天祝白牦牛<em>KAP1.1</em>基因亚型<em>B2A</em>克隆及鉴定

doi:10.7668/hbnxb.2015.01.018

华北农学报 ›› 2015, Vol. 30 ›› Issue (1): 109-117. doi: 10.7668/hbnxb.2015.01.018

所属专题： 畜牧；生物技术；

天祝白牦牛KAP1.1基因亚型B2A克隆及鉴定

张良斌^1,2,3, 梁春年^2,3, 裴杰^2,3, 褚敏^2,3, 吴晓云^2,3, 张建一^2,3, 潘和平¹, 阎萍^2,3

1. 西北民族大学生命科学与工程学院, 甘肃兰州 730030;
2. 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所, 甘肃兰州 730050;
3. 甘肃省牦牛繁育工程重点实验室, 甘肃兰州 730050

收稿日期:2014-09-28 出版日期:2015-02-28
通讯作者: 潘和平(1962-),男,甘肃西和人,教授,博士,主要从事动物遗传育种与繁殖研究。阎萍(1963-),女,山西运城人,研究员,博士,主要从事动物遗传育种与繁殖研究。
作者简介:张良斌(1988-),男,内蒙古乌海人,在读硕士,主要从事动物遗传育种与繁殖研究。
基金资助:
科技支撑计划项目(2012BAD13B05);行业科研项目 (201003061z);甘肃省农业生物技术研究与应用开发项目(CNSW-2011-23);西北民族大学2014年度研究生科研创新项目(ycx14162)

Cloning and Identification of the B2A of Tianzhu White Yak KAP1.1 Sub Gene

ZHANG Liang-bin^1,2,3, LIANG Chun-nian^2,3, PEI Jie^2,3, CHU Min^2,3, WU Xiao-yun^2,3, ZHANG Jian-yi^2,3, PAN He-ping¹, YAN Ping^2,3

1. College of Life Science and Engineering, Northwest University for Nationalities, Lanzhou 730030, China;
2. Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences of CAAS, Lanzhou 730050, China;
3. Key Laboratory of Yak Breeding Engineering, Lanzhou 730050, China

Received:2014-09-28 Published:2015-02-28

摘要/Abstract

摘要： 通过对天祝白牦牛高硫角蛋白基因启动子 B2A 克隆得到其序列,将序列提交到NCBI,登录号:KJ910005,并对其进行生物信息学分析,通过亚细胞定位,磷酸化分析,二级、三级结构和保守结构域预测结果比较,MEGA 5.10 软件进行NJ法进化树构建和MegAlign进行蛋白质相似分析来分析 B2A 基因与 KAP1.1 (Keratin associated protein1.1) 基因的差异性。B2A 基因的CDS区全长为471 bp,共编码156个氨基酸,二级结构含有延伸链、β转角和无规卷曲3种。B2A蛋白和KAP1.1蛋白的亚细胞定位,磷酸化分析,保守结构域,二级结构、三级结构和同源性差异较大。但是从功能预测结果显示2个蛋白功能完全一致,并且使用Clustal X进行氨基酸序列比对分析显示B2A蛋白从第33位开始相对于KA1.1蛋白有10个氨基酸的缺失以外,其余序列之间的保守性相当高。因此,可以证明 B2A 基因是 KAP1.1 基因的基因亚型。

关键词: 牦牛, B2A 基因, KAP1.1蛋白, 基因亚型

Abstract: In this study, the high sulfur keratin B2A promoter of Tianzhu White Yak gene was cloned and got sequence, and analyzed the bioinformatics.Comparison of forecasting results by subcellular localization, phosphorylation analysis, secondary structure of proteins, tertiary structure, MEGA 5.10 software by NJ method and phylogenetic tree construction and MegAlign software to analyzed the difference between B2A gene and KAP1.1 gene. B2A gene CDS region was 471 bp, encoding a protein with 156 amino acids, the secondary structures were mainly composed of extended strand, beta turn and random coil.B2A and KAP1.1 protein of subcellular localization, phosphorylation analysis, conserved domains, secondary structure, tertiary structure and homology were different.But from the function prediction results showed that the two protein's function were exactly same, and Clustal X software was used to compare the amino acid sequence.B2A protein compared with KAP1.1 protein has ten amino acids deletion at position 33, the remaining sequence has very high conserved between two proteins.So it was proved that the B2A gene was KAP1.1 gene sub gene.

Key words: Yak, B2A gene, KAP1.1 protien, Sub gene

中图分类号:

Q78
S823.03

张良斌, 梁春年, 裴杰, 褚敏, 吴晓云, 张建一, 潘和平, 阎萍. 天祝白牦牛KAP1.1基因亚型B2A克隆及鉴定[J]. 华北农学报, 2015, 30(1): 109-117. doi: 10.7668/hbnxb.2015.01.018.

ZHANG Liang-bin, LIANG Chun-nian, PEI Jie, CHU Min, WU Xiao-yun, ZHANG Jian-yi, PAN He-ping, YAN Ping. Cloning and Identification of the B2A of Tianzhu White Yak KAP1.1 Sub Gene[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2015, 30(1): 109-117. doi: 10.7668/hbnxb.2015.01.018.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2015/V30/I1/109

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