乙脑病毒Henan-09-03株E蛋白结构与功能生物信息学分析

doi:10.7668/hbnxb.2015.05.006

华北农学报 ›› 2015, Vol. 30 ›› Issue (5): 36-40. doi: 10.7668/hbnxb.2015.05.006

乙脑病毒Henan-09-03株E蛋白结构与功能生物信息学分析

张二芹^1,2, 滕蔓¹, 罗俊¹, 王瑞宁^1,2, 许倩茹^1,2, 邓瑞广¹, 张改平²

1. 河南省农业科学院, 河南省动物免疫学重点实验室, 农业部动物免疫学重点实验室, 河南郑州 450002;
2. 河南农业大学牧医工程学院, 河南郑州 450002

收稿日期:2015-07-20 出版日期:2015-10-28
通讯作者: 张改平(1960-),男,河南内黄人,研究员,博士,院士,主要从事动物免疫学研究。
作者简介:张二芹(1976-),女,河南焦作人,副教授,博士,主要从事动物分子病毒学及转基因植物疫苗研究。
基金资助:
河南省博士后科研资助项目(2013047)

Bioinformatics Analysis of Structure and Function of Envelope Protein of Japanese Encephalitis Virus Henan-09-03 Strain

ZHANG Er-qin^1,2, TENG Man¹, LUO Jun¹, WANG Rui-ning^1,2, XU Qian-ru^1,2, DENG Rui-guang¹, ZHANG Gai-ping²

1. Henan Key Laboratory of Animal Immunology, Key Laboratory of Animal Immunology of the Ministry of Agriculture, Henan Academy of Agricultural Sciences, Zhengzhou 450002, China;
2. College of Animal Science and Veterinary Medicine, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450002, China

Received:2015-07-20 Published:2015-10-28

摘要/Abstract

摘要： 利用生物信息学软件对Henan-09-03株乙型脑炎病毒(JEV)病毒E蛋白(囊膜蛋白)进行生物信息学分析、预测,为研究JEV的E蛋白基因工程疫苗提供依据。结果表明:E蛋白的分子质量为53 kDa,等电点是7.75,消光系数是66 515,不稳定系数为27.05,疏水平均值为-0.007,无信号肽,有2个跨膜区、27个蛋白修饰位点、5个二硫键、15个蛋白质结合位点,二级结构为α-β混合型、三级结构以同源四聚体形式存在。

关键词: 乙型脑炎病毒, E蛋白, 生物信息学分析

Abstract: Bioinformatics of envelope protein of Japanese encephalitis virus Henan-09-03 strain was analyzed and predicted by information biology software for researching new type genetic engineering vaccine.The results showed that the molecular weight of envelope protein was 53 kDa,isoelectric point was 7.75,extinction coefficient was 66 515,instability index was 27.05,grand average of hydropathicity was-0.007.It had no signal peptide,(two transmembrane domains,twenty-seven protein modification sites,five disulfide bonds,fifteen protein binding sites.Its secondary structure was alpha-beta mixed type,and tertiary structure was homotetramer.

Key words: Japanese encephalitis virus, E protein, Bioinformatics analysis

中图分类号:

Q78
S432

张二芹, 滕蔓, 罗俊, 王瑞宁, 许倩茹, 邓瑞广, 张改平. 乙脑病毒Henan-09-03株E蛋白结构与功能生物信息学分析[J]. 华北农学报, 2015, 30(5): 36-40. doi: 10.7668/hbnxb.2015.05.006.

ZHANG Er-qin, TENG Man, LUO Jun, WANG Rui-ning, XU Qian-ru, DENG Rui-guang, ZHANG Gai-ping. Bioinformatics Analysis of Structure and Function of Envelope Protein of Japanese Encephalitis Virus Henan-09-03 Strain[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2015, 30(5): 36-40. doi: 10.7668/hbnxb.2015.05.006.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2015/V30/I5/36

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