大豆公共遗传图谱C1连锁群SSR标记空白区段的填补

doi:10.3969/j.issn.1000-7091.2012.06.002

华北农学报 ›› 2012, Vol. 27 ›› Issue (6): 5-10. doi: 10.3969/j.issn.1000-7091.2012.06.002

所属专题： 油料作物；

大豆公共遗传图谱C1连锁群SSR标记空白区段的填补

雷雅坤^1,2, 闫龙¹, 杨春燕¹, 宋晓昆¹, 张孟臣¹, 黄占景²

1. 河北省农林科学院粮油作物研究所, 国家大豆改良中心石家庄分中心, 河北省遗传育种重点实验室, 河北石家庄 050031;
2. 河北师范大学生命科学学院, 河北石家庄 050016

收稿日期:2012-09-30 出版日期:2012-12-28
通讯作者: 张孟臣(1956-)，男，河北衡水人，研究员，硕士，主要从事大豆遗传育种研究;黄占景(1957-)，男，河北深县人，教授，博士生导师，主要从事植物分子生物学研究。
作者简介:雷雅坤(1985-)，女，河北唐山人，硕士，主要从事植物生物化学与分子生物学研究。
基金资助:
国家"863"计划(2006AA10Z1B3;2012AA101106);国家自然科学基金(31000719);国家转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08009-088B);国家现代农业产业技术体系(CARS-004-PS06)

Complete the Blank Section with SSR Markers on Linkage Group C1 of Public Genetic Map in Soybean

LEI Ya-kun^1,2, YAN Long¹, YANG Chun-yan¹, SONG Xiao-kun¹, ZHANG Meng-chen¹, HUANG Zhan-jing²

1. Institute of Cereal and Oil Crops, Hebei Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Shijiazhuang Branch Center of National Center for Soybean Improvement, North China Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Soybean, Hebei Genetic Breeding Laboratory, Shijiazhuang 050031, China;
2. College of Life Science, Hebei Normal University, Shijiazhuang 050016, China

Received:2012-09-30 Published:2012-12-28

摘要/Abstract

摘要： 为进一步饱和大豆公共图谱SSR标记,以大豆育成品种冀豆12×地方品种ZDD03651组合的211个F6株系为作图群体,以Kosambi作图函数构建SSR标记遗传连锁图谱。结果表明,栽培大豆冀豆12与大豆地方品种ZDD03651间SSR标记多态率为44.6%,遗传图谱包含21个连锁群,117个SSR标记,遗传距离总长度1 501 cM,标记间平均距离15.6 cM,其中包含8个偏分离标记。与公共遗传图谱相比,位点间排列顺序、遗传距离和偏分离位点比例基本相同。将SSR新标记Barcsoyssr₄₁181、Barcsoyssr₄₁201、Barcsoyssr₄₁235和Barcsoyssr₅₁266整合到C1连锁群上,填补了国际大豆公共遗传图谱中C1连锁群94.62～120.12 cM之间的SSR标记空白区段。

关键词: 地方品种, 遗传图谱, 偏分离, SSR

Abstract: Cross was made using bred varieties Jidou 12 × landrace soybean ZDD03651，get F6 RIL population with 211 single plants as the mapping population，construction of a SSR genetic linkage map with Kosambi mapping function， In order to saturate with SSR markers on public genetic map in the further． The polymorphic ratio was 44. 6% of SSR markers between Jidou 12 and ZDD03651． A total of 117 pairs of SSR markers on genetic linkage map， including 8 pairs distorted SSR markers，The resulting genetic linkage map covered 1 501 cM，with an average inter-marker distance of 15． 6 cM， including 21 linkage groups． Compared with public genetic map， the order between points，genetic distance and the proportion of distorted markers basically the same． And eventually the development of new molecular markers Barcsoyssr_4_1181，Barcsoyssr_4_1201，Barcsoyssr_4_1235，Barcsoyssr_5_1266 linked to the C1 linkage map， in order to complete the blank section on linkage group C1 between 94． 62 cM and 120． 12 cM in the international．

Key words: Landrace, Genetic mapping, Segregation distortion, SSR

中图分类号:

雷雅坤, 闫龙, 杨春燕, 宋晓昆, 张孟臣, 黄占景. 大豆公共遗传图谱C1连锁群SSR标记空白区段的填补[J]. 华北农学报, 2012, 27(6): 5-10. doi: 10.3969/j.issn.1000-7091.2012.06.002.

LEI Ya-kun, YAN Long, YANG Chun-yan, SONG Xiao-kun, ZHANG Meng-chen, HUANG Zhan-jing. Complete the Blank Section with SSR Markers on Linkage Group C1 of Public Genetic Map in Soybean[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2012, 27(6): 5-10. doi: 10.3969/j.issn.1000-7091.2012.06.002.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2012/V27/I6/5

参考文献

[1] 李晓伟，黄红英．大豆利用价值及高产栽培技术[J]．安徽农学通报， 2011， 17( 16) : 209-210．
[2] 邱丽娟，常汝镇，孙建英，等．中国大豆品种资源的评价与利用前景[J]．中国农业科技导报， 2000( 5) : 58-61．
[3] 卢圣栋．现代分子生物学实验技术[M]．第2 版．北京:中国协和医科大学出版社， 1999．
[4] APuya N R，Frazier B L，Keim P， et al． Restriction fragment length Polymer-Phismsasgenetic markers in soybean， Glyeinemax ( L． ) Merr ill[J]． Theor APPI Genet， 1988， 75: 889-901．
[5] Cregan P B， Jarvik T，Bush A L， et al． An integrated genetic linkage map of the soybean genome [J]． Crop Science， 1999， 39( 5) : 1464-1490．
[6] Song Q J，Marek L F，Shoemaker R C， et al． A new integrated genetic linkage map of the soybean[J]． Theoretical and App lied Genetics， 2004， 109( 1) : 122-128．
[7] 张德水，董伟．用栽培大豆与半野生大豆间的杂种F2群体构建基因组分子标记连锁框架图[J]．科学通报， 1997， 42( 21) : 1326-1330．
[8] 吴晓雷，何超英，张志永，等．大豆遗传图谱的构建与分析[J]．遗传学报， 2001， 28( 11) : 1051-1061．
[9] Zhang W K，Wang Y J，Luo G Z， et al． QTL mapping of ten agronomic traits on thesoybean( Glycine max L． Merr) genetic map and their associationwith EST markers[J]． Theor Appl Genet， 2004( 108) : 1131-1139．
[10] 常汝镇，孙建英，邱丽娟，等．中国大豆品种资源收集潜力的分析[J]．作物品种资源， 1993( 1) : 1-3．
[11] 姚利坡．野生大豆与栽培大豆遗传关系研究[D]．石家庄: 河北师范大学， 2009．
[12] Song Q， Jia G，Zhu Y， et al． Abundance of SSR Motifs and Development of Candidate Polymorphic SSR Markers in Soybean[J]． Crop Science，2010，11 ( 50 ) : 1950-1960．
[13] 汪霞，徐宇，李广军，等．大豆株高QTL 定位及Meta 分析[J]．南京农业大学学报， 2011， 34( 3) : 13-19．
[14] 宋宪亮，孙学振，张天真．偏分离及对植物遗传作图的影响[J]．农业生物技术学报，2006，14( 2) : 286-292．
[15] Shawn M J,Winter-Barry J,Shelp-Terry R, et al． QTL associated with horizontal resistance to soybean cyst nematode in Glycine soja PI464925B[J]． Theor Appl Genet, 2007, 114: 461-472．
[16] Yamanaka N，Ninomiya S，Hoshi M， et al． An informative linkage map of soybean reveals QTLs for flowering time，leaflet morphology and regions of segregation distortion[J]． DNA Res， 2001，8 ( 2) : 61 – 72．
[17] 李慧慧，张鲁燕，王建康．数量性状基因定位研究中若干常见问题的分析与解答[J]．作物学报， 2010， 36 ( 6) : 918-931．
[18] 聂书萍，代林远．分子标记的发展及应用[J]．河南职工医学院学报， 2006， 18( 6) : 526-528

选择文件类型/文献管理软件名称

选择包含的内容

大豆公共遗传图谱C1连锁群SSR标记空白区段的填补

Complete the Blank Section with SSR Markers on Linkage Group C1 of Public Genetic Map in Soybean

PDF

可视化

被引次数

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

[1]	伊六喜, 邬阳, 曹彦, 贾海滨, 斯钦巴特尔, 高凤云, 周宇, 贾霄云. 亚麻主要产量相关性状的SSR关联分析[J]. 华北农学报, 2022, 37(5): 52-61.
[2]	凌晨, 赵洪, 颜军, 马莹雪, 冯艳芳, 张靖立, 李波, 邓超, 徐振江. 基于SSR标记的莴苣品种鉴定体系的建立及应用[J]. 华北农学报, 2022, 37(4): 34-44.
[3]	张馨方, 张树航, 李颖, 郭燕, 王广鹏. 基于SSR标记构建燕山板栗核心种质[J]. 华北农学报, 2021, 36(S1): 31-38.
[4]	董丽, 石海春, 赵长云, 余学杰, 柯永培. 玉米矮秆突变体K718d的遗传鉴定[J]. 华北农学报, 2021, 36(6): 71-77.
[5]	李靓, 于卓, 于肖夏, 杨东升, 卢倩倩, 李景伟, 李佳奇, 刘宇飞. 6个马铃薯新品系的细胞学及SSR分析[J]. 华北农学报, 2021, 36(2): 74-80.
[6]	伊六喜, 萨如拉, 王树彦, 李志伟, 斯钦巴特尔, 李强. 亚麻木酚素含量的SSR关联分析[J]. 华北农学报, 2021, 36(1): 63-70.
[7]	张久坤, 齐阳阳, 李立竹, 宁哓霜, 刘志华, 姜振峰, 李文滨. 利用BSA法定位大豆全基因组株高QTL及候选基因分析[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 1-10.
[8]	董辉, 杨莉, 李莉, 张建军, 范婧芳, 宋世佳, 杨雷, 李海山. 基于SLAF-seq技术构建栽培草莓高密度遗传图谱[J]. 华北农学报, 2020, 35(6): 52-57.
[9]	吕冰冰, 代畅, 彭正松, YAMAMOTO Naoki, 吴一超, 魏淑红, 杨在君. 一组新的小麦EST-SSR标记开发及其在遗传图谱构建中的应用[J]. 华北农学报, 2020, 35(4): 57-63.
[10]	易红梅, 任洁, 王璐, 王蕊, 葛建镕, 王凤格, 赵久然, 徐明良. 2014-2019年国家玉米区域试验参试组合DNA指纹检测及遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2020, 35(3): 87-93.
[11]	李祥栋, 石明, 陆秀娟, 潘虹, 魏心元, 陆平. 利用叶绿体基因组SSR标记揭示薏苡属种质资源的遗传多样性[J]. 华北农学报, 2019, 34(S1): 6-14.
[12]	郭慧娟, 贾举庆, 李欣, 乔麟轶, 阎晓涛, 任永康, 常利芳, 张树伟, 畅志坚, 张晓军. 小麦种质CH7015中抗白粉病基因的SSR定位[J]. 华北农学报, 2019, 34(6): 203-208.
[13]	宁宇, 郑彦超, 武高洁, 王义飞, 张曼胤. 扁秆荆三棱不同组织混合样品的转录组分析[J]. 华北农学报, 2019, 34(6): 74-81.
[14]	张朝红, 陈东玫, 杨凤秋, 赵同生, 李扬, 赵国栋, 赵永波. 苹果SLAF图谱构建及果锈基因QTL分析[J]. 华北农学报, 2019, 34(5): 37-44.
[15]	李小军, 徐鑫, 张自阳, 刘明久, 茹振钢. 小麦2B染色体新SSR标记开发[J]. 华北农学报, 2019, 34(3): 68-74.

模态框（Modal）标题

选择文件类型/文献管理软件名称

选择包含的内容

大豆公共遗传图谱C1连锁群SSR标记空白区段的填补

Complete the Blank Section with SSR Markers on Linkage Group C1 of Public Genetic Map in Soybean

PDF

可视化

被引次数

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价