与蓖麻种子大小性状连锁的RAPD分析

doi:10.7668/hbnxb.2015.05.018

华北农学报 ›› 2015, Vol. 30 ›› Issue (5): 108-114. doi: 10.7668/hbnxb.2015.05.018

与蓖麻种子大小性状连锁的RAPD分析

包春光^1,2, 黄凤兰^3,4, 朱国立^4,5, 刘浩², 杜娟², 彭木⁶, 陈晓凤³, 赵永³

1. 内蒙古民族大学农学院, 内蒙古通辽 028000;
2. 通辽市农畜产品质量安全中心, 内蒙古通辽 028000;
3. 内蒙古民族大学生命科学学院, 内蒙古通辽 028000;
4. 内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心, 内蒙古通辽 028000;
5. 通辽市农业科学研究院, 内蒙古通辽 028000;
6. 东北林业大学生命科学学院, 黑龙江哈尔滨 150040

收稿日期:2015-07-01 出版日期:2015-10-28
通讯作者: 黄凤兰(1973-),女,山东菏泽人,教授,博士,主要从事蓖麻分子育种研究。
作者简介:包春光(1987-),女,内蒙古通辽人,研究实习员,在读硕士,主要从事农畜产品质量检测。
基金资助:
国家自然科学基金项目(30760123;31160290);国家农业部公益性行业(农业)科研专项(201003057);内蒙古自治区高等学校“青年科技英才支持计划”(NJYT-14-A10);市校合作项目(SXZD2012018);内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心开放基金项目(BMYJ2011009)

RAPD Analysis of Castor Seed Size Traits Linkage

BAO Chun-guang^1,2, HUANG Feng-lan^3,4, ZHU Guo-li^4,5, LIU Hao², DU Juan², PENG Mu⁶, CHEN Xiao-feng³, ZHAO Yong³

1. Agronomy College, Inner Mongolia University for Nationalities, Tongliao 028000, China;
2. The Center Testing For Quality & Safety of Agricultural and Animal Products Ministry of Tongliao, Tongliao 028000, China;
3. College of Life Science, Inner Mongolia University for Nationalities, Tongliao 028000, China;
4. Inner Mongolia Industrial Engineering Research Center of Universities for Castor, Tongliao 028000, China;
5. Tongliao Academy of Agricultural Science, Tongliao 028000, China;
6. College of Life Science, Northeast Forestry University, Harbin 150040, China

Received:2015-07-01 Published:2015-10-28

摘要/Abstract

摘要： 蓖麻种子大小因品种不同差异很大,目前尚未见与蓖麻种子大小性状发育相关的分子生物学研究。以32个不同大小的蓖麻种子作为研究材料,用U25(5⁵)均匀试验设计法对种子大小性状的RAPD-PCR反应体系和条件进行优化。最佳反应体系为:25 μL体系中10×Buffer 2.7 μL、dNTP 2.4 μL、Mg²⁺ 2.4 μL、DNA 1.7 μL、引物 1.9 μL、 Taq polymerase 2.0 μL、ddH₂O 11.9 μL。最佳反应条件为:94 ℃ 150 s;94 ℃ 45 s,39 ℃ 65 s,72 ℃ 90 s,35个循环;72 ℃ 10 min;4 ℃ 保存。用SB-002引物(碱基序列(5'-3'):TGCCGAGCTG),采用最佳的反应体系和条件在最大粒蓖麻种子中筛选到一个差异条带,测序结果在NCBI中进行比对,发现与高产粳稻基因组DNA、mRNA或cDNA同源性达到100%,因此推断所获差异条带与蓖麻种子产量有关,为蓖麻种子大小性状相关分子机理研究奠定了基础。

关键词: 蓖麻, 种子, 大小, RAPD

Abstract: Castor seed size varies greatly due to breed,has yet to see molecular biology research on castor bean size traits associated with the development.In this experiment,32 castor seeds of different sizes as research material,with U25(5⁵) uniform design for seed size traits RAPD-PCR reaction system and conditions were optimized.The optimal reaction system:25 μL system,10×Buffer 2.7 μL,dNTP 2.4 μL,Mg²⁺ 2.4 μL,DNA 1.7 μL,primers 1.9 μL,Taq polymerase 2.0 μL,ddH₂O 11.9 μL.The best reaction conditions were:94 ℃ 150 s;94 ℃ 45 s,39 ℃ 65 s,72 ℃ 90 s,35 cycles;72 ℃ 10 min;4 ℃ preservation.With SB-002 primer(nucleotide sequence(5'-3'):TGCCGAGCTG),using the best reaction system and conditions,screening a different band in the largest grain castor seeds,sequencing results were compared in the NCBI found with high yield rice genome DNA,mRNA or cDNA homology of 100%.Therefore,It can be concluded that the different band relevant to castor seed yield,laid the foundation for the relevant molecular mechanisms of castor seed size traits studied.

Key words: Castor, Seed, Size, RAPD

中图分类号:

S565.6

包春光, 黄凤兰, 朱国立, 刘浩, 杜娟, 彭木, 陈晓凤, 赵永. 与蓖麻种子大小性状连锁的RAPD分析[J]. 华北农学报, 2015, 30(5): 108-114. doi: 10.7668/hbnxb.2015.05.018.

BAO Chun-guang, HUANG Feng-lan, ZHU Guo-li, LIU Hao, DU Juan, PENG Mu, CHEN Xiao-feng, ZHAO Yong. RAPD Analysis of Castor Seed Size Traits Linkage[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2015, 30(5): 108-114. doi: 10.7668/hbnxb.2015.05.018.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2015/V30/I5/108

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