研究我国16份披碱草遗传多样性[J].草业科学,2006,8(23);40-44.

[21] 许占友,邱丽娟,常汝镇,等.利用SSR标记鉴定大豆种质资源[J].中国农业科学,1999,32(1):40-48.

[22] 王黎明,李兴锋,刘树兵,等.小麦微卫星标记在中间偃麦草中通用性研究[J].华北农学报,2007,22(6):50-52.

[23] 郭光艳,李瑞芬,张敬原,等.小麦微卫星引物对多枝赖草基因组DNA扩增的研究[J].华北农学报,2004,19(1).1-4.

选择文件类型/文献管理软件名称

选择包含的内容

利用微卫星标记鉴定扁蓿豆种质资源

Appraisal of Medicago Ruthenica Germplasms by SSR Markers

PDF

可视化

被引次数

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 13

编辑推荐

Metrics

本文评价

[1]	李鸿雁, 卢新雄, 辛霞, 李志勇, 李俊, 黄帆, 刘磊. 采用AFLP和SSR标记对扁蓿豆遗传多样性进行比较分析[J]. 华北农学报, 2017, 32(2): 124-130.
[2]	佟广香, 匡友谊, 张永泉, 尹家胜. 微卫星标记在濒危哲罗鱼增殖放流中的应用[J]. 华北农学报, 2015, 30(S1): 38-45.
[3]	李志勇, 李鸿雁, 蔡丽艳, 师文贵, 黄帆, 刘磊, 解永风. 中国扁蓿豆种质资源遗传多样性的ISSR标记与生态因子相关性分析[J]. 华北农学报, 2014, 29(6): 94-100.
[4]	姜波, 王云月. 元阳传统水稻品种月亮谷种内遗传多样性研究[J]. 华北农学报, 2013, 28(S1): 85-90.
[5]	秦君, 张孟臣, 陈维元, 常汝镇, 邱丽娟. 基于分子和表型性状的大豆骨干品种遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2013, 28(1): 19-26.
[6]	佟广香, 匡友谊, 张超, 尹家胜. 哲罗鱼生长速度相关性状的微卫星标记筛选[J]. 华北农学报, 2012, 27(S1): 33-39.
[7]	蔡丽艳, 孙启忠, 李志勇, 李鸿雁, 师文贵, 刘磊. 干旱胁迫和复水对扁蓿豆幼苗生理特性的影响[J]. 华北农学报, 2012, 27(6): 107-112.
[8]	刘磊, 王宗礼, 李志勇, 师文贵, 李鸿雁, 赵俊喜. 利用ISSR标记解析胡卢巴和扁蓿豆、黄花苜蓿的亲缘关系[J]. 华北农学报, 2012, 27(4): 85-88.
[9]	李志勇, 李鸿雁, 孙启忠, 王小丽, 师文贵, 邢建军. 正交设计优化扁蓿豆ISSR反应体系的研究(英文)[J]. 华北农学报, 2010, 25(6): 97-103.
[10]	袁青妍, 陶争荣, 李国勤, 沈军达, 陈奕春, 陈文标, 王德前, 虞永亮, 田勇, 原爱平, 卢立志. 绍兴鸭微卫星DNA遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2010, 25(3): 73-75.
[11]	李志勇, 师文贵, 于林清, 赵成贵, 李鸿雁. 不同生态区扁蓿豆野生居群种子产量性状遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2010, 25(1): 99-103.
[12]	丁效华, 张泽民, 曾瑞珍, 张桂权. *水稻粳型亲籼系S-c座位基因型分析*[J]. 华北农学报, 2007, 22(4): 5-8.
[13]	白文林, 尹荣焕, 赵素君, 曹亮, 罗光彬, 姜午旗. 林甸鸡和大骨鸡微卫星DNA标记遗传多样性的比较研究[J]. 华北农学报, 2005, 20(6): 24-27.

模态框（Modal）标题

选择文件类型/文献管理软件名称

选择包含的内容

利用微卫星标记鉴定扁蓿豆种质资源

Appraisal of Medicago Ruthenica Germplasms by SSR Markers

PDF

可视化

被引次数

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 13

编辑推荐

Metrics

本文评价