牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)是引起黏膜病/牛病毒性腹泻的主要致病原,为单股正链RNA病毒,与猪瘟病毒(CSFV)和绵羊边界病毒(BDV)同属于黄病毒科(Flaviviridae)瘟病毒属(Pestivirus)[1-2]。BVDV主要感染牛,也感染猪、山羊、绵羊和鹿等其他动物[3]。BVDV感染可导致怀孕母牛流产,早期胚胎坏死,胎儿发育迟缓或畸形,腹泻,慢性消耗综合征,致命性的黏膜疾病以及呼吸、免疫、生殖系统的疾病等[4]。此外,怀孕期间的母畜感染BVDV可引起新生动物的持续性感染(Persistently infected,PI),PI动物血清抗体虽呈阴性,但其终身携带病毒,并不断向周围环境排放病毒[5],是BVDV传播的主要来源,因此,对养殖业造成极大危害。
依据BVDV在细胞上是否引起细胞病变,BVDV可分为非细胞病变型(Noncytopathic,NCP)和致细胞病变型(Cytopathic,CP)[6-7]。根据5′-UTR基因序列差异,BVDV可分为2种基因型,即:BVDV-1型和BVDV-2型[8]。其中BVDV-1型目前已鉴定出21个亚型(1a-1u)[9-10],BVDV-2型已鉴定出4个亚型(2a-2d)。此外,欧洲病牛血清中还发现另一种新BVDV基因型,即:HoBi样BVDV-3型,该基因型又可分为Thai源和Brazilian源2种亚型[11]。BVDV分子流行病学表明,我国存在BVDV-1a、BVDV-1b、BVDV-1c、BVDV-1d、BVDV-1m、BVDV-1o、BVDV-1p、BVDV-1q、BVDV-2a和BVDV-2b亚型的流行毒株[12-14],但主要流行BVDV-1b和BVDV-1m亚型。目前,该病在世界范围内广泛流行,给全球畜牧业造成了严重的经济损失[15]。此外,牛血清在细胞培养及生物制品研发过程中广泛应用,如果血清中有NCP型BVDV的感染,将对生物制品行业产生很大的安全隐患。
本研究从甘肃某牛场采集腹泻牛粪便样品,并成功分离到1株BVDV-1a亚型毒株,不仅丰富了我国BVDV的分子流行病学数据,为该地区BVDV的防控提供了一定的参考依据,也为BVDV的致病机制的研究及疫苗研制奠定了坚实基础。
BVDV NADL毒株采购自中国兽医药品监察所;牛肾细胞(MDBK)采购自中国科学院上海细胞库;DH5α感受态购自宝生物工程(大连)有限公司;牛腹泻粪便样品采集自甘肃地区某奶牛养殖场。
MiniBEST Viral RNA/DNA Extraction Kit Ver.5.0、RT-PCR试剂盒、pMD18-T Vector、DNA凝胶回收试剂盒、DL1000 Maker均购自宝生物工程(大连)有限公司;胎牛血清、DMEM培养基购自美国GIBCO公司;FITC标记的BVDV荧光抗体采购自美国VMRD公司。
用于扩增BVDV 5′-UTR与Npro的引物参考张康等[16-17]合成的引物,引物的详细资料见表1。
表1 扩增BVDV 5′-UTR与Npro的引物
Tab.1 Primers for amplifying BVDV 5′-UTR and Npro
引物名称Primer name引物序列(5'-3')Primer sequences片段大小/bpFragment size5'-UTR5'-GCCATGCCCTTAGTAGGACT-3' 2795'-GCCATGTACAGCAGAGAT-3'Npro 5'-CTCTGCTGTACATGGCACAT-3'524 5'-GAGCAGCTGTGACCCATA-3 '
在牛粪便样品中加入适量的PBS缓冲液,充分溶解悬浮后,迅速离心收集上清液。根据病毒RNA提取试剂盒的指示,从上清液中提取RNA,然后进行RT-PCR扩增病毒5′-UTR,扩增产物经1.0 %琼脂糖凝胶电泳检测后送生工生物工程(上海)股份有限公司测序,从而确定BVDV阳性的样品。
在鉴定为BVDV阳性的粪便样品中加入适量的PBS缓冲液,经充分溶解悬浮后,低速离心收集上清液,上清液经0.22 μm滤膜过滤除菌后,接种于已长成单层的MDBK细胞,37 ℃吸附2 h后补加含2%胎牛血清的DMEM维持液于37 ℃、5% CO2条件下培养3 d,每天观察细胞病变情况。同时设立阴性对照组,即不接种粪便样品处理液的MDBK细胞。连续盲传至12代,提取病毒RNA,用RT-PCR技术扩增BVDV 5′-UTR和Npro片段。RT-PCR产物经1.0 %琼脂糖凝胶电泳检测及胶回收后克隆至pMD18-T载体,将鉴定为阳性的重组质粒送至生工生物工程(上海)股份有限公司测序。
将盲传12代的病毒接种于长满单层MDBK细胞的24孔板中,不接种病毒的正常细胞为阴性对照,接种NADL毒株的孔为阳性对照。将24孔板置于37 ℃、5% CO2 培养箱中培养12 h后,弃营养液,PBS洗涤3次后,用4%多聚甲醛固定细胞;PBS洗涤3次后,根据BVDV的FITC法结合荧光抗体染色法,分别对试验组和对照组细胞进行染色;PBS洗涤3次后,用DAPI染色细胞核;PBS洗涤3次后,将24孔板置荧光显微镜下观察细胞染色情况。
将第12代细胞培养物上清用不含血清的DMEM营养液进行10倍系列稀释,在长满单层MDBK细胞的96孔板中,以100 μL/孔接种各稀释度的样品,每个稀释度接种8孔,同时设立未接种BVDV的正常MDBK细胞作为阴性对照,置于37 ℃、5% CO2 条件下培养。12 h后,按照BVDV的FITC结合荧光抗体说明方法对所有MDBK细胞染色,并记录每孔荧光反应结果及其稀释度,根据Karber公式计算分离病毒的TCID50。
用DNAStar软件对第12代BVDV分离株的5′-UTR和Npro核苷酸序列与GenBank中已公布的BVDV各亚型的参考毒株和瘟病毒参考毒株进行比对分析,并在MEGA 7.0软件中采用邻接法绘制系统进化树。
将RT-PCR和序列分析检测为BVDV阳性的粪便样品经处理后在MDBK细胞上连续盲传至12代产生典型的细胞病变(图1),表明分离到的病毒株可能为导致细胞病变的CP型BVDV病毒株。将第12代细胞培养物收集后提取RNA,进行5′-UTR和Npro基因的RT-PCR扩增,扩增产物进行凝胶电泳检测,结果表明,分离培养物与BVDV NADL株均能在279(5′-UTR),524 bp(Npro)处分别出现特异性条带,且与预期大小一致(图2),而阴性对照无任何条带。将扩增片段的测序结果在GenBank上进行Blast比对分析,结果表明,该分离株为 BVDV,将其命名为BVDV-GSLY株。
A.BVDV F12在MDBK细胞上产生细胞病变;B.MDBK健康细胞对照。
A.The cytopathic effect of BVDV F12 on MDBK cells;B.Normal MDBK control.
图1 BVDV感染MDBK细胞产生细胞病变(200×)
Fig.1 The cytopathic effect of BVDV on MDBK cells(200×)
将从病料样品中获得的BVDV-GSLY株和BVDV NADL株病毒液分别接种于MDBK细胞,培养12 h后,利用FITC结合荧光抗体对MDBK细胞进行染色,并置于荧光显微镜下观察。结果显示:未接种BVDV的正常MDBK细胞中没有荧光产生(图3-A),而BVDV NADL株(图3-B)和 BVDV-GSLY株(图3-C)感染的细胞胞浆中均可见特异性绿色荧光,表明该分离物是BVDV。用该方法检测病毒滴度,结果表明,BVDV-GSLY分离株的第12代细胞培养上清中病毒滴度可达107.8 TCID50/0.1 mL。
M.DL1000 Maker;1.BVDV-GSLY株5′-UTR扩增产物;2.NADL株5′-UTR扩增产物;3.阴性对照5′-UTR扩增产物;4.BVDV-GSLY株Npro扩增产物;5.NADL株Npro扩增产物;6.阴性对照Npro扩增产物。
M.DL1000 Maker;1.RT-PCR product of BVDV-GSLY 5′-UTR;2.RT-PCR product of NADL 5′-UTR;3.RT-PCR product of 5′-UTR gene of negative control;4.RT-PCR product of BVDV-GSLY Npro;5.RT-PCR product of NADL Npro;6.RT-PCR product of Npro gene of negative control.
图2 BVDV-GSLY株5′-UTR和Npro RT-PCR扩增结果
Fig.2 RT-PCR amplification of 5′-UTR and Npro of BVDV-GSLY strain
利用DNAStar软件中的MegAlign对BVDV-GSLY株5′-UTR核苷酸序列与GenBank中已公布的BVDV各亚型参考毒株及瘟病毒属的参考毒株进行核苷酸同源性分析,并用MEGA 7.0对BVDV-GSLY株5′-UTR基因序列与参考毒株序列绘制系统发生树。结果表明,BVDV-GSLY株的5′-UTR与HLJ-10(BVDV-2)、Italy-1/10-1(BVDV-3)、X818(BDV)、CSFV-BR-DAR-039/2009(CSFV)5′-UTR核苷酸序列相似性较低,分别为77.9%,74.2%,73.8%,75.0%,与NADL(BVDV-1)的5′-UTR核苷酸序列同源性较高,为95.4%。系统发生树结果也表明,分离株BVDV-GSLY与BVDV-2、BVDV-3、BDV和CSFV均不在同一进化分支上,亲缘关系较远,但与BVDV-1的9株参考毒株的亲缘关系较近,且与BVDV-1亚型的NADL株处于同一进化分支上(图4-A)。因此,BVDV-GSLY株为BVDV-1型。
A.阴性对照;B.NADL株;C.BVDV-GSLY株。
A.Negative control;B.NADL strain;C.BVDV-GSLY strain.
图3 BVDV-GSLY免疫荧光鉴定(200×)
Fig.3 Immunofluorescence of BVDV-GSLY in MDBK cells(200×)
为进一步确定BVDV-GSLY株的亚型,将BVDV-GSLY株的5′-UTR和Npro序列与GenBank 中各型BVDV参考毒株相应序列进行遗传进化分析,结果表明,BVDV-GSLY株5′-UTR与Npro核苷酸序列的遗传进化关系基本相同,BVDV-GSLY株与美国的SD1株位于同一分支,亲缘关系最近(图4-B、C)。5′-UTR和Npro核苷酸序列同源性分析也表明,BVDV-GSLY株与SD1株5′-UTR和Npro核苷酸序列相似性较高(分别为95.5%,91.5%),与其他亚型病毒株的核苷酸序列相似性较低(分别为84.27%~93.0%,73.3%~82.1%),表明BVDV-GSLY株属于BVDV-1a亚型。
牛病毒性腹泻(BVD)是严重危害世界养牛业的重要疾病之一,世界动物卫生组织(OIE)将其列为法定报告的动物疫病,我国也将其列为三类动物疫病[18]。1980年,我国首次分离到该病毒。近年来,流行病学调查表明我国大部分地区都有BVDV感染的报道,且牛、猪、鹿、羚羊等均不同程度的感染BVDV,该病已成为严重影响我国畜牧业健康发展的重要疫病之一[19]。本研究通过对甘肃某牛场中牛粪便样品进行检测,对RT-PCR鉴定为BVDV阳性的样本进行细胞接种、RT-PCR检测和免疫荧光试验,成功分离到1株BVDV(命名为BVDV-GSYL),该毒株在MDBK细胞上连传12代,可产生明显的CPE,证明BVDV-GSYL株为CP型。
A.BVDV 5′-UTR 基因的系统进化树;B.BVDV-1型5′-UTR 基因的系统进化树;C.BVDV-1型Npro基因的系统进化树。
A.The phylogenetic tree based on 5′-UTR of BVDV strains;B.The phylogenetic tree based on 5′-UTR of BVDV-1 strains;C.The phylogenetic tree based on Npro of BVDV-1 strains.
图4 BVDV-GSLY与参考毒株的遗传进化关系
Fig.4 Phylogenetic analysis of BVDV-GSLY and reference strains
由于BVDV 5′ UTR在BVDV基因组中相对保守,因此,常用该基因对BVDV进行分型。此外,在BVDV基因组中,具有较高的保守性的Npro基也可用于基因分型[20]。本研究用BVDV 5′ UTR基因和Npro基因的特异性引物经RT-PCR扩增BVDV-GSYL株的5′ UTR基因和Npro基因,其扩增产物分别为279,(5′-UTR),524 bp(Npro),与预期大小一致。分别将BVDV-GSYL株的5′ UTR基因序列和Npro基因序列与GenBank中已公布的参考毒株的对应序列进行比较,绘制系统进化树,分析表明,BVDV-GSYL株与美国的SD1株同源关系最近(5′-UTR和Npro核苷酸序列同源性分别为95.5%,91.5%),系统进化树也显示分离毒株BVDV-GSYL与SD1株位于同一分支,均属于BVDV-1a亚型。
根据以往报道,在甘肃地区肉牛中曾检测到BVDV-1u毒株,而本次研究为首次从该地区奶牛中分离得到BVDV-1a亚型毒株,且该毒株与先前研究的BVDV病毒株之间存在显著差异。随着甘肃地区荷斯坦奶牛地不断引进,与SD1株具有较高同源性的BVDV-GSLY 株可能已成为甘肃地区奶牛源致病型BVDV的主要流行株。
本研究从牛粪便样本中分离鉴定了1株BVDV-1a 型病毒,为我国甘肃地区BVDV病毒株的流行情况提供了可靠依据,对牛病毒性腹泻病的预防和诊治以及BVDV的致病机制的研究等方面奠定了参考基础。
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