绍兴鸭微卫星DNA遗传多样性分析

doi:10.7668/hbnxb.2010.03.017

华北农学报 ›› 2010, Vol. 25 ›› Issue (3): 73-75. doi: 10.7668/hbnxb.2010.03.017

绍兴鸭微卫星DNA遗传多样性分析

袁青妍¹, 陶争荣¹, 李国勤¹, 沈军达¹, 陈奕春², 陈文标³, 王德前¹, 虞永亮³, 田勇¹, 原爱平¹, 卢立志¹

1. 浙江省农业科学院, 畜牧兽医研究所, 浙江杭州 310021;
2. 缙云县畜牧兽医局, 浙江缙云 321400;
3. 浙江五莲农牧有限公司, 浙江缙云 321403

收稿日期:2009-12-23 出版日期:2010-06-28
作者简介:袁青妍(1971-),女,陕西韩城人,博士,主要从事家禽分子遗传育种研究.
基金资助:
国家“十一五”科技支撑计划项目(2006BAD14B06);浙江省重大科技攻关项目(2005C12005-01);浙江省重大国际合作项目(2006C14015)

The DNA Genetic Diversity of Shaoxing Duck Populations

YUAN Qing-yan¹, TAO Zheng-rong¹, LI Guo-qin¹, SHEN Jun-da¹, CHEN Yi-chun², CHEN Wen-biao³, WANG De-qian¹, YU Yong-liang³, TIAN Yong¹, YUAN Ai-ping¹, LU Li-zhi¹

1. Institute of Animal Husbandry and Veterinary Science, Zhejiang Academy of Agriculture Sciences, Hangzhou 310021, China;
2. Jinyun Bureau of Animal Husbandry and Veterinary, Jinyun 321400, China;
3. Wulian Agriculture and Livestock Corporation of Zhejiang, Jinyun 321403, China

Received:2009-12-23 Published:2010-06-28

摘要/Abstract

摘要： 采用鸭的6个高度多态且分布在不同连锁群上的微卫星标记,对原种绍兴鸭种群中48个体和青壳II系绍兴鸭种群中34个体分别进行遗传多样性分析,共检测到152个等位基因,每个微卫星座位上等位基因数介于20～30,基因频率分布在0～0.2,在两个种群中每个微卫星标记的杂合度及多态信息含量均在0.8以上。原种绍兴鸭在3个座位上处于Hardy-Weinberg不平衡状态,而青壳II系绍兴鸭在2个座位上处于Hardy-Weinberg不平衡状态,而且它们都在AY493314座位处于Hardy-Weinberg不平衡状态。研究结果表明:原种绍兴鸭与青壳II系绍兴鸭群体内均存在丰富的遗传多样性。

关键词: 绍兴鸭, 遗传多样性, 微卫星标记

Abstract: Six microsatellite markers with high polymorphisms locating at different linkage groups were used to analyze the microsatellite DNA genetic polymorphisms of the 48 and 34 Shaoxing ducks sampled from element breed population and blue-eggshelled II strain population, respectively.A total of 152 alleles were detected, and the numbers of alleles at each locus varied from 20 to 30.The gene frequencies were 0 to 0.2.Both the hererozygosity( H) and polymorphic information content( PIC) were more than 0.8 at each microsatellite locus in the two populations.In the element breed population and blue-egg shelled II strain population, there were 3 and 2 loci, respectively,which were not in Hardy-Weinberg equilibrium, and they were all at AY493314 locus.The results revealed that the genetic variabilities in the element breed and blue-eggshelled II strain populations analysed were rich．

Key words: Shaoxing duck, Genetic diversity, Microsatellite DNA

中图分类号:

S834.03

袁青妍, 陶争荣, 李国勤, 沈军达, 陈奕春, 陈文标, 王德前, 虞永亮, 田勇, 原爱平, 卢立志. 绍兴鸭微卫星DNA遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2010, 25(3): 73-75. doi: 10.7668/hbnxb.2010.03.017.

YUAN Qing-yan, TAO Zheng-rong, LI Guo-qin, SHEN Jun-da, CHEN Yi-chun, CHEN Wen-biao, WANG De-qian, YU Yong-liang, TIAN Yong, YUAN Ai-ping, LU Li-zhi. The DNA Genetic Diversity of Shaoxing Duck Populations[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2010, 25(3): 73-75. doi: 10.7668/hbnxb.2010.03.017.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2010/V25/I3/73

参考文献

[1] 黄银花.鸭遗传图谱的构建及重要性状基因座的初步定位[D].北京:中国农业大学,2004.
[2] Huang Y,Zhao Y,Haley C S,et al.A genetic and cytogenetic map for the duck(Anas platyrhynchos)[J].Genetics,2006,173:287-296.
[3] Buchanan F C,Adams L J,Littlejohn R P,et al.Determination of evolutionary relationships among sheep breeds using microsatellites[J].Genomics,1994,22:397-403.
[4] MacHugh E,Lofftus R T,Barley D G,et al.Microsatellite DNA variation within and among European cattle breeds[J].Proc Roy Soc Biol Sci,1994,256:25-31.
[5] Romanov M N,Weigends S.Genetic diversity in chicken populations based on microsatellite markers[C]//Proc.Of the Conference "From Jay Lush to Genomics:Visions for Animal Breeding and Genetics".Ames.Iowa,USA,1999:174.
[6] Crooijmans R P M A,Groen A F,Van Kampen A J A,et al.Microsatellite polymorphism in commercial broiler and layer lines estimated using pooled blood samples[J].Poult Sci,1996,72:334-348.
[7] 汤青萍,李慧芳,屠云洁,等.中国重点保护地方鸭品种资源的多样性分析[J].西北农林科技大学学报:自然科学版,2007,35(2):47-52.
[8] 吴艳,候水生,刘小林,等.4个微卫星标记分析6个鸭群体之间的遗传关系[J].畜牧兽医学报,2006,37(4):389-395.
[9] 陈奕欣,左正宏.RAPD技术探讨几种家鸭与野鸭遗传多样性及亲缘关系[J].厦门大学学报:自然科学版,2001,40(1):141-145.
[10] 张汤杰,卢立志,沈军达,等.不同品系绍兴蛋鸭血清酯酶多态性比较研究[J].中国家禽,2004,26(18):10-12.
[11] 张汤杰,卢立志,沈军达,等.绍兴鸭与高邮鸭碱性磷酸酶多态性的比较[J].扬州大学学报:农业与生命科学版,2005,26(4):31-33.
[12] 许盛海,束婧婷,程金花,等.鸭生长激素基因5'UTR和3'UTR多态性分析[J].中国畜牧兽医,2007,34(2):58-60.
[13] 许盛海,包文斌,黄军,等.鸭生长激素基因内含子2、3多态性分析[J].遗传,2007,29(4):438-442.
[14] Takezaki N,Nei M.Genetic distance and reconstruction of polyogenetic trees from microsatellite DNA[J].Genetics,1996,144:389-399.

[1]	刘警, 李扬, 刘金利, 张馨方, 白仲奎, 于秋香. 基于SSR分子标记的核桃涩味遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2024, 39(S1): 23-30.
[2]	张曦, 刘祎, 钱玉源, 王广恩, 王寒菊, 焦秀芬, 解辉, 崔淑芳, 李俊兰. 陆地棉种质资源遗传多样性分析及初级核心种质构建[J]. 华北农学报, 2023, 38(S1): 26-33.
[3]	马彪, 南丽丽, 姚宇恒, 夏静, 汪堃, 陈洁, 何海鹏. 基于ISSR及SSR标记的苜蓿遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2023, 38(S1): 39-48.
[4]	兰若林, 马文智, 张立民, 孙博, 常玉梅, 梁利群. 大龙虎泡野生日本沼虾遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2023, 38(S1): 437-443.
[5]	者玉琦, 柴志欣, 武志娟, 姜辉, 钟金城, 信金伟. *西藏特色牦牛mtDNA ND1遗传多样性及系统进化分析*[J]. 华北农学报, 2023, 38(6): 201-210.
[6]	刘佳, 张梦雅, 任世龙, 王永芳, 马继芳, 全建章, 刘磊, 董志平, 白辉, 李志勇. 利用SRAP分子标记分析谷瘟病菌遗传多样性[J]. 华北农学报, 2023, 38(5): 179-187.
[7]	宋慧, 古斌权, 张香琴. 中国南瓜×印度南瓜种间杂交自交系及组合的遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2022, 37(6): 91-102.
[8]	李曼, 史晓蕾, 邸锐, 刘志芳, 孟庆民, 付才, 杨春燕, 王冬梅, 张孟臣, 张洁, 闫龙. 大豆长片段插入/缺失标记的开发与应用[J]. 华北农学报, 2022, 37(1): 18-26.
[9]	张馨方, 张树航, 李颖, 郭燕, 王广鹏. 基于SSR标记构建燕山板栗核心种质[J]. 华北农学报, 2021, 36(S1): 31-38.
[10]	冯俊彦, 康乐, 郎涛, 张聪, 李明, 赵珊, 蒲志刚. 基于SCoT分子标记的甘薯及其野生种遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2021, 36(1): 18-26.
[11]	杨振立, 王广鹏, 张树航, 郭燕, 张馨方, 李颖. 燕山板栗15个花序相关表型性状遗传多样性研究[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 93-101.
[12]	付静, 崔林开, 付伟, 乔莉娟. 河南省烟草疫霉遗传多样性与遗传结构的RAPD分析[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 342-346.
[13]	高源, 王大江, 王昆, 李连文, 朴继成. 基于叶绿体片段序列的苹果属植物遗传多样性[J]. 华北农学报, 2020, 35(6): 42-51.
[14]	易红梅, 任洁, 王璐, 王蕊, 葛建镕, 王凤格, 赵久然, 徐明良. 2014-2019年国家玉米区域试验参试组合DNA指纹检测及遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2020, 35(3): 87-93.
[15]	李祥栋, 石明, 陆秀娟, 潘虹, 魏心元, 陆平. 利用叶绿体基因组SSR标记揭示薏苡属种质资源的遗传多样性[J]. 华北农学报, 2019, 34(S1): 6-14.

选择文件类型/文献管理软件名称

选择包含的内容

绍兴鸭微卫星DNA遗传多样性分析

The DNA Genetic Diversity of Shaoxing Duck Populations

PDF

可视化

被引次数

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

模态框（Modal）标题

选择文件类型/文献管理软件名称

选择包含的内容

绍兴鸭微卫星DNA遗传多样性分析

The DNA Genetic Diversity of Shaoxing Duck Populations

PDF

可视化

被引次数

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价