谷子3-磷酸甘油醛脱氢酶基因的克隆与结构分析

doi:10.7668/hbnxb.2009.03.003

华北农学报 ›› 2009, Vol. 24 ›› Issue (3): 10-14. doi: 10.7668/hbnxb.2009.03.003

所属专题： 杂粮作物；生物技术；

谷子3-磷酸甘油醛脱氢酶基因的克隆与结构分析

崔润丽¹, 王永芳², 智慧³, 李伟², 李海权², 黄占景⁴, 刁现民³

1. 河北省农林科学院谷子研究所, 国家谷子改良中心, 河北石家庄 050031;
2. 河北化工医药职业技术学院制药工程系, 河北石家庄 050026;
3. 中国农业科学院作物科学研究所, 北京 100081;
4. 河北师范大学生命科学学院, 河北石家庄 050012

收稿日期:2009-02-08 出版日期:2009-06-28
通讯作者: 刁现民(1963 - ),男,河北南和人,研究员,博士,主要从事谷子等杂粮作物基因组和生物技术研究。
作者简介:崔润丽(1973-), 女, 河北鹿泉人, 讲师, 硕士, 主要从事生物技术研究.
基金资助:
国家自然科学基金(30630045);国家"863"计划(2006AA10Z157;2008AA10Z158);国家支撑计划(2006BAD02802)

Cloning and Structure Analysis of Foxtail Millet APDH Gene

CUI Runli¹, WANG Yong fang², ZHI Hui³, LI Wei², LI Haiquan², HUANG Zhan jing⁴, DIAo Xian min³

1. Institute of Millet Crops,Hebei Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Shijiazhuang 050031,China;
2. Department of Pharmaceutical Engineering,Hebei Chemical Medicine Vocational and Technical College,Shijiazhuang 050026,China;
3. Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agriculture Sciences,Beijing 100081,China;
4. College of Life Sciences,Hebei Normal University,Shijiazhuang 050012,China

Received:2009-02-08 Published:2009-06-28

摘要/Abstract

摘要： 3-磷酸甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)在谷子盐旱胁迫早期高频率表达,为研究该基因在胁迫反应及其他代谢中的详细功能,本研究利用RACE技术克隆了谷子的GAPDH基因.该基因cDNA全长1328 bp,包括1008bp的开放阅读框,共编码338个氨基酸,肽段的分子量为3911.03Da,极性氨基酸占29.12%.序列比较分析发现,谷子的GAPDH同玉米的同源序列表现了最高的相似性,同水稻和小麦同源序列的相似性次之,同双子叶植物的同源序列则相差较远.

关键词: 谷子, 3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH), 基因克隆

Abstract: It was found that glyceralehyde232phosphate dehydrogenase (GAPDH)was frequently uP₂rgulated expres2 sion in salt and drought stress treatment experiments of foxtail millet seedlings in our previous work and from literature. For detail annotation of the function of G APDH in tolerance reaction of abiotic stress,full length cDNA of foxtail millet G APDH gene was cloned using RACE technology in this paper. This full length cDNA contains a 1008 bp open2reading2 frame which encoding a 338 amino acid peptide with an estimated molecular weight of 35 911. 03 Da. Sequence compari2 son and phylogenetic analysis indicated that the foxtail millet G APDH cDNA was highly identical with its ortholog from maize and the next most similar orthologs come from two other cereals,rice and wheat. The possible functions and related topics were discussed.

Key words: Setaria italica, G APDH, Gene cloning

中图分类号:

Q785

崔润丽, 王永芳, 智慧, 李伟, 李海权, 黄占景, 刁现民. 谷子3-磷酸甘油醛脱氢酶基因的克隆与结构分析[J]. 华北农学报, 2009, 24(3): 10-14. doi: 10.7668/hbnxb.2009.03.003.

CUI Runli, WANG Yong fang, ZHI Hui, LI Wei, LI Haiquan, HUANG Zhan jing, DIAo Xian min,. Cloning and Structure Analysis of Foxtail Millet APDH Gene[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2009, 24(3): 10-14. doi: 10.7668/hbnxb.2009.03.003.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2009/V24/I3/10

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