基于染色体单片段代换系的水稻糙米率QTL的定位

doi:10.7668/hbnxb.2013.06.001

华北农学报 ›› 2013, Vol. 28 ›› Issue (6): 1-5. doi: 10.7668/hbnxb.2013.06.001

所属专题： 水稻；

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基于染色体单片段代换系的水稻糙米率QTL的定位

周勇¹, 高云¹, 朱松松¹, 朱金燕², 王军², 裔传灯¹, 仲维功², 梁国华¹

1 教育部植物功能基因组学重点实验室,江苏省作物遗传生理重点实验室扬州大学, 扬州大学, 江苏扬州 225009;
2 国家水稻改良中心南京分中心江苏省农业科学院粮食作物研究所, 江苏南京 210014

收稿日期:2013-08-08 出版日期:2013-12-28
作者简介:周勇(1983－),男,江苏泗洪人,讲师,博士,主要从事水稻遗传育种研究。
基金资助:
国家重点基础研究发展计划项目(2010CB125904);江苏省科技支撑计划项目(BE2012309);国家与江苏省粮食丰产科技工程项目(No.2011BAD16B03/BE2009425);江苏省农业科技自主创新基金项目(CX(12)1003-2);江苏省植物功能基因组学重点实验室开放课题(K12003)

QTL Mapping of BRown Rice Rate Using ChRomosome Single Segment Substituted Lines in Rice

ZHOU Yong¹, GAO Yun¹, ZHU Song-song¹, ZHU Jin-yan², WANG Jun², YI Chuan-deng¹, ZHONG Wei-gong², LIANG Guo-hua¹

1 Jiangsu Key Laboratory for Crop Genetics and Physiology, Jiangsu Key Laboratory of Plant Functional Genomics, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China;
2 Nanjing Branch of Chinese National Center for Rice Improvement, Institute of Food Crops, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Nanjing 210014, China

Received:2013-08-08 Published:2013-12-28

摘要/Abstract

摘要： 以广陆矮4号为受体,日本晴为供体的119个染色体单片段代换系为材料,通过单因素方差分析和Dunnett's多重比较,分析染色体单片段代换系与受体亲本之间糙米率的差异,对代换片段上的糙米率相关QTL进行鉴定。以P≤0.001为阈值共检测到2个糙米率QTL,利用代换作图法将其分别定位在第6染色体和第9染色体上,2个QTL均表现为增效作用,增效位点来自于粳稻亲本日本晴,其加性效应值分别为1.49%和1.32%,加性效应百分率分别为1.89%和1.68%。该研究对进一步发掘和利用新的水稻糙米率QTL具有重要意义,同时对提高水稻糙米率、增加稻米的实际产量具有十分重要的经济价值。

关键词: 水稻, 糙米率, 数量性状位点, 染色体单片段代换系, 代换作图

Abstract: Brown rice rate is one of the indexes for rice milling quality measurement.In this study, the inherit-ance of brown rice rate was characterized using 119 chromosome single segment substitution lines ( CSSSLs ) derived from Nipponbare and Guangluai 4.One-way ANOVA and Dunnett's test were employed to compare the difference between CSSSLs and the recurrent parent Guangluai 4.We detected 2 QTL(P≤0.001) for brown rice rate which were primarily mapped on chromosome 6 and 9 by substitution mapping.Both of the allele from donor parent Nip-ponbare had positive effects.The additive effects of 2 QTL were 1.49% and 1.32% respectively, with additive effect percentages 1.89%and 1.68%.These results provide useful information for exploring and using new brown rice rate related QTL,and also have important economic value for increasing brown rice rate and actual production of rice.

Key words: Rice, BRown Rice Rate, Quantitative tRait loci, ChRomosome single segment substitution lines, Substitution mapping

中图分类号:

S511

周勇, 高云, 朱松松, 朱金燕, 王军, 裔传灯, 仲维功, 梁国华. 基于染色体单片段代换系的水稻糙米率QTL的定位[J]. 华北农学报, 2013, 28(6): 1-5. doi: 10.7668/hbnxb.2013.06.001.

ZHOU Yong, GAO Yun, ZHU Song-song, ZHU Jin-yan, WANG Jun, YI Chuan-deng, ZHONG Wei-gong, LIANG Guo-hua. QTL Mapping of BRown Rice Rate Using ChRomosome Single Segment Substituted Lines in Rice[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2013, 28(6): 1-5. doi: 10.7668/hbnxb.2013.06.001.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2013/V28/I6/1

参考文献

[1] Fitzgerald M A,McCouch S R,Hall R D.Not just a grain of rice: the quest for quality[J].Trends Plant Sci,2009,14( 3): 133-139.
[2] Wang C,Chen S,Yu S.Functional markers developed from multiple loci in GS3 for fine marker-assisted selection of grain length in rice[J].Theor Appl Genet,2011,122( 5): 905-913.
[3] 罗玉坤,杨金华.中国优特稻种资源评价[M].北京:中国农业出版社, 1998.
[4] 张小明,石春海,鲍根良,等.稻米外观和碾磨性状的数量遗传及相关性研究进展[J].浙江农业学报,2002,14( 3): 182-186.
[5] 石春海,朱军.水稻植株农艺性状与稻米碾磨品质的遗传相关性分析[J].浙江农业大学学报,1997,23( 3): 331-337.
[6] 李欣,汤述翥,印志同,等.粳型杂种稻米品质性状的表现及遗传控制[J].作物学报,2000,26( 4): 411 －419.
[7] 徐正进,陈温福,马殿荣,稻谷粒形与稻米主要品质性状的关系[J].作物学报,2004,30( 9): 894-900.
[8] Aluko G,Martinez C,Tohme J.QTL mapping of grain quality traits from the interspecific cross Oryza sativa × O.glaberrima[J].Theor Appl Genet,2004,109( 3): 630 －639.
[9] Li Z F,Wan J M,Xia J F, et al.Identification of quantitative trait loci underlying milling quality of rice ( Oryza sativa) grains[J].Plant Breeding,2004,123( 3): 229-234.
[10] Kepiro J L,McClung A M,Chen M H,et al.Mapping QTL for milling yield and grain characteristics in a tropical japonica long grain cross[J].Journal of Cereal Science,2008,48( 2): 477-485.
[11] 梅德勇,朱玉君,樊叶杨.籼稻稻米碾磨与外观品质性状的QTL 定位[J].遗传,2012,34 ( 12): 1591 －1598.
[12] 曾瑞珍,施军琼,黄朝锋,等.籼稻背景的单片段代换系群体的构建[J].作物学报, 2006,32( 1): 88-95.
[13] 王军,朱金燕,周勇,等.基于染色体单片段代换系的水稻粒形QTL 定位[J].作物学报2013,39( 4):617-625.
[14] 王军,朱金燕,周勇,等.基于CSSSLs 的水稻穗长 QTL 的定位[J].华北农学报, 2012,27( 1): 68-73.
[15] 朱金燕,嵇朝球,周勇,等.利用染色体单片段代换系定位水稻株高QTL[J].植物学报, 2011,46( 6): 632 －641.
[16] Young D,Tanksley S D.Restriction fragment length polymorphism maps and the concept of graphical genotypes[J].Theor Appl Genet,1989,77( 1): 95-101.
[17] McCouch S R,Doerge R W.QTL mapping in rice[J].Trends Genet.1995,11( 12): 482-487.
[18] Eshed Y,Zamir D.An introgression line population of Lycopersicon pennellii in the cultivated tomato enables the identification and fine mapping of yield-associated QTL[J] ,Genetics.1995,141( 3): 1147-1162.
[19] Paterson A H,Deverna J W,Lanini B.Fine mapping of quantitative trait loci using selected overlapping recombinant chromosomes in an interspecies cross of tomato [J].Genetics,1990,124( 3): 735-742.
[20] Law C N,Worland A J.Inter-varietal chromosome substitution lines in wheat revisited[J].Euphytica,1996,89( 1): 1-10.
[21] 杨武云,胡晓蓉,毛沛.采用桥梁单体培育小麦品种问染色体代换系的新方法[J].华北农学报, 1997,12( 4): 23-27.
[22] Hao W,Zhu M Z,Gao J P, et al.Identification of quantitative trait loci for rice quality in a population of chromosome segment substitution lines[J].J Integr Plant Biol,2009,51( 5): 500-512.
[23] 曾瑞珍,阿克沙,刘芳,等.利用单片段代换系定位水稻粒形QTL[J].中国农业科学,2006,39( 4): 647 －654.
[24] Yamamoto T,Yonemaru J,Yano M.Towards the understanding of complex traits in rice: substantially or superficially[J].DNA Ｒes,2009.
[25] 汤在祥,徐辰武.复杂性状遗传分析策略和方法研究进展[J].中国农业科学, 2008,41( 5): 1255-1266
[26] 葛莘.高级植物分子生物学[M].北京: 科学出版社, 2004.
[27] Yu B,Lin Z,Li H, et al.TAC1,a major quantitative trait locus controlling tiller angle in rice[J].Plant J, 2007,52( 5): 891-898.
[28] Zhou Y,Zhu J,Li Z, et al.Deletion in a quantitative trait gene qPE9-1 associated with panicle erectness improves plant architecture during rice domestication[J].Genetics,2009,183( 1): 315-324.
[29] 江玲,曹雅君,王春明,等.利用ＲIL 和CSSL 群体检测水稻种子休眠性QTL[J].遗传学报,2003,30( 5): 453-458.
[30] 余传元,万建民,翟虎渠,等.利用CSSL 群体研究水稻籼粳亚种间产量性状的杂种优势[J].科学通报, 2005,50( 1): 32-37.
[31] Ye G,Liang S,Wan J.QTL mapping of protein content in rice using single chromosome segment substitution lines[J].Theor Appl Genet,2010,121( 4): 741-750.
[32] Li M,Sun P,Zhou H, et al.Identification of quantitative trait loci associated with germination using chromosome segment substitution lines of rice ( Oryza sativa L.) [J].Theor Appl Genet,2011,123( 3): 411-420.
[33] Marzougui S,Sugimoto K,Yamanouchi U, et al.Mapping and characterization of seed dormancy QTLs using chromosome segment substitution lines in rice[J].Theor Appl Genet,2011,124( 5): 893-902.
[34] Xu J,Zhao Q,Du P, et al.Developing high throughput genotyped chromosome segment substitution lines based on population whole-genome re-sequencing in rice ( Oryza sativa L.) [J].BMC Genomics,2010,11: 656.
[35] Zhang H,Zhao Q,Sun Z Z, et al.Development and highthroughput genotyping of substitution lines carring the chromosome segments of indica 9311 in the background of japonica Nipponbare[J].J Genet Genomics,2011,38( 12): 603-611.
[36] 王军,朱金燕,周勇,等.基于染色体单片段代换系的水稻芒性QTL 定位[J].华北农学报,2013,28( 3): 7-11.

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[1]	陈科, 廖冰, 刘国利, 黄秀艳, 何平. 野生稻SSSLs孕穗期对干旱胁迫的响应[J]. 华北农学报, 2025, 40(2): 81-91.
[2]	黄菊媛, 朱树明, 顾雪, 李晓金, 李顺和, 李丹丹, 李娟, 李文灿, 文建成. 不同水稻品系淀粉含量差异及其消化速率的分析[J]. 华北农学报, 2025, 40(2): 92-97.
[3]	关常铮, 段玉婷, 刘风, 罗龙欣, 祝海竣, 王学华. 灌溉方式与氮肥运筹对双季晚稻产量及氮肥利用率的影响[J]. 华北农学报, 2024, 39(5): 139-148.
[4]	孙安栋, 高建明, 吕芃, 裴忠有, 杨庭金, 罗峰. 高粱×苏丹草后代群体农艺及产量性状QTL初步定位[J]. 华北农学报, 2024, 39(5): 15-23.
[5]	浦娜, 高巧丽, 王慧, 刘金朝, 陈嘉玲, 罗增铜, 肖武名, 陈淳. OsSAUR55通过GA途径调控水稻株型[J]. 华北农学报, 2024, 39(2): 106-115.
[6]	周庚, 黄俊, 邹玉莹, 邓吉奇, 李家鑫, 谌强, 郭成龙, 李博文, 车凡昊, 姚威, 黄希来, 刘金灵, 刘雄伦. *分子标记辅助选择Pigm基因改良水稻不育系桃农1A的苗瘟抗性*[J]. 华北农学报, 2024, 39(2): 39-46.
[7]	赵明珠, 王丽丽, 马作斌, 唐志强, 郑文静. *水稻DEP1突变体籽粒品质性状及其代谢组分析*[J]. 华北农学报, 2023, 38(S1): 1-7.
[8]	杜晓东, 蔡永盛, 赵海新, 陈书强, 徐令旗, 杨丽敏. 花期低温胁迫对寒地水稻花粉粒及剑叶超微结构的影响[J]. 华北农学报, 2023, 38(S1): 78-85.
[9]	李康, 甘泉, 宋丰顺, 林翠香, 王晨, 吴先美, 赵学宇, 朱涵伟, 董效灵, 石英尧, 倪大虎. 粳(糯)稻穴播特性分析[J]. 华北农学报, 2023, 38(S1): 86-94.
[10]	刘晓龙, 廖婧芃, 钟歆, 段惜淼, 胡永轩, 刘嘉诚, 刘泽凯, 杨洪涛. 不同生育期高温胁迫下水稻OsRboh家族基因的表达模式[J]. 华北农学报, 2023, 38(5): 1-9.
[11]	张斌, 李小慧. *水稻OsPUT1基因的鉴定和功能初步验证*[J]. 华北农学报, 2023, 38(5): 10-18.
[12]	张艺籍, 李东坡, 肖富容, 李永华, 杜艳娣, 薛妍, 宋玉超, 张可, 张金明, 崔永坤. 生化抑制剂和浒苔多糖配施的稳定性尿素在黑土中的肥料效果[J]. 华北农学报, 2023, 38(5): 139-147.
[13]	汤彬, 耿存娟, 曾强, 郭欢乐, 李涵, 曹钟洋, 邓力超, 彭明, 周虹, 陈志辉. 玉米自交系籽粒响应高温胁迫的转录组分析[J]. 华北农学报, 2023, 38(4): 11-19.
[14]	摆小蓉, 闵炜芳, 石亚飞, 舍杨梦斐, 田浩天, 罗成科. 干旱对不同水稻萌发种子中逆境生理及相应基因表达的影响[J]. 华北农学报, 2023, 38(4): 101-111.
[15]	刘娟, 冯玉梅, 韩冰, 邢燕平, 李淑芬, 杨燕. *小麦株高相关基因TaGAMyb-B在水稻中的功能研究*[J]. 华北农学报, 2023, 38(3): 42-48.

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