华北农学报 ›› 2015, Vol. 30 ›› Issue (2): 161-165. doi: 10.7668/hbnxb.2015.02.029

所属专题: 油料作物

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食用向日葵SSR-PCR反应体系的优化

胡小利1, 马庆1, 包海柱2, 范瑞1, 孙希利1, 马蓉1   

  1. 1. 内蒙古农业大学 农学院, 内蒙古 呼和浩特 010019;
    2. 内蒙古农牧业科学院, 内蒙古 呼和浩特 010031
  • 收稿日期:2015-02-10 出版日期:2015-04-28
  • 通讯作者: 马庆(1958-),男,内蒙古呼和浩特人,教授,硕士生导师,主要从事作物遗传育种研究。
  • 作者简介:胡小利(1987-),女,内蒙古赤峰人,在读硕士,主要从事向日葵遗传育种研究。
  • 基金资助:
    内蒙古自然科学基金项目(2010MS0308)

Optimization of SSR-PCR Reaction System in Confectionary Sunflower

HU Xiao-li1, MA Qing1, BAO Hai-zhu2, FAN Rui1, SUN Xi-li1, MA Rong1   

  1. 1. Agricultural College of Inner Mongolia Agricultural University, Huhhot 010019, China;
    2. Inner Mongolia Academy of Agricultural and Animal Husbandry Sciences, Huhhot 010031, China
  • Received:2015-02-10 Published:2015-04-28

摘要: 为建立食用向日葵分子标记反应体系,以食用向日葵四叶期叶片为DNA模板提取材料,采用单因素试验和正交试验设计,对SSR-PCR反应体系中的6因素(10×PCR Buffer、Mg2+ 、dNTPs、引物、 Taq DNA 聚合酶和DNA模板)在5水平上进行正交优化试验,并比较了不同浓度Mg2+ Taq DNA聚合酶、模板DNA对扩增效果的影响,结果表明,各因素水平变化对反应体系的影响为Mg2+ > Taq DNA 聚合酶(引物)>DNA模板>10×PCR Buffer>dNTPs。最终建立食用向日葵SSR-PCR 最佳反应体系为:在总体系为20 μL的SSR-PCR反应体系中包括10×PCR Buffer 0.2 mmol/L、Mg2+2.0 mmol/L、dNTPs 1.8 mmol/L、Taq DNA聚合酶 0.2 U、DNA 50 ng、引物1.5 mmol/L。

关键词: 食用向日葵, SSR-PCR, 体系优化

Abstract: In order to established confectionary sunflower molecular markers reaction system, the study assuming DNA template from four-leaf stage of confectionary sunflowers leaves for experimental materials, this study used the single factor test and orthogonal design for optimizing six SSR-PCR reaction system factors (10×PCR Buffer, Mg2+, dNTPs, primers, Taq DNA polymerase, DNA template and compared different concentrations of Mg2+, dNTPs, Taq DNA polymerase and DNA template amplification effect of the impact in SSR-PCR reaction system.The result showed that the range of the influence of six factors in the reaction system was Mg2+> Taq DNA polymerase (primer)>DNA template>10×PCR Buffer>dNTPs.And this study established confectionary sunflower SSR-PCR reaction system(20 μL):10×PCR Buffer 0.2 mmol/L, Mg2+ 2.0 mmol/L, dNTPs 1.8 mmol/L, Taq DNA polymerase 0.2 U, DNA 50 ng, primer 1.5 mmol/L.

Key words: Confectionary sunflower, SSR-PCR, Reaction system

中图分类号: 

引用本文

胡小利, 马庆, 包海柱, 范瑞, 孙希利, 马蓉. 食用向日葵SSR-PCR反应体系的优化[J]. 华北农学报, 2015, 30(2): 161-165. doi: 10.7668/hbnxb.2015.02.029.

HU Xiao-li, MA Qing, BAO Hai-zhu, FAN Rui, SUN Xi-li, MA Rong. Optimization of SSR-PCR Reaction System in Confectionary Sunflower[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2015, 30(2): 161-165. doi: 10.7668/hbnxb.2015.02.029.

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