辣椒遗传多样性的SSR分析

doi:10.7668/hbnxb.2009.S1.016

华北农学报

所属专题： 甜椒辣椒；

辣椒遗传多样性的SSR分析

周晶, 沈火林, 杨文才, 谭芳, 王银磊, 郭爽

中国农业大学农学与生物技术学院, 北京　100193

收稿日期:2009-01-20 出版日期:2009-12-31
通讯作者: 沈火林(1965 -), 男, 教授, 主要从事蔬菜遗传育种与生物技术研究。
作者简介:周　晶(1983 -), 女, 安徽人,硕士, 主要从事蔬菜遗传育种与生物技术研究。
基金资助:
“十一五”“863”计划项目(2006AA10Z1A);支撑计划项目(2006BAD01A7;2008BADB1B04);北京市教委共建项目资助

Analysis of Genetic Diversity of Capsicum Germplasm by Using SSR Markers

ZHOUJing, SHENHuo-lin, YANGWen-cai, TANFang, WANGYin-lei, GUOShuang

College of Agricultural and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193, China

Received:2009-01-20 Published:2009-12-31

摘要/Abstract

摘要： 采用109对SSR特异引物对89份辣椒材料进行分析,其中87对引物扩增出条带,52对引物具有多样性,扩增带分子量在150~2000 bp之间,231条谱带中175条谱带具有多态性,多态率占75.76%,平均每个引物可扩增出2.66条带,说明辣椒材料的遗传多样性相对较小。89份材料经过NTSYS2.1.0软件分析后,计算出材料间遗传距离,并做出SSR分子标记聚类图。结果显示,89份材料在遗传相似系数0.60处分为两类,可以将栽培种和野生种区分开来,在遗传相似系数0.80处可以分为四类,总体上看,将果实类型相似的种质基本都聚在一起,说明用SSR标记进行辣椒遗传多样性的分析是可行的。

关键词: 辣椒, 遗传多样性, SSR

Abstract: One hundred and nine SSR primers were used to study genetic diversity among 89 Capsicum germplasm resources that detected 231 alleles.The average number of alleles per locus was 2.66.Using NTSYS2.1.0 to cluster analysis showed that 89 Capsicum germplasm resources could be classified into 4 groups,the same species clustered together, and this indicated that it is feasible to using SSR markers to distinguish Capsicum germplasm resources ,SSR markers is an available methods to study the genetic diversity of Capsicum germplasm resources.

Key words: Capsicum, Geneticdiversity, SSRmarkers

中图分类号:

S641.03

ZHOUJing, SHENHuo-lin, YANGWen-cai, TANFang, WANGYin-lei, GUOShuang. Analysis of Genetic Diversity of Capsicum Germplasm by Using SSR Markers[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, doi: 10.7668/hbnxb.2009.S1.016.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2009/V24/IS1/62

参考文献

[1] 邹学校主编.中国辣椒[M].北京:中国农业出版社,2001:1-41.
[2] Wang Z,Weber J L.Surver of plant shot tandem DNA repeats[J].Theoretical and Applied Genetics,1994,88:1 -6.
[3] 艾呈祥,陆　璐,马国斌,等,两个甜瓜杂交种SSR 指纹图谱的构建[J].园艺学报,2005,32(5):902-904.
[4] Danin -Poleg Y,Reis N,Tzuri G,et al.Development andcharacterisation of microsatellite markers in Cucumis[J].Theor Appl Genet,2001,102 :61-72.
[5] 尹晗琪,刘荣云,欧阳学智,等,AFLP 法在辣椒胞质雄性不育恢复系选育中的应用[J].中山大学研究生学刊,2005,26:68 -73.
[6] 孙凌云,盖树鹏,樊治成,等,辣(甜)椒种质资源的RAPD 分析[J].西北植物学报,2005,25(5):870-875.
[7] 罗玉娣,李建国,李明芳,等,用SSR标记分析辣椒属种质资源的遗传多样性[J].生物技术通报,2006(增):337-341.
[8] 陈学军,程志芳,陈劲枫,等,辣椒种质遗传多样性的RAPD 和ISSR 及其表型数据分析[J].西北植物学报,2007,27(4):0662-0670.
[9] Paran I,JR van derVoort,Lefebvre V,et al.An integrated geneticlinkage map of pepper (Capsicum spp.)[J].Molecular-Breeding,2002,13:251-261.
[10] Wencai Yang,Xiaodong Bai,Eileen Kabelka,et al.Discoveryof single nucleotide polymorphisms in Lycopersicon esculentumby computer aided analysis of expressed sequencetags[J].Molecular Breeding,2004,14 :21-34.
[11] Yasuhiro Minamiyama,Masato Tsuro ,Masashi Hirai.An SSR-based linkage map of Capsicum annuum[J].Mol Breeding,2006,18:157-169.
[12] Oliver M,Garcia -Mas J,CardusM,et al.Construction of areference linkage map for melon[J].Genome,2001,44:836-840.
[13] Inazuka M,Tahira T,Hayashi K.One -tube post-PCR fluorescentlabeling of DNA fragments[J].Genome Res,1996 ,6:551-557.
[14] 韩占兵,李婉平.肉鸽品系的随机扩增多态性DNA(RAPD)分析[J].西北农林科技大学学报,2003,12 :113-116.
[15] Lefebvre V,Palloix A,RivesM.Nuclear RFLP between peppercultivars (Capsicum annuum L)[J].Euphytica,1993 ,71:112 -121.
[16] Lcaiza -Figueroa F K,Ritland J A,Laborde.C,et al.Patternof genetic variation of the genus Capsicum(Solanaceae)in Mexico[J].Pl Syst Evol,1989,165:159-188.
[17] 王　玲,郑金贵,赖钟雄,等,辣椒遗传多样性的RAPD分析[J].福建农林大学,2003,32(2):213-216.

选择文件类型/文献管理软件名称

选择包含的内容

辣椒遗传多样性的SSR分析

Analysis of Genetic Diversity of Capsicum Germplasm by Using SSR Markers

PDF

可视化

被引次数

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

[1]	伊六喜, 邬阳, 曹彦, 贾海滨, 斯钦巴特尔, 高凤云, 周宇, 贾霄云. 亚麻主要产量相关性状的SSR关联分析[J]. 华北农学报, 2022, 37(5): 52-61.
[2]	凌晨, 赵洪, 颜军, 马莹雪, 冯艳芳, 张靖立, 李波, 邓超, 徐振江. 基于SSR标记的莴苣品种鉴定体系的建立及应用[J]. 华北农学报, 2022, 37(4): 34-44.
[3]	贾志强, 许云玉, 高雪, 陶宏征, 陈增敏, 刘雅婷, 李永忠. *辣椒CaWRKY30转录因子的克隆、亚细胞定位及番茄斑萎病毒侵染下的表达分析*[J]. 华北农学报, 2022, 37(3): 186-192.
[4]	李曼, 史晓蕾, 邸锐, 刘志芳, 孟庆民, 付才, 杨春燕, 王冬梅, 张孟臣, 张洁, 闫龙. 大豆长片段插入/缺失标记的开发与应用[J]. 华北农学报, 2022, 37(1): 18-26.
[5]	张馨方, 张树航, 李颖, 郭燕, 王广鹏. 基于SSR标记构建燕山板栗核心种质[J]. 华北农学报, 2021, 36(S1): 31-38.
[6]	董丽, 石海春, 赵长云, 余学杰, 柯永培. 玉米矮秆突变体K718d的遗传鉴定[J]. 华北农学报, 2021, 36(6): 71-77.
[7]	雷阳, 乔宁, 白扬, 杨玉花. 表油菜素内酯对重度镉胁迫下辣椒幼苗生理特性及抗逆基因的影响[J]. 华北农学报, 2021, 36(5): 99-106.
[8]	罗建, 许春苗, 张国斌, 郁继华. 辣椒NHX基因家族的鉴定和表达分析[J]. 华北农学报, 2021, 36(3): 15-24.
[9]	李靓, 于卓, 于肖夏, 杨东升, 卢倩倩, 李景伟, 李佳奇, 刘宇飞. 6个马铃薯新品系的细胞学及SSR分析[J]. 华北农学报, 2021, 36(2): 74-80.
[10]	冯俊彦, 康乐, 郎涛, 张聪, 李明, 赵珊, 蒲志刚. 基于SCoT分子标记的甘薯及其野生种遗传多样性分析[J]. 华北农学报, 2021, 36(1): 18-26.
[11]	伊六喜, 萨如拉, 王树彦, 李志伟, 斯钦巴特尔, 李强. 亚麻木酚素含量的SSR关联分析[J]. 华北农学报, 2021, 36(1): 63-70.
[12]	张久坤, 齐阳阳, 李立竹, 宁哓霜, 刘志华, 姜振峰, 李文滨. 利用BSA法定位大豆全基因组株高QTL及候选基因分析[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 1-10.
[13]	杨振立, 王广鹏, 张树航, 郭燕, 张馨方, 李颖. 燕山板栗15个花序相关表型性状遗传多样性研究[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 93-101.
[14]	柴阿丽, 陈利达, 许帅, 帕提古丽·艾斯木托拉, 王利丽, 石延霞, 谢学文, 李磊, 李宝聚. 新疆喀什辣椒轻斑驳病毒和黄瓜花叶病毒复合侵染的分子鉴定[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 332-337.
[15]	孟雅宁, 严立斌, 张红肖, 赵海涛, 范妍芹. 辣椒抗疫病基因分子标记的筛选及检测[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 338-341.

模态框（Modal）标题

选择文件类型/文献管理软件名称

选择包含的内容

辣椒遗传多样性的SSR分析

Analysis of Genetic Diversity of Capsicum Germplasm by Using SSR Markers

PDF

可视化

被引次数

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价