FMDV OA/58病毒株VP1蛋白结构构建与B细胞抗原表位的预测

doi:10.7668/hbnxb.2007.04.041

华北农学报 ›› 2007, Vol. 22 ›› Issue (4): 176-179. doi: 10.7668/hbnxb.2007.04.041

FMDV OA/58病毒株VP1蛋白结构构建与B细胞抗原表位的预测

周建华, 丛国正, 高闪电, 常惠芸

中国农业科学院兰州兽医研究所, 家畜疫病病原生物学国家重点实验室, 农业部畜禽病毒学重点开放实验室, 国家口蹄疫参考实验室, 甘肃兰州 730046

收稿日期:2007-06-03 出版日期:2007-08-28
通讯作者: 常惠芸(1965-)，女，河南许昌人，研究员，博士，主要从事病毒基因工程的研究工作。
作者简介:周建华(1981-)，男，内蒙古呼和浩特人，硕士，主要从事病毒基因工程研究。
基金资助:
国家重点基础研究发展计划国家“973”项目(2005CB523201)

Construction of VP1 Protein and Prediction of B Cell Epitopes in VP1 from a Foot-and-mouth Disease Virus Strain OA/58

ZHOU Jian-hua, CONG Guo-zheng, GAO Shan-dian, CHANG Hui-yun

Chinese Academy of Agriculture Science, State Key Laboratory of Veterinary Etiological Bilogy, Key Laboratory of Animal Virology of Ministry of Agriculture, National FMD Reference Laboratory, Lanzhou 730046, China

Received:2007-06-03 Published:2007-08-28

摘要/Abstract

摘要： 以口蹄疫病毒株OA/58 RNA为模板，反转录并扩增目的cDNA，然后与pGEM-T easy载体连接并转化JM109菌株，提取的重组质粒用凝胶电泳、PCR和EcoR Ⅰ酶切法鉴定。运用同源模建得到OA/58 VP1蛋白3D结构，并结合理化性质、亲水性、可塑性和免疫原性进行分析，预测OA/58 VP1的抗原表位。结果 OA/58 VP1存在多个潜在的抗原表位位点，可能的蛋白质抗原表位区域：2～11，15～35，38～50，77～88，90～107，121～125，131～135，10～19，15～163，169～175，178～189，197～213.应用同源模建得到的OA/58 VP1蛋白3D模型来预测其B细胞表位，为进一步研究OA/58 VP1功能，构建突变体和选择表达新型OA/58 VP1蛋白分子提供有参考价值的信息。

关键词: 口蹄疫病毒, VP1蛋白, B细胞抗原表位

Abstract: Foot-and-mouth disease virus strain OA/58 RNAs were used as templates for RTPCR. The amplified cDNA products were cloned into pGEM-T easy vectors and transformed into JM109. The recombinant plasmids were identified by electrophoresis, PCR, and EcoR I cleavage. By means of homology modeling the FMDV strain OA/58 VP1 protein, the 3D mold was obtained. In order to find out B cell epitopes of OA/58 VP1, several methods were analyzed including physical and chemical characters, hydrophilicity, antigenicity. Many distinct antigenic epitopes in FMDV OA/58 VP1 were identified by computation: 2-11, 15-35, 38-50, 77-88, 90-107, 121-125, 131-135, 140-149, 154-163, 169-175, 178-189, 197-213. Application of homology molding OA/58 VP1 to predict B cell epitopes is reasonable. This method offers reasonable information for researching function of OA/58 VP1, constructing its variant body and selecting new expression forms of OA/58 VP1.

Key words: Foot-and-mouth disease virus, VP1 protein, B cell epitope

中图分类号:

S852.65

周建华, 丛国正, 高闪电, 常惠芸. FMDV OA/58病毒株VP1蛋白结构构建与B细胞抗原表位的预测[J]. 华北农学报, 2007, 22(4): 176-179. doi: 10.7668/hbnxb.2007.04.041.

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http://www.hbnxb.net/CN/Y2007/V22/I4/176

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