华北农学报 ›› 2017, Vol. 32 ›› Issue (5): 136-141. doi: 10.7668/hbnxb.2017.05.021

所属专题: 畜牧 生物技术

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湖南省健康猪群中不同基因型猪博卡病毒流行性及进化分析

屈泰龙, 李润成, 罗斌宇, 葛猛, 严美君, 胡辉灿, 余兴龙   

  1. 湖南农业大学 动物医学院, 湖南 长沙 410128
  • 收稿日期:2017-07-22 出版日期:2017-10-28
  • 通讯作者: 余兴龙(1965-),男,湖南岳阳人,教授,博士,博士生导师,主要从事畜禽疫病的诊断、分子病毒学与基因工程研究。
  • 作者简介:屈泰龙(1986-),男,河南开封人,在读博士,主要从事动物疫病防控研究。
  • 基金资助:
    湖南省战略性新兴产业科技攻关类项目(2016GK4015)

Prevalence and Phylogenetic Analysis of Multiple Porcine bocavirus Genotypes in Clinically Healthy Pigs in Hunan Province

QU Tailong, LI Runcheng, LUO Binyu, GE Meng, YAN Meijun, HU Huican, YU Xinglong   

  1. Veterinary Faculty, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, China
  • Received:2017-07-22 Published:2017-10-28

摘要: 为了解猪博卡病毒在不同年龄健康猪群中的感染情况,通过对GenBank登录的猪博卡病毒基因序列分析设计2对引物可分别扩增PBoV1/2的部分NS1基因和PBoV3/4/5的部分VP1基因。提取2016年8-12月收集自湖南5个集约化猪场2~20周龄猪共430份肛门拭子样品的DNA并进行PCR检测。PBoV阳性率为64.6%(278/430),PBoV1/2阳性率为27.2%(117/430),PBoV3/4/5阳性率为45.1%(194/430),混合感染率为7.7%(33/430),PBoV3/4/5阳性率显著高于PBoV1/2阳性率(P=0.034)。PBoV1/2在2~10周检出率高于其他周龄,但是与其他周龄猪体内检出率统计分析无显著性差异,PBoV3/4/5主要感染8~16周猪,与4周以内猪差异显著,与其他猪群差异不显著。对各型的核苷酸与参考序列核苷酸相似性分析显示PBoV1/2之间的平均相似度为85.4%,PBoV3/4/5之间的平均相似度为67.2%。PBoV在健康猪群中流行广泛且存在共同感染现象,对猪的健康尤其是肠道微生物平衡可能存在潜在影响。

关键词: 猪博卡病毒, 流行性, 进化分析, 混合感染, 致病性

Abstract: To evaluate the prevalence of PBoV in healthy pig in different age,primers targeting to partial NS1 gene of PBoV1/2 and VP1 gene of PBoV3/4/5 were designed based on the analysis of PBoV sequences from GenBank.Total 430 anal swab species were collected from 5 pig farms with the pig'age of 2-20 weeks from August to December 2016 in Hunan Province.The total positive rate of PBoV was 64.6% (278/430),PBoV1/2 for 27.2%(117/430),PBoV3/4/5 for 45.1%(194/430) and with 7.7%(33/430) positive rate of coinfection.The mainly infection age of PBoV1/2 ranged 2-10 weeks,and PBoV3/4/5 from 8-16 weeks.The average nucleotide identity of obtained sequences and references of PBoV1/2 and PBoV3/4/5 was 85.4% and 67.2%,respectively.High prevalence and coinfection were observed in clinically healthy pigs,which may cause potential effect to the microbes in the gut.

Key words: PBoV, Prevalence, Phylogenetic analysis, Coinfection, Pathogenicity

中图分类号: 

引用本文

屈泰龙, 李润成, 罗斌宇, 葛猛, 严美君, 胡辉灿, 余兴龙. 湖南省健康猪群中不同基因型猪博卡病毒流行性及进化分析[J]. 华北农学报, 2017, 32(5): 136-141. doi: 10.7668/hbnxb.2017.05.021.

QU Tailong, LI Runcheng, LUO Binyu, GE Meng, YAN Meijun, HU Huican, YU Xinglong. Prevalence and Phylogenetic Analysis of Multiple Porcine bocavirus Genotypes in Clinically Healthy Pigs in Hunan Province[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2017, 32(5): 136-141. doi: 10.7668/hbnxb.2017.05.021.

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