新城疫病毒河北分离株<em>F</em>基因的克隆及序列分析

doi:10.7668/hbnxb.2008.04.005

华北农学报 ›› 2008, Vol. 23 ›› Issue (4): 19-22. doi: 10.7668/hbnxb.2008.04.005

所属专题： 生物技术；

新城疫病毒河北分离株F基因的克隆及序列分析

张丽青^1,4, 王爱华², 张秀珊¹, 潘丽娜³, 杜冬华², 周静², 闫书彩¹, 孙继国¹

1. 河北农业大学动物科技学院,河北保定 071000;
2. 河北北方学院动物科技学院医学系,河北张家口 075000;
3. 承德市双桥区农业畜牧局,河北承德 067000;
4. 瑞普(保定) 生物药业有限公司,河北保定 071000

收稿日期:2008-04-22 出版日期:2008-08-28
通讯作者: 孙继国(1956-),男,河北保定人,教授,硕士,主要从事兽医卫生检验的研究工作
作者简介:张丽青(1980-),女,河北井陉人,在读硕士,主要从事新城疫病毒,摹因的克隆及转基因马铃薯的研究工作

Cloning and Sequence Analysis of F Gene of Newcastle Disease Virus Isolated from Hebei Province

ZHANG Li-qing^1,4, WANG Ai-hua², ZHANG Xiu-shan¹, PAN Li-na³, DU Dong-hua², ZHOU Jing², YAN Shu-cai¹, SUN Ji-guo¹

1. College of Science and Technology for Animal,Hebei Agricultural University,Baoding 071001,China;
2. Department of Animal Medicine,College of Animal Science,Hebei North University,Zhangjiakou 075000,China;
3. Chengde City Shuangqiao District Agricultural Bureau of Animal Husbandry,Chengde 067000,China;
4. Ringpu(Baoding)Bio-pharmaceutical Co.Ltd,Baoding 071000,China

Received:2008-04-22 Published:2008-08-28

摘要/Abstract

摘要： 参照GenBank中NDV的核酸序列设计一对引物,利用RT-PCR扩增F基因并得到长约1.7 kb的全基因片段,并将其构建到pMD-19T载体上。核苷酸序列测定结果表明:该基因片段全长1 662 bp,编码553个氨基酸,与Gen-Bank下载的13株参考毒株F基因比较,核苷酸和氨基酸序列同源性分别为97.2%-99.2%和96.9%-98.7%;但与LaSota、F48E9及B1等常见疫苗株的氨基酸同源性仅为88.6%-91.5%。NDV分离株F蛋白裂解位点的氨基酸序列为112R-R-Q-K-R-F-I-G119,属于基因ⅦNDV。

关键词: 新城疫病, F基因, 克隆, 序列分析

Abstract: One pair of primers for amplifying the F gene of NDV on GenBank were designed,withwhich the predict - ed 1. 7 kb fragment had been amplified via RT -PCR from NDV strainHebei. The 1. 7 kb fragment was inserted into pMD - 19T vector. DNA sequence analysis showed that the cloned fragment consisted of 1662 bp and coding for 553 amino acid. Compaired with 13 strainsof NDV on GenBank, neucleitide and amino acid sequence homologieswere found to be 97. 2% - 99. 2% and 96. 9% - 98. 7% respectively, but the amino acid sequence homologies to other NDV strains such as La - Sota,F48E9 and B1 were only 88. 6% - 91. 5%. The deduced amino acid sequence of the cleavage site of F protein of the NDV isolates were 112R -R -Q -K -R -F -I -G119. the NDV isolates belonged to the genetype.

Key words: Newcastle disease virus, F gene, Cloning, Sequence analysis

中图分类号:

S432.4+1

张丽青, 王爱华, 张秀珊, 潘丽娜, 杜冬华, 周静, 闫书彩, 孙继国. 新城疫病毒河北分离株F基因的克隆及序列分析[J]. 华北农学报, 2008, 23(4): 19-22. doi: 10.7668/hbnxb.2008.04.005.

ZHANG Li-qing, WANG Ai-hua, ZHANG Xiu-shan, PAN Li-na, DU Dong-hua, ZHOU Jing, YAN Shu-cai, SUN Ji-guo. Cloning and Sequence Analysis of F Gene of Newcastle Disease Virus Isolated from Hebei Province[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2008, 23(4): 19-22. doi: 10.7668/hbnxb.2008.04.005.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2008/V23/I4/19

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