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  • 曹金龙, 王莉, 曹玲芳, 郝凯茵, 顾继靓, 王宇, 车志军
    OFP是一类植物特有的转录因子,在调控植物器官形态建成和响应非生物胁迫等过程发挥重要作用。为了研究大豆OFP转录因子家族成员特征及其在干旱胁迫和盐胁迫中的作用,运用生物信息学方法对大豆OFP家族成员进行鉴定和分析。结果表明:在大豆中共鉴定到41个GmOFP基因,命名为GmOFP-1~GmOFP-41;这些基因不均匀地分布在大豆19条染色体上,编码152~414个氨基酸;亚细胞定位预测大豆OFP蛋白主要定位在细胞核、叶绿体、线粒体中;在大豆OFP蛋白中共鉴定到10个保守基序,其中保守基序1和2存在于所有OFP成员中;系统发育分析将大豆和拟南芥OFP蛋白分为5个亚家族Class Ⅰ~Class Ⅴ,其中大豆OFP家族基因主要分布在Class Ⅰ和Class Ⅲ中;共线性分析发现,大豆基因组OFP成员中有75对基因存在共线性关系,4对基因存在串联重复,仅有2个基因GmOFP-2GmOFP-39没有共线性关系,表明基因片段复制是导致大豆OFP家族成员增多的主要原因。通过qRT-PCR方法分析了GmOFP基因家族成员在干旱胁迫和盐胁迫处理下的表达模式,结果表明:与对照相比,41个GmOFP基因中有16个GmOFP成员在干旱处理后基因表达水平表现出显著差异,其中GmOFP-15GmOFP-17GmOFP-32显著上调表达,GmOFP-4GmOFP-5GmOFP-6GmOFP-9GmOFP-12GmOFP-21GmOFP-23GmOFP-25GmOFP-26GmOFP-27GmOFP-38GmOFP-39GmOFP-40显著下调表达;有8个GmOFP成员在盐处理后基因表达水平表现出显著差异,其中GmOFP-7GmOFP-14GmOFP-31GmOFP-32GmOFP-36GmOFP-40显著上调表达,GmOFP-1GmOFP-15显著下调表达。综上所述,大豆OFP基因家族在应对干旱胁迫和盐胁迫中可能具有重要功能。
  • 于天一, 樊兆博, 张佳蕾, 路亚, 吴菊香, 杨吉顺, 李尚霞, 吴正锋, 万书波
    为解析花生荚果响应水分胁迫的分子机制,利用盆栽试验并结合转录组学分析,以正常供水处理为对照,系统探究了花针期阶段性干旱和渍涝胁迫对花生产量、品质及基因表达的影响。结果表明,干旱和渍涝胁迫均显著降低花生荚果产量(降幅分别为26.43%和77.69%)及籽仁粗脂肪含量(降幅分别为9.46, 6.71百分点)。转录组分析进一步表明,干旱胁迫组与对照组、渍涝胁迫组与对照组分别鉴定出1 525,1 382个差异表达基因,且两类差异表达基因均以表达下调为主,其中,干旱胁迫抑制了花生荚果中与脂质和脂肪酸代谢相关的6个关键代谢过程,其中88.38%的基因表达呈下调趋势,揭示了脂质代谢紊乱可能是干旱导致花生产量和品质下降的主要原因。渍涝胁迫则主要通过下调催化活性、跨膜运输、氧化还原及次生代谢物的生物合成等相关基因的表达,干扰荚果的代谢与防御功能。此外,KEGG富集分析结果显示,代谢途径和次生代谢物生物合成通路在2种水分胁迫下均受到显著影响。关键基因qRT-PCR验证结果与RNA-seq数据一致,证实了转录组结果的可靠性。综上,从转录组层面阐明了花生荚果响应水分胁迫的分子基础,明确脂质代谢紊乱是干旱胁迫导致花生产量下降、品质变劣的主要原因,而花生主要通过调控荚果中氧化还原及代谢相关通路基因的表达,以应对渍涝胁迫带来的不利影响。
  • 管明威, 郭安强, 李和平, 翟兰菊, 李积铭, 李爱国
    为了探究北方寒旱区白菜型油菜与甘蓝型油菜的越冬率、产量差异,各农艺性状与平均产量之间的相关关系与抗寒优势性状,以45个甘蓝型油菜与22个白菜型油菜品种为研究对象,统计分析了甘蓝型油菜与白菜型油菜的越冬率、平均产量与各农艺性状,挑选并统计了产量水平相近的甘蓝型油菜与白菜型油菜在不同密度种植条件下的产量,比对了甘蓝型油菜与白菜型油菜苗期根系性状的差异。结果表明:67个油菜品种中,白菜型油菜的越冬率平均水平(97.59%)显著高于甘蓝型油菜(65.87%),甘蓝型油菜的产量潜力要高于白菜型油菜。对于能够稳定越冬的白菜型油菜,增加播种密度虽然显著提高了有效株数,但是不能提高产量;而对于甘蓝型油菜,其较低的越冬率限制了有效株数的提高,从而限制了平均产量。目前具有高越冬率的甘蓝型油菜品种越冬后表现出更高分枝部位与结角密度,更少二次分枝数、总分枝数与单株有效角果数的农艺性状。甘蓝型油菜与白菜型油菜根系性状之间的对比显示,膨大的根系、短下胚轴及生长点位于地面以下,是白菜型油菜强抗寒性的优势性状。培育具有白菜型油菜根系性状特点、生长点位于地面以下的耐密甘蓝型油菜,是提高甘蓝型油菜越冬率,促进油菜产量提升,确保油料供给的重要育种方向。
  • 杨云马, 聂浩亮, 黄少辉, 杨慧敏, 贾良良, 李保军, 司峻宇, 杨军芳, 孙彦铭, 杨文方, 温国昌, 浦玉朋, 邢素丽

    旨在研究华北地区小麦玉米轮作体系下,玉米秸秆还田在培肥地力、提高产能方面的作用,探寻秸秆最佳还田方式和适宜还田量。2021—2023年,在河北省曲周县,通过田间裂区试验,对比了玉米秸秆不同还田方式及用量对小麦生长发育、产量构成及土壤有机质含量的影响。主区设2个处理,分别为秸秆切段还田和秸秆粉碎还田;副区为秸秆还田量,4个水平,分别为当年玉米秸秆量的0,0.5,1.0,1.5倍。研究表明:与秸秆粉碎还田相比,2023年玉米秸秆切段还田小麦产量提高4.3%,穗数提高7.6%,收获指数提高1.4%,均达显著水平;小麦秸秆N含量高0.04百分点,差异显著;小麦地上部N、P吸收量分别显著提高10.8%,14.3%(2022年),但秸秆切段还田显著降低了小麦秸秆K含量,降低0.13百分点(2023年);切段还田能够明显促进小麦越冬前后生长,拔节期NDVI值提高11.9%(2022年);土壤pH值增加0.22个单位(2023年)。随着秸秆还田量的增加,小麦产量和拔节期NDVI值呈现先升后降的趋势,地上部小麦N、P、K吸收量呈现显著下降趋势,土壤有机质呈现持续显著增加趋势。综合小麦生长势和产量,秸秆切段处理适宜还田比例为58%~62%,粉碎处理适宜还田比率为29%~42%。在设置试验条件下,玉米秸秆切段还田在促进小麦生长、提高小麦产量等方面有明显优势;将58%~62%的玉米秸秆进行切段还田,可在小麦玉米轮作区域推广应用。

  • 戴相林, 马瑞萍, 李皓, 孙建平, 山楠, 赵子婧, 刘雅辉, 姚玉涛, 艾超, 李玉义, 董磊明
    阐明不同施氮水平下滨海盐渍稻田水稻秸秆腐解及其养分释放和化学组分变化规律,以期为完善滨海稻区秸秆还田技术,实现滨海区域秸秆资源高效利用,提供科学依据和技术支撑。试验地点位于河北省唐山市曹妃甸区,以水稻秸秆为研究对象,设置4个施氮量水平:N0(0 kg/hm2)、N1(225 kg/hm2)、N2(300 kg/hm2)和N3(375 kg/hm2),进行360 d的秸秆包填埋试验,研究水稻秸秆及其木质纤维素腐解率和氮、磷、钾养分释放特征。结合热裂解气相色谱质谱联用(Py-GC-MS)技术,探究腐解期秸秆主要化学组分变化规律。结果表明:水稻秸秆可分为快速腐解期(第0~30 天)、腐解减缓期(第30~210天)和腐解缓慢期(第210~360天)3个阶段。360 d后不同施氮量处理下的秸秆平均腐解率为72.5%。增加施氮量可显著提高秸秆腐解率。与N0处理相比,N1、N2和N3处理,分别提高秸秆腐解率6.1,7.4,9.2百分点。秸秆碳释放率与秸秆腐解率变化趋势类似,但试验结束后碳释放率仅为43.2%。秸秆养分释放率表现为:钾>磷>氮。秸秆氮、磷和钾快速释放期,分别在秸秆腐解后的第0~30天(38.4%),0~60天(63.7%),0~15天(76.7%)。秸秆氮、磷在腐解期内均出现了富集现象。施氮可显著提高腐解期内秸秆氮的释放,腐解早期(第0~15天)和后期(第150~360天)磷的释放,以及腐解早期(第0~15天)钾的释放。与N0处理相比,N1、N2和N3处理,分别提高秸秆氮释放率6.6,11.1,14.7百分点,秸秆磷释放率2.2,4.0,5.6百分点和秸秆钾释放率1.4,2.1,2.8百分点。秸秆木质纤维素腐解率表现为:半纤维素>纤维素>木质素。增施氮肥可显著促进第0~90天秸秆纤维素和半纤维素腐解率,以及第90天后的木质素腐解率。与N0处理相比,N1、N2和N3处理,分别提高秸秆纤维素腐解率5.4,7.3,8.4百分点,半纤维素腐解率4.9,6.4,7.4百分点,木质素腐解率2.1,5.1,5.7百分点。2-甲氧基-4-乙烯基苯酚、羟基丙酮、2,3-二氢苯并呋喃、乙酰丁香酮、丁香酚、正十六烷酸、对甲基苯酚、2,6-二甲氧基苯酚、愈创木酚、对乙基苯酚和豆甾-3,5-二烯,为腐解期内秸秆残留物的主要(相对含量>1%)化学组分。相关性分析表明,秸秆腐解率、碳释放率及纤维素、半纤维素和木质素腐解率,均与丁香酚、乙酰丁香酮、2,3-二氢苯并呋喃显著正相关,而与羟基丙酮显著负相关;秸秆磷释放率与羟基丙酮显著正相关,而与对乙基苯酚、丁香酚和乙酰丁香酮显著负相关;秸秆钾释放率与对乙基苯酚、丁香酚、乙酰丁香酮和2,3-二氢苯并呋喃显著正相关,而与羟基苯酮显著负相关。综上所述,增施氮肥能够促进滨海盐渍稻田秸秆及其木质纤维素腐解和氮、磷和钾养分的释放。推荐滨海盐渍土秸秆还田10 500 kg/hm2下的优化施氮量为300 kg/hm2。秸秆残余物中对乙基苯酚、丁香酚、乙酰丁香酮、2,3-二氢苯并呋喃、羟基丙酮和豆甾-3,5-二烯,对指示秸秆腐解进程具有重要意义。热裂解气相色谱质谱联用技术,有助于通过监测秸秆残留物化学组分变化,加深对秸秆腐解机制的认识。
  • 栾崇圣, 胡蕾蕾, 吴旗, 林雷利, 汪小宇, 李笑笑, 车钊, 王晓波, 宋贺, 吴巩
    为明确气候变暖和有机无机肥配施对大豆生长发育和产量的影响,通过红外辐射增温设备模拟田间增温,设置不同温度水平(T0: 环境温度;T1: 增温2.9 ℃)和不同施肥措施(SF: 单施无机肥;OF:有机无机肥配施),探究增温和有机无机肥配施对大豆干物质积累、光合速率、叶片酶活性和产量的影响。结果表明: 相比于环境温度,增温造成2023—2024年大豆花前和花后生育期分别缩短3~4 d,5~6 d;增温降低盛荚期叶片硝酸还原酶和谷氨酰胺合成酶的活性,降低大豆叶面积和净光合速率,导致花后株高和地上部干物质积累分别降低9.0%~13.7%,4.1%~19.3%;相比于单施无机肥,有机无机肥配施显著提高了叶片硝酸还原酶和谷氨酰胺合成酶的活性,增加了花后光合速率,促进了大豆的生长发育,干物质积累显著增加4.1%~15.3%。硝酸还原酶和谷丙转氨酶活性存在显著交互作用。产量结果表明,增温条件下单株荚数和单株粒数分别下降9.7%~16.6%,13.3%~19.0%,造成产量显著降低13.7%~21.1%;而有机无机肥配施条件下,单株粒数显著增加12.5%,单株荚数显著增加9.9%~10.5%,导致增产7.6%~10.8%。同时,叶面积、光合速率、氮代谢酶活性与产量之间存在显著正相关关系。综上,气候变暖会抑制大豆花后光合特性和地上部生长发育,造成产量下降,而有机无机肥配施一定程度上弥补增温带来的不利影响。
  • 曲远航, 苏振贺, 董丽红, 张晓云, 李社增, 郭庆港, 马平

    旨在建立一种基于根系分泌物的生防菌筛选体系,筛选具有根际强定殖能力的生防细菌,并利用该体系筛选与菌糠复配防治黄瓜枯萎病的细菌菌株。通过病原菌胁迫和菌糠诱导,调控黄瓜根系分泌物的化学组成,以待测菌株对根系分泌物的趋化性、代谢增殖和生物膜形成等定殖相关因素为定量指标,采用毛细管试验、96孔板培养和生物膜形成测定,实现根际强定殖细菌菌株的高效筛选。结果表明,从黄瓜根际分离的200株细菌对根系分泌物的趋化性、代谢增殖能力和生物膜形成能力存在显著差异。利用该筛选体系,筛选出的贝莱斯芽孢杆菌MTC-5菌株在所有筛选指标中均表现优异。温室试验结果表明,MTC-5菌株与香菇菌糠复配具有更强的根际定殖能力,并在防病和促生上表现出显著的协同增效作用。MTC-5和菌糠的复配菌剂对黄瓜枯萎病的田间防病效果为74.5%,比单独施用菌糠和MTC-5菌株的防效分别超出10.7,24.6百分点。建立了一个基于根系分泌物的高通量生防菌筛选体系,揭示了根系分泌物在细菌招募中的关键作用。基于该体系创制的MTC-5菌株与菌糠的复配菌剂在防治黄瓜枯萎病中展现出显著的协同增效,为生防菌筛选和应用提供了新的思路和技术支持。

  • 王丁香, 李承隆, 郭晨浩, 冯登侦, 康晓龙
    肌内脂肪沉积作为影响肉品质(如嫩度、风味和多汁性)的关键因素,其调控机制与长链非编码 RNA(lncRNA)对脂肪生成和脂质代谢的调节密切相关。基于前期研究发现,滩羊肌内脂肪含量显著高于杜泊羊和小尾寒羊,以这3个绵羊品种的背最长肌为研究对象,通过转录组测序筛选差异表达 mRNAs(DE mRNAs)和 lncRNAs(DE lncRNAs)及其相关通路,旨在揭示滩羊高肌内脂肪沉积的分子机制。结果表明:在小尾寒羊和滩羊组筛选出836个DE mRNAs,832个DE lncRNAs,杜泊羊和滩羊组筛选出578个DE mRNAs,700个DE lncRNAs。两组分别取交集共得到226 DE mRNAs,308个DE lncRNAs,通过对308个DE lncRNAs进行靶基因预测,共预测到1 475个靶基因,其中预测到co_expression(共表达)靶基因687个,co_localization(共定位)靶基因有788个;通过对DE mRNAs进行GO和KEGG富集发现,其中与脂肪沉积相关的通路有肌动蛋白细胞骨架调节、催乳素信号通路等,其中FGF14FGF9等基因被报道参与动物的脂肪代谢过程。通过对预测到的共表达靶基因和共定位靶基因进行GO和KEGG富集分析,发现它们富集到与脂肪代谢的相关通路,如cAMP信号通路、催乳素信号通路、胰岛素信号通路等;通过对通路和功能分析进一步筛选出和脂肪代谢相关的CREBBPATP1B3PPP1R3CPIK3R1等基因,这些基因在绵羊肌内脂肪沉积方面可能发挥重要调控作用。随机选择的6个DE mRNAs和6个DE lncRNAs的qRT-PCR结果与转录组测序结果趋势一致。
  • 王亚岚, 梁雅新, 张兴臣, 禹保军, 李祥龙
    为研究糖原分支酶1(GBE1)基因多态性对坝上长尾鸡肉质风味及质量的影响,采用聚合酶链式反应(PCR)扩增目标片段并结合直接测序法分析GBE1基因的单核苷酸多态性(SNP),再与肉质性状进行相关性分析。结果表明:选取60只坝上长尾鸡作为研究对象,GBE1基因存在4个SNP位点(g.96619229T>C、g.96619243T>G、g.96619350C>T和g.96619544C>T),各位点均存在3种基因型,优势基因型分别为TT、TT、CC和CT。卡方检验表明,4个SNP位点均处于Hardy-Weinberg 平衡状态,多态信息含量(PIC)为0.262,0.262,0.332,0.373,显示出中等水平的多态性(0.25<PIC<0.50)。关联分析显示,在g.96619229T>C位点,携带TC基因型个体的腿肌肉中豆蔻酸含量显著超过TT基因型。同时,CC基因型的腿肌肉L*平均值也明显高于其他2种基因型。g.96619243T>G位点,TG基因型的豆蔻酸含量高于TT型,而GG基因型腿肌L*平均值显著高于TT和TG型。g.96619350C>T位点中,CT型豆蔻酸含量和腹脂率优于CC型,但腿肌L*平均值低于TT型。g.96619544C>T位点的CT基因型脂肪酸含量多项指标显著高于CC型,且CT基因型个体在屠体质量、全净膛质量、腹脂质量和腿肌质量方面表现优于其他基因型,而TT基因型腿肌宰后24 h pH值显著高于CC基因型。连锁不平衡分析表明,前3个SNP位点间存在强连锁关系,识别出6种主要单倍型,优势单倍型为TTC(0.708)。综上,GBE1基因SNP位点与坝上长尾鸡肉质性状显著相关,且3个内含子位点间存在强连锁关系,其单倍型TTC为优质肉质的坝上长尾鸡育种研究提供了参考依据。
  • 成春华, 陈涛, 张龙, 郭利建, 车卓, 马靖福, 杨德龙
    摘要 (267) RichHTML (55) PDF全文 (301)
    为解析小麦低温胁迫应答机制并挖掘优异抗寒基因资源,通过转录组测序揭示小麦低温响应的关键调控网络,并对候选基因TaGGCT18-6A进行功能验证。结果表明,4 ℃冷处理诱导小麦幼苗分别产生10 893个(6 h处理)和18 784个(24 h处理)差异表达基因,KEGG富集分析显示,差异基因显著富集于MAPK信号转导及谷胱甘肽代谢等通路。基于谷胱甘肽代谢途径关键基因筛选,克隆获得γ-谷氨酰环转移酶基因TaGGCT18-6A。该基因全长1 772 bp,编码218个氨基酸,其编码蛋白具有典型的GGCT-like超家族结构域及核心结构域ChaC。启动子顺式作用元件分析表明,该基因含低温响应元件(LTR)及脱水响应元件(DRE)等胁迫相关元件;表达模式分析发现,TaGGCT18-6A在4 ℃冷处理下呈持续上调趋势。转基因水稻功能验证表明,过表达株系在-4 ℃低温冻害胁迫下相较野生型对照,OE#1、OE#2和OE#3存活率与生物量显著提高,OE#1和OE#2的株高显著提高,OE#1、OE#2和OE#3相对电导率显著降低。经4 ℃冷处理后,过表达株系渗透调节物质(脯氨酸、可溶性糖)积累量较对照显著增加,丙二醛含量降低;SOD、POD和CAT活性显著上升。以上研究表明,TaGGCT18-6A通过调控谷胱甘肽代谢增强抗氧化能力,进而提高植物低温耐受性,为小麦抗寒分子育种提供理论依据和优异基因资源。
  • 李文, 姚敏, 贺丹, 邱萍, 何昕, 熊兴华, 刘忠松, 钱论文
    摘要 (109) RichHTML (13) PDF全文 (170)

    为了明晰甘蓝型油菜油脂积累的调控网络,选育高含油量油菜品种。以4个油菜自交系材料开花后25,35,45 d的种子转录组数据为样本,基于转录组和关联分析结合挖掘影响含油量的候选基因。转录组分析检测到1 530个基因在3个不同时期都存在差异表达,其中包括986个上调表达基因和544个下调表达基因。对这些差异表达基因进行GO富集分析,检测到83个油脂合成基因,79个油脂降解基因,21个油脂转运基因和80个转录因子。对差异表达转录因子进一步分析,检测到BnTT8BnGL2BnNAC082等基因。结合50份重测序甘蓝型油菜在2 a 3个不同区域的含油量表型,利用全基因组关联分析(GWAS)检测到BnNAC082-A03基因外显子区域的4个SNP与含油量显著关联,并检测到该基因区域存在2个单体型等位基因且BnNAC082-A03_Hap1对应材料的含油量显著高于BnNAC082-A03_Hap2对应材料。利用分析获得的转录组数据构建共表达网络,在子网络中检测到BnNAC082-A03与BnTT8-A09和BnGL2-C06直接相连,形成了影响种子油脂积累的潜在分子调控网络。

  • 王本龙, 周春生, 李利荣, 海珍, 娄雨欣, 刘学瑶, 刘萍
    为解决西辽河平原盐碱地耕层较浅、犁底层上移、土壤盐碱化等问题,于2020—2021年在内蒙古自治区通辽市科尔沁左翼中旗花吐古拉镇开展田间试验。设置2种耕作方式(传统旋耕与粉垄耕作)、2个灌溉定额(2 100,2 700 m3/hm2)以及覆膜与浅埋措施,共6组试验处理,分别为2 100 m3/hm2灌溉定额+传统旋耕+浅埋(CK×NM)、2 100 m3/hm2灌溉定额+传统旋耕+覆膜(CK×DM)、2 100 m3/hm2灌溉定额+粉垄耕作+浅埋(FA×NM)、2 100 m3/hm2灌溉定额+粉垄耕作+覆膜(FA×DM)、2 700 m3/hm2灌溉定额+粉垄耕作+浅埋(FB×NM)、2 700 m3/hm2灌溉定额+粉垄耕作+覆膜(FB×DM)。分析不同灌溉定额下粉垄耕作与覆膜处理对0~40 cm土层土壤性质结构、盐碱含量和玉米产量的影响。结果表明,相较于CK×NM处理,在0~40 cm土层,粉垄耕作+覆膜处理的土壤容重降低8.4%~22.9%、土壤总孔隙度提高4.9~14.8百分点、土壤三相比R值降低34.6%~88.2%,其中,FB×DM处理的土壤容重、总孔隙度、三相比R值分别显著降低20.0%,-13.1百分点和88.2%;20~40 cm土层播种后土壤含水量提高5.5~12.1百分点,7.5~17.5 cm土层的土壤硬度提高33.4%~397.5%,其中,FB×DM处理的土壤含水量、硬度分别显著提高12.1百分点,214.3%;FB×DM处理CO2通量显著提高496.4%。相较于CK×NM处理,粉垄耕作+覆膜处理降低0~40 cm土层土壤pH值、总碱度、电导率和全盐量,降低幅度分别为0.7%~10.9%,2.5%~67.5%,24.3%~68.7%和10.3%~81.0%。其中,FB×DM处理的土壤pH值、总碱度、电导率和全盐量分别显著降低10.9%,48.2%,59.2%和80.0%。玉米出苗率、穗鲜质量和产量较CK×NM处理分别提高13.2~20.1百分点,52.5%~68.2%和22.4%~45.5%,其中,FB×DM处理的出苗率、穗鲜质量和产量分别显著提高20.1百分点,68.2%和45.5%。综合改良效果和玉米产量考虑,认为2 700 m3/hm2灌溉定额下粉垄耕作+覆膜处理(FB×DM)为西辽河平原盐碱地较为适宜的耕作模式。
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