小金海棠金属硫蛋白基因MxMT2克隆与生物信息学分析

doi:10.7668/hbnxb.2010.02.012

华北农学报 ›› 2010, Vol. 25 ›› Issue (2): 60-63. doi: 10.7668/hbnxb.2010.02.012

所属专题： 生物技术；

小金海棠金属硫蛋白基因MxMT2克隆与生物信息学分析

张玉刚¹, 韩振海²

1. 青岛农业大学园林园艺学院, 山东青岛 266109;中国农业大学园艺植物研究所, 北京 100193;
2. 中国农业大学园艺植物研究所, 北京 100193

收稿日期:2010-01-23 出版日期:2010-04-28
通讯作者: 韩振海(1963-),男,陕西人,教授,博士生导师,主要从事果树抗逆生理与分了生物学研究。
作者简介:张玉刚(1973-),男,山东枣庄人,副教授,博士,主要从事园艺植物育种与分子生物学研究.
基金资助:
北京市重点实验室“果树逆境生理与分子生物学实验室”资助项目

Cloning and Bioinformatic Analysis of Metallothionein Gene(MxMT2)in Malus xiaojinensis

ZHANG Yu-gang¹, HAN Zhen-hai²

1. College of Horticulture, Qingdao Agricultural University, Qingdao 266109, China;
2. Institute for Horticultural Plants, China Agricultural University, Beijing 100193, China

Received:2010-01-23 Published:2010-04-28

摘要/Abstract

摘要： 以苹果属植物小金海棠(Malus xiaojinensis Cheng et Jiang)为试材,将差异筛选消减cDNA文库得到的27个金属硫蛋白cDNA片段序列构建成本地数据库,通过电子拼接和RT-PCR相结合的方法,分离到了小金海棠金属硫蛋白基因MxMT2(Genbank登录号为GQ906589),该基因全长610个碱基,开放阅读框(ORF)为240bp,编码80个氨基酸,推测分子量7.74kDa。该基因具有金属硫蛋白基因的典型结构域特征,编码的氨基酸含有14个半胱氨酸Cys,分布在蛋白质的N端和C端,呈Cys-Cys、Cys-X-Cys、Cys-X-X-Cys形式排列。通过系统进化树分析,小金海棠MxMT2与沙梨、杏树、美洲李等植物保持了较近的亲缘关系,与欧洲山毛榉、旱柳、红小豆、鼠尾草等植物亲缘关系较远。

关键词: 苹果属小金海棠, 金属硫蛋白, MxMT2

Abstract: Ametallothione in genewas clonedby RT-PCR andsplicing of 27 cDNA sequences thatwereidentif ied by differentia lscreening of the subtracted cDNA libraryfrom Malusxiao jinensis Chenget Jiang, which was named MxMT2 (AccessionNo.GQ906589).Thefull-lengthcDNAofMxMT2 is610 bp, including the openreading frame (ORF) of 240 bp.It encodes a protein of 80 aminoacids, with amolecularweight of 7.74 kDa.The MxMT2 contained the conserved domains sharedin all known MT, which has 14 Cysresidues(cys)that have conserved sequence position at Nterminal and Cterminal of protein, rankingin the forms of Cys-Cys, Cys-X-Cys and Cys-X-X-Cys.Thephy logenetictree suggested that MxMT2 wascloser to the MTofsandpear, almondandapricot, but fartherwith the MT of europeanbeech, hankow willow and adzuki bean.

Key words: Malus xiaojinensis, Metallothionein, MxMT

中图分类号:

S661.1

张玉刚, 韩振海. 小金海棠金属硫蛋白基因MxMT2克隆与生物信息学分析[J]. 华北农学报, 2010, 25(2): 60-63. doi: 10.7668/hbnxb.2010.02.012.

ZHANG Yu-gang, HAN Zhen-hai. Cloning and Bioinformatic Analysis of Metallothionein Gene(MxMT2)in Malus xiaojinensis[J]. ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA, 2010, 25(2): 60-63. doi: 10.7668/hbnxb.2010.02.012.

http://www.hbnxb.net/CN/Y2010/V25/I2/60

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