烟草TPK2基因的克隆与生物信息学分析

doi:10.7668/hbnxb.2013.06.014

华北农学报 ›› 2013, Vol. 28 ›› Issue (6): 82-87. doi: 10.7668/hbnxb.2013.06.014

所属专题： 烟草；生物技术；

烟草TPK2基因的克隆与生物信息学分析

鲁黎明, 叶科媛, 李立芹, 魏成成, 杨玲珑, 陈勇

四川农业大学农学院,四川成都,611130

收稿日期:2013-07-28 出版日期:2013-12-28
作者简介:鲁黎明(1965－),男,河南正阳人,副教授,博士,主要从事烤烟栽培生理生化研究。
基金资助:
四川省烟草专卖局科技项目(200703009)

Cloning and Bioinfomatic Analysis of TPK2 Gene in Tobacco

LU Li-ming, YE Ke-yuan, LI Li-qin, WEI Cheng-cheng, YANG Ling-long, CHEN Yong

College of Agronomy, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China

Received:2013-07-28 Published:2013-12-28

摘要/Abstract

摘要： 根据烟草的EST片段,采用3'RACE与5'RACE相结合的方法,克隆到了一个烟草推测钾转运基因TPK2。该基因所编码的蛋白包含563个氨基酸,分子量为62.6 kDa,等电点7.94。在结构上,TPK2具有植物行使钾转运功能的c15781保守域;同源性分析表明,TPK2与模式植物拟南芥、水稻等高亲和钾转运蛋白同源性较高。

关键词: 烟草, 基因克隆, TPK2, 钾, 生物信息学

Abstract: A putative potassium transporter gene TPK2 was cloned in tobacco with RACE method in this study.Bioinformatic analysis shows that TPK2 encodes a polypeptide consisting of 563 amino acids, and its molecular weight is 62.6 kDa, isoelectric point of 7.94.The amino acid sequence of TPK2 has the conserved domain of c15781 which is vital for potassium transport in plants.Homology analysis shows that TPK 2 shares high similarity with high affinity transporter proteins from arabidopsis, rice and other plants,which indicates that TPK2 may play a key role in tobacco potassium transport.

Key words: Tobacco, Gene cloning, TPK2, Potassium, Bioinfomatics

中图分类号:

S562

鲁黎明, 叶科媛, 李立芹, 魏成成, 杨玲珑, 陈勇. 烟草TPK2基因的克隆与生物信息学分析[J]. 华北农学报, 2013, 28(6): 82-87. doi: 10.7668/hbnxb.2013.06.014.

LU Li-ming, YE Ke-yuan, LI Li-qin, WEI Cheng-cheng, YANG Ling-long, CHEN Yong. Cloning and Bioinfomatic Analysis of TPK2 Gene in Tobacco[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2013, 28(6): 82-87. doi: 10.7668/hbnxb.2013.06.014.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2013/V28/I6/82

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