黄瓜远缘群体分子遗传连锁图谱的构建和分析

doi:10.7668/hbnxb.2008.01.011

华北农学报 ›› 2008, Vol. 23 ›› Issue (1): 45-49. doi: 10.7668/hbnxb.2008.01.011

所属专题： 黄瓜；

黄瓜远缘群体分子遗传连锁图谱的构建和分析

徐晴¹, 张桂华², 韩毅科², 魏爱民², 杜胜利², 张显¹

1. 西北农林科技大学园艺学院, 陕西杨凌 712100;

2. 天津科润黄瓜研究所, 天津 300192

收稿日期:2009-09-20 出版日期:2008-02-28
通讯作者: 张桂华(1972-),女,河北冀州人,副研究员,博士,主要从事黄瓜生物技术育种研究。
作者简介:徐晴(1983-),女,河南平顶山人,在读硕士,主要从事蔬菜育种与生物技术研究。
基金资助:
天津市农业科技成果转化与推广项目(0502070);国家“863”引导项目(2005AA001030);天津市应用基础研究计划项目资助(07JCYBJC12200)

Construction and Analysis of the Molecular Genetic Linkage Map for Cucumber

XU Qing¹, ZHANG Gui-hua², HAN Yi-ke², WEI Ai-min², DU Sheng-li², ZHANG Xian¹

1. College of Horticulture, Northwest Science and Technology University of Agriculture and Forestry, Yangling 712100, China;
2. Tianjin Kernel Cucumber Research Institute, Tianjin 300192, China

Received:2009-09-20 Published:2008-02-28

摘要/Abstract

摘要： 以野生黄瓜品种和普通栽培黄瓜品种作亲本获得的142个F₂群体为材料,采用AFLP,SRAP,SSR等分子标记进行遗传分析,构建了包含10个连锁群,有159个标记组成的黄瓜遗传连锁图谱,其中包括112个AFLP标记,39个SRAP标记和8个SSR标记。该遗传图谱覆盖基因组长度743.11 cM,平均图距4.67 cM。

关键词: 黄瓜, 遗传图谱, AFLP, SRAP, SSR

Abstract: A F₂ populationwith 142 lines crossed by cultivated female parent andwide male parent were used to con -struct the genetic linkage map using AFLP, SRAP, SSR molecular markers. 159 markers including 112 AFLP markers, 39SRAP markers and 8 SSRmarkers integrated into 10 linkage groups.The map covered 743?11 cMwith an average markerinterval 4?67 cM. This was the first time that we combine AFLP, SRAP, SSRtogether to construct the genetic linkage mapof the cucumber(Cucumis Sativus L.).

Key words: Cucumis Sativus L, Genetic map, AFLP, SRAP, SSR

中图分类号:

S642.203.2

徐晴, 张桂华, 韩毅科, 魏爱民, 杜胜利, 张显. 黄瓜远缘群体分子遗传连锁图谱的构建和分析[J]. 华北农学报, 2008, 23(1): 45-49. doi: 10.7668/hbnxb.2008.01.011.

XU Qing, ZHANG Gui-hua, HAN Yi-ke, WEI Ai-min, DU Sheng-li, ZHANG Xian. Construction and Analysis of the Molecular Genetic Linkage Map for Cucumber[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2008, 23(1): 45-49. doi: 10.7668/hbnxb.2008.01.011.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2008/V23/I1/45

参考文献

[1] 张桂华. 与黄瓜白粉病抗性相关基因紧密连锁的分子标记研究[J]. 园艺学报, 2004, 31(2):189-192.
[2] 王惠哲. 与黄瓜抗炭疽病相关基因连锁的AFLP 标记的筛选[J]. 园艺学报, 2007, 34(1):213-216.
[3] 张海霞, 张海英. 与黄瓜抗枯萎病基因连锁的 RAPD 标记[J]. 华北农学报, 2006, 21(2):121-123.
[4] Fanourakis N E, Simon P W. Analysis of genetic linkage inthe cucumber[J]. J Heredity, 1987, 78(4):238-242.
[5] Pierce L K, Wehner T C. Review of genes and linkage groupsin cucumber[J]. Horticulture, 1990, 25(6):605-615.
[6] Kennard W C, Poetter K, Dijkhuizen A, et al. Linkagers a-mong RALP, RAPD, isozyme, disease resistance and morpho-logical markers in narrow and wide crosses of cucumber[J].Theor Appl Genet, 1994, 89:42-48.
[7] Melic V, Staub J E. Inheritance and linkage relationships ofisozyme and morphological loci in cucumber[J]. Theor ApplGenet, 1996, 92:865-872.
[8] Serquen F C, Bacher J, Staub J E. Mapping and QTL analysisof horticultural traits in a narrow cross in cucumber using ran-dom-amplified polymorphic DNA markers [J]. Mol Breed,1997, 3(4):257-268.
[9] Park Y, Sensory S, Wye C, et al. A genetic map of cucumbercomposed of RAPDs, RFLPs, AFLPs, and loci conditioning re-sistance to papaya rings pot and zucchini yellow mosaic virus-es[J]. Genome, 2000, 43(6):1003-1010.
[10] Bradeen JM, Staub J E, Wye C, et al.Towards an expandedand integrated linkage map of cucumber[J]. Genome, 2001,44(1):111-119.
[11] Fazio G, Staub J E, StevensM R. Genetic mapping and QTLanalysis of horticultural traits in cucumber(Cucumis sativusL.)using recombinant inbred lines[J]. Theoretical and Ap-plied Genetics, 2003, 107:5, 864-874.
[12] 张海英, 葛风伟. 黄瓜分子遗传图谱的构建[J]. 园艺学报, 2004, 31(5):617-622.
[13] 李效尊, 潘俊松. 黄瓜侧枝基因(lb)和全雌基因(f)的定位及 RAPD 遗传图谱的构建[J]. 自然科学进展,2004, 14(11):1225-1229.
[14] Vos P,Hongers R, Bleeker M, et al. AFLP:a new techniquefor DNA fingerprinting[J]. Nucleic Acidsres, 1995, 23(21):4407-4414.
[15] 林忠旭, 张献龙, 聂以春, 等. 棉花 SRAP 遗传连锁图构建[J]. 科学通报, 2003, 48(15):1676-1679.
[16] 朱正歌, 贾继增, 孙宗修. 水稻 AFLP 指纹银染法显带研究[J]. 中国水稻科学, 2002, 16(1):71-73.
[17] 蔡长春, 傅廷栋. 甘蓝型油菜遗传图谱的构建及开花期的QTL 分析[J]. 中国油料作物学报, 2007, 29(1):1-8.
[18] 黄焕焕, 张桂华, 韩毅科, 等. 黄瓜作图亲本间分子标记的多态性分析[J]. 华北农学报, 2007, 22(2):47-49.
[19] 王美, 张凤兰, 孟祥东, 等. 中国白菜 AFLP 分子遗传图谱的构建[J]. 华北农学报, 2004, 19(1):28-33.
[20] 易克. 西瓜遗传图谱的构建及其重要农艺性状的基因定位[D]. 长沙:湖南农业大学, 2002.
[21] ?崔江慧, 薛? 薇, 段西飞, 等. 高粱 AFLP 分子连锁图谱的构建[J]. 华北农学报, 2007, 22(4):120-123.
[22] Li G, Quiros C F. Sequence related amplified polymorphism(SRAP), a new maker system based on a simple PCR reac-tion Its application to mapping and gene tagging in Brassica.
[J].Theor Appl Gnent, 2001, 103:455-461.
[23] 吴洁, 谭文芳. 甘薯 SRAP 连锁图谱构建淀粉含量QTL 检测[J]. 分子植物育种, 2005, 3(6):841-845.
[24] 王刚, 潘俊松. 黄瓜 SRAP 遗传连锁图的构建及侧枝基因定位[J]. 中国科学(C 辑生命科学), 2004, 34(6):510-516.
[25] 张帆, 万雪琴. 玉米分子遗传图谱的构建[J]. 玉米科学, 2006, 14(3):6-9.
[26] 彭勇, 梁永书. 水稻 SSR 标记在 RI 群体中的偏分离分析[J]. 分子植物育种, 2006, 4(6):786-790.
[27] 金梦阳, 刘列钊. 甘蓝型油菜 SRAP, SSR, AFLP 和TRAP标记遗传图谱构建[J]. 分子植物育种, 2006, 4(4):520-526.
[28] Ramachandran C, Seshadri V S. Cytological analysis of thegenome of cucumber(Cucumis sativus L.)and musk melon(Cucumis melon)[J]. Z Pflanenzuecht, 1986, 96:25-38.

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[1]	伊六喜, 邬阳, 曹彦, 贾海滨, 斯钦巴特尔, 高凤云, 周宇, 贾霄云. 亚麻主要产量相关性状的SSR关联分析[J]. 华北农学报, 2022, 37(5): 52-61.
[2]	凌晨, 赵洪, 颜军, 马莹雪, 冯艳芳, 张靖立, 李波, 邓超, 徐振江. 基于SSR标记的莴苣品种鉴定体系的建立及应用[J]. 华北农学报, 2022, 37(4): 34-44.
[3]	石嘉琦, 刘宇庆, 王艳玲, 杨再强. 施氮对高温胁迫下黄瓜果期荧光特性的影响[J]. 华北农学报, 2022, 37(2): 84-95.
[4]	张馨方, 张树航, 李颖, 郭燕, 王广鹏. 基于SSR标记构建燕山板栗核心种质[J]. 华北农学报, 2021, 36(S1): 31-38.
[5]	董丽, 石海春, 赵长云, 余学杰, 柯永培. 玉米矮秆突变体K718d的遗传鉴定[J]. 华北农学报, 2021, 36(6): 71-77.
[6]	刘婷婷, 卫旭阳, 翟锡姣, 曹世宇, 郑少文. 外源褪黑素对盐渍环境下黄瓜幼苗生长的影响[J]. 华北农学报, 2021, 36(3): 125-132.
[7]	李靓, 于卓, 于肖夏, 杨东升, 卢倩倩, 李景伟, 李佳奇, 刘宇飞. 6个马铃薯新品系的细胞学及SSR分析[J]. 华北农学报, 2021, 36(2): 74-80.
[8]	伊六喜, 萨如拉, 王树彦, 李志伟, 斯钦巴特尔, 李强. 亚麻木酚素含量的SSR关联分析[J]. 华北农学报, 2021, 36(1): 63-70.
[9]	柴阿丽, 陈利达, 许帅, 帕提古丽·艾斯木托拉, 王利丽, 石延霞, 谢学文, 李磊, 李宝聚. 新疆喀什辣椒轻斑驳病毒和黄瓜花叶病毒复合侵染的分子鉴定[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 332-337.
[10]	张久坤, 齐阳阳, 李立竹, 宁哓霜, 刘志华, 姜振峰, 李文滨. 利用BSA法定位大豆全基因组株高QTL及候选基因分析[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 1-10.
[11]	于越, 陈海燕, 周龙, 郭冬雪, 宫思宇, 郝宁, 杜亚琳, 武涛. *黄瓜果实发育相关基因CsIAA29的克隆与表达分析*[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 11-17.
[12]	宫思宇, 陈海燕, 郭冬雪, 于越, 武涛. *黄瓜抗旱相关基因CsMYB94的克隆与表达分析*[J]. 华北农学报, 2020, 35(S1): 18-23.
[13]	董辉, 杨莉, 李莉, 张建军, 范婧芳, 宋世佳, 杨雷, 李海山. 基于SLAF-seq技术构建栽培草莓高密度遗传图谱[J]. 华北农学报, 2020, 35(6): 52-57.
[14]	蒋景龙, 李丽. 转录组学分析外源H₂S调控黄瓜响应盐胁迫的机理[J]. 华北农学报, 2020, 35(5): 17-25.
[15]	吕冰冰, 代畅, 彭正松, YAMAMOTO Naoki, 吴一超, 魏淑红, 杨在君. 一组新的小麦EST-SSR标记开发及其在遗传图谱构建中的应用[J]. 华北农学报, 2020, 35(4): 57-63.

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