蒙古冰草基因组类反转录转座子基因同源序列的克隆与序列分析

doi:10.7668/hbnxb.2010.06.010

华北农学报 ›› 2010, Vol. 25 ›› Issue (6): 52-56. doi: 10.7668/hbnxb.2010.06.010

所属专题： 生物技术；

蒙古冰草基因组类反转录转座子基因同源序列的克隆与序列分析

石凤敏¹, 云锦凤^1,2, 赵彦^1,2, 张瑞霞³

1 内蒙古农业大学生态环境学院内蒙古呼和浩特 010018;
2 内蒙古自治区草品种育繁工程技术研究中心内蒙古呼和浩特 010018;
3 内蒙古大学内蒙古呼和浩特 010021

收稿日期:2010-06-07 出版日期:2010-12-28
通讯作者: 云锦凤(1941-)，女，内蒙古呼和浩特人，教授，博士生导师，主要从事牧草遗传育种研究。
作者简介:石风敏(1983-)，女，河北承德人，在读博士，主要从事植物分子遗传学研究。
基金资助:
“973”项目子课题(2007CB108901-1);国家自然科学基金资助项目(30760159);内蒙古草业重大专项(20091401)

Isolation and Sequence Analysis of a RetrOtransposon·like Sequence Derived from Agropyron mongolicum Keng

SHI Feng-min¹, YUN Jin-feng^1,2, ZHAO Yan^1,2, ZHANG Rui-xia³

1 College of Environment,Inner Mongolia Agricultural University,Huhhot 010018,China;
2 Inner Mongolia Engineering and Technique Center for Forage Breeding and Reproduction,Huhhot 010018,China;
3 Inner Mongolia University,Huhhot 010021,China

Received:2010-06-07 Published:2010-12-28

摘要/Abstract

摘要： 以蒙古冰草DNA为模板,采用PCR扩增的方法从蒙古冰草(Agropyron mongolicumKeng)中分离得到了一个类反转录转座子基因序列,命名为MwRRT(GenBank:GQ855806.1)。序列分析结果表明:该序列长为1 005 bp,包含780 bp的开放阅读框,编码260个氨基酸。经GenBank中BLAST程序分析表明,该片段98~255处氨基酸与水稻(Oryza sativa)预测逆转录转座子蛋白Ty3-gyP_sy亚类、预测种属特异抗原—聚合酶(Gag-Pol)前体和预测聚合酶氨基酸同源性为47%;与高粱(Sorghum bicolor)的预测GAG-POL前体氨基酸同源性为52%。

关键词: 蒙古冰草, 反转录转座子, 克隆

Abstract: A Ilew DNA fragment was amplified by PCR from DNA of Agropyron mongolicum Keng and was named MwRRT(GenBank GQ855806.1).Sequencing results showed that MwRRT was composed of 1 005 bp and encoded 260 amino acid residues.The homologies analysis of the amino acid sequence in GenBank showed that：it has 47%identity with putative retrotransposon protein Ty3-gypsy subclass、putative gag·pol precursor and putative polyprotein in Oryza sativa at the 98—255 amino acid；it has 52%identity with putative gag-pol precursor in Sorghum bicolor.

Key words: Agropyron mongolicum Keng, Retrotransposon, Cloning

中图分类号:

S543.9

石凤敏, 云锦凤, 赵彦, 张瑞霞. 蒙古冰草基因组类反转录转座子基因同源序列的克隆与序列分析[J]. 华北农学报, 2010, 25(6): 52-56. doi: 10.7668/hbnxb.2010.06.010.

SHI Feng-min, YUN Jin-feng, ZHAO Yan, ZHANG Rui-xia. Isolation and Sequence Analysis of a RetrOtransposon·like Sequence Derived from Agropyron mongolicum Keng[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2010, 25(6): 52-56. doi: 10.7668/hbnxb.2010.06.010.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2010/V25/I6/52

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