大豆异黄酮相关基因GmUGT73克隆及功能初步鉴定

王 俊,董海冉,常 宏,王 伟,包冬芳,赵孝岳,赵 雪,韩英鹏

(东北农业大学,黑龙江 哈尔滨 150030)

摘要:UGT是一类糖基转移酶,它对黄酮类化合物进行糖基化修饰,合成异黄酮糖苷,在异黄酮的合成、转运、存储等方面发挥了重要的作用。为了探索UGT功能,通过RT-PCR方法从中豆27中克隆获得GmUGT73基因的CDS全长序列。利用ProtParam tool等在线软件对GmUGT73蛋白序列及理化性质进行分析,预测结果表明,GmUGT73基因的编码区编码464个氨基酸,分子质量为51.186 5 ku,理论等电点(pI)为6.27,总原子数为7 176,分子式为C2281H3580N608O685S22。GmUGT73蛋白总正电和负电残基数分别为37和41,蛋白的不稳定系数为36.93,表明该蛋白较稳定,蛋白的脂溶指数为86.19,GRAVY值为-0.111,说明该蛋白为亲水性蛋白。将线性植物表达载体与目的片段进行连接,成功构建pCambia3300-GmUGT73植物表达载体,通过发根农杆菌介导法转化大豆毛状根并获得转基因阳性根系,利用高效液相色谱(HPLC)对根系进行异黄酮含量测定,结果表明,转基因阳性根中异黄酮含量与对照相比极显著提高(P<0.01),说明该基因可能具有促进合成大豆异黄酮的功能。

关键词:大豆;异黄酮类;糖基转移酶;候选基因;农杆菌转化;克隆;基因功能鉴定

大豆是我国重要的粮食作物和油料作物,也是我国人民植食性蛋白的主要来源[1]。异黄酮是一种黄酮类化合物,又称植物雌激素[2],包括游离型的大豆黄素、染料木素和黄豆黄素3种[3],主要存在于大豆、菜豆、苜蓿等豆科植物中,其中以大豆的含量最高[4]。大豆异黄酮是大豆重要的次生代谢产物之一。它不仅参与调节植物的生长活动,还对人体健康具有重要作用。为了满足市场对大豆异黄酮的需求,高异黄酮含量的大豆品种选育成为育种人员的重要目标之一。

异黄酮主要通过苯丙氨酸代谢途径进行生物合成,这一途径是从莽草酸途径衍生的植物特有的次生代谢途径,也是植物三大次生代谢途径之一[5]。在自然状态中,异黄酮以3种母核的形式存在,它们通过β-糖苷键和葡萄糖结合,形成异黄酮葡萄糖苷,在大豆中存在[6]。黄酮类色素等次生代谢产物的糖苷主要经过糖基化修饰,存在于植物天然次生代谢产物合成的最后一步[7]。UGT是存在于自然界中的一种重要修饰分子,UDP(尿嘧啶二磷酸腺苷)所活化的糖分子也能被UGT转移到生物大分子上。UGT可修饰大豆中的黄酮类化合物,形成异黄酮糖苷,也是异黄酮的合成过程中的一类重要次生代谢产物[8]。目前,UGT基因已在多种植物(如水稻[9]、玉米[10]、荞麦[11]、三花龙胆[12])中被研究,付晓雯 [8]从葛根中成功克隆出具有糖基转移酶活性的GT4基因,并验证该基因可以影响大豆苷元、染料木素、黄豆黄素等物质的合成。李红艳等[13]在丹参中成功克隆糖基转移酶基因SmUF3GT,发现其可以将不稳定的类黄酮色素转化为稳定类黄酮苷元。尤章 [14]发现紫花苜蓿中MsUGT73B2基因影响黄酮物质的合成。Achnine等[15]发现蒺藜苜蓿GT99D基因参与合成黄酮类物质。而大豆糖基转移酶基因功能尚鲜见报道。

本研究以高异黄酮品种中豆27为试验材料,克隆GmUGT73全长序列并构建植物表达载体pCambia3300-GmUGT73,利用发根农杆菌介导大豆快速转化技术来验证GmUGT73基因与异黄酮含量的关系,进而为分子标记辅助育种提供基因资源。

1 材料和方法

1.1 试验材料

大豆品种:中豆27由中国农业科学院作物所培育;东农50由东北农业大学大豆研究所提供。

菌种和载体:K599发根农杆菌、pCambia3300载体、大肠杆菌DH5α感受态。

1.2 试验方法

1.2.1 大豆总RNA提取及反转录 将大豆材料中豆27的种子种在12 cm×12 cm的小方钵中,钵中装灭菌蛭石。将材料放置于16 h光和8 h暗,温度(23±2)℃,湿度60%的光照培养箱内。待大豆幼苗第一轮三出复叶完全展开时,取叶片组织15~30 mg,置于液氮中,依照TRIzol的方法提取高异黄酮品种中豆27叶片的总RNA。采用东洋坊反转录试剂盒说明书进行操作,将RNA反转录成cDNA。

1.2.2 GmUGT73的生物信息学分析 通过测序获得了DNA序列,并且利用DNAMAN软件将其翻译氨基酸序列。利用ProtParam、ProtCcale、TMpred和MEMSAT-SVM在线软件,可以对氨基酸的理化性质、亲水性、疏水性、跨膜结构等指标进行初步分析,进而初步预测基因的功能。

1.2.3 RT-PCR法克隆GmUGT73全长基因 在Phytozomev 11.0数据库查找GmUGT73基因的全长序列,GmUGT73 CDS区域全长1 395 bp,根据GmUGT73 基因的CDS序列设计引物(表1),将cDNA作为模板DNA进行PCR扩增,反应体系和反应程序根据高保真DNA聚合酶(Phanta Super-Fidelity DNA Polymerase)说明书进行操作。用琼脂糖凝胶电泳检测的方法对目的基因片段进行电泳检测。

表1 PCR引物
Tab.1 Primers for PCR

引物名称 Primer name引物序列 (5′-3′) Primer sequenceGmUGT73-FAGAACACGGGGGACTATGGAGCAACCAACTAGTGTGGmUGT73-RATCCTCTGTTTCTAGTCATAAGGATTCAAGTCCTTG

1.2.4 目的片段回收 获得的PCR产物经琼脂糖凝胶电泳,紫外灯照射下,用解剖刀迅速切下含目的片段的琼脂糖凝胶(质量一般小于0.3 g),放入干净的1.5 mL离心管中,利用胶回收试剂盒将目的片段进行回收,放入-20 ℃冰箱中保存。

1.2.5 表达载体构建与目的基因片段连接 在pCambia3300表达载体上找到单酶切位点,采用XbaⅠ酶,在37 ℃水浴锅中5 h将其载体线性化,采用电泳的方法检验酶切结果。采用电击法将目的片段与植物表达载体相连接,采用的大肠杆菌感受态DH5α是博迈德生物技术公司生产的。

1.2.6 菌液验证及测序 利用PCR鉴定阳性克隆的方法,对菌液进行PCR检测(Easy-Taq为PCR扩增酶)。将鉴定为阳性克隆的菌液送到测序公司测序。利用OMEGA公司生产的提质粒盒子(Plasmid Mini Kit(D6942-02*))对测序合格的样品提取质粒。

1.2.7 大豆根部转化与异黄酮含量测定 根据陈安乐[16]大豆发根转化方法对GmUGT73基因以东农50为材料进行K599发根农杆菌转化与侵染,对根部进行DNA提取,采用PCR鉴定的方法,并根据朱莹等[17]液相色谱法(HPLC)测定异黄酮含量的方法,对大豆根部异黄酮进行测定。

2 结果与分析

2.1 GmUGT73基因的克隆与转化

选取中豆27的第一轮完全展开的三出复叶提取总RNA,通过琼脂糖电泳检测,其中18S和28S条带清晰可见(图1)。通过Nanovue仪器对提取的总RNA进行浓度检测,结果表明,RNA纯度较高,完整性好,适合反转录成cDNA,进行基因克隆。

图1 RNA电泳图
Fig.1 Agarosegel electrophoriesis of RNA

将中豆27的第一轮三出复叶总RNA逆转录成cDNA,并以其为模板、GmUGT73-R和GmUGT73-F为引物,经PCR反应后获得目的片段,其长度为1 000~2 000 bp,与目的基因片段长度一致(图2),然后通过In-Fusion连接的方法将目的基因连接到植物过表达载体上。

对转化大肠杆菌的菌液进行PCR阳性检测(图2),将阳性克隆的菌液送至测序公司进行测序,下载全基因组基因序列与测序结果比对,将完全匹配的序列作为最终序列。

图2 目的基因电泳图
Fig.2 Electrophoresis result of gene amplification

2.2 生物信息学分析

利用在线软件对GmUGT73蛋白序列的一级结构进行分析,结果表明,GmUGT73基因的编码区编码464个氨基酸,分子质量为51.186 5 ku,理论等电点(pI)为6.27,其原子总数为7 176,其分子式是C2281H3580N608O685S22。在GmUGT73蛋白的氨基酸序列中,含量最多的是Leu,占总数的11.6%;不存在Pyl和Sec 2种氨基酸。GmUGT73蛋白质总正电和负电残基数分别为37和41,蛋白不稳定系数为36.93,表明该蛋白相对比较稳定。GmUGT73蛋白GRAVY值为-0.111,脂溶指数为86.19,属于亲水性蛋白。蛋白质二级结构预测得到GmUGT73蛋白质中含有33.19% α-螺旋、41.59%片层结构、4.74% β-转角、20.47%无规则卷曲。用在线软件SWISS-MODEL预测中豆27中GmUGT73蛋白的三级结构(图3)。

图3 GmUGT73蛋白三级结构的预测
Fig.3 Predict of 3-D structure of GmUGT73 protein

2.3 PCR鉴定发根农杆菌阳性克隆

用基因克隆引物对含有目的基因的发根农杆菌采取PCR阳性鉴定,结果显示,菌液均为阳性克隆,代表目标转化成功(图4)。

2.4 转基因阳性根鉴定

对接种20 d后的发根植株,随机选取10株,提取根部中的DNA,采用PCR检测的方法对其进行阳性鉴定,结果显示其中9株为阳性(图5)。

1.DL2000 Marker;2-6.5个不同单克隆菌液;7.水阴性对照; 8.大肠重组质粒pCambia3300-GmUGT73阳性对照。 1.DL2000 Marker;2-6.Five different monoclonal solutions; 7.Water negative control;8.E.coli plasmids pCambia3300-GmUGT73.

图4 pCambia3300-GmUGT73转大肠杆菌PCR初步鉴定
Fig.4 PCR results of Escherichia coli containing the recombinant plasmid pCambia3300-GmUGT73

1-10.选取的10株发根植株;水.阴性对照;M.DL2000 Marker。 1-10.Chosen ten root plants;Water.Negative control;M.DL2000 Marker.

图5 PCR鉴定阳性根结果
Fig.5 Positive root PCR results

2.5 转基因阳性根异黄酮含量测定

随机选取5株转基因阳性根,并将其与对照处理同等条件下采用高效液相色谱(HPLC)进行异黄酮相关含量的测量,结果显示,转基因阳性根中大豆苷元和大豆苷含量极显著高于对照材料,其他组分无显著变化,对2组数据进行差异性分析,差异达极显著水平(P<0.01),所以初步认定GmUGT73基因具有促进异黄酮合成的作用(图6)。

1.对照大豆根系;2-6.转基因阳性发根根系。不同大写字母代表对照与转基因根系之间异黄酮含量的差异极显著(P<0.01)。 1.Control roots;2-6. Transgenic positive roots.Different capital letters represent extremely significant differences in isoflavone content between control and transgenic roots(P<0.01).

图6 转基因阳性根异黄酮含量
Fig.6 Isoflavone content of transgenic positive roots

3 讨论与结论

转基因技术和基因编辑技术不断提高,伴随产生了更多的遗传转化方法和技术,给分子育种和定向改良作物性状提供新思路。至今在植物中使用较多的方法有农杆菌介导法、基因枪法、花粉管通道法等,其中科研人员最为热衷的是农杆菌介导法,主要是其价格成本低、耗时短[18]。采取发根农杆菌转化的方法,可以影响次生代谢产物的合成[19]。证明发根农杆菌转化在筛选异黄酮合成基因方面具有可行性。付晓雯 [8]研究发现,葛根中异黄酮含量受到糖基转移酶相关基因的影响。Baek等[20]研究发现,朝鲜黑莓中糖基转移酶基因在类黄酮合成过程中发挥重要作用。本研究通过发根农杆菌介导法将GmUGT73基因转入东农50品种中,获得15个转基因阳性根,用高效液相色谱法测定转基因阳性根组织的异黄酮含量,验证GmUGT73基因是否参与大豆异黄酮的合成过程。结果证明GmUGT73基因可能参与大豆异黄酮的积累过程。

大豆异黄酮多以苷元形式发挥生物功能,糖基化后其生理作用发生改变[21-23]。因此,糖基化对异黄酮组分的生物功能具有重要的作用。最早发现的大豆异黄酮特异UGT基因是GmIF7GT,它是在大豆幼苗中提取出来的[24],它对异黄酮合成具有促进作用。后来Dhaubhadel等[25]发现UGT73F2糖基转移酶基因可以促进染料木素和黄酮黄豆黄素合成,从而使黄豆黄苷和染料木苷的含量增多。本研究以中豆27为试验材料,克隆出糖基转移酶基因GmUGT73,连接pCambia3300过表达载体,通过K599转化发根农杆菌,结果表明,发根中的大豆苷元(Daidzein)和大豆苷(Daidzin)含量增加,异黄酮含量显著提高,这表明GmUGT73参与大豆异黄酮代谢过程。

通过RT-PCR方法从大豆中豆27中克隆获得GmUGT73基因的CDS全长序列;GmUGT73基因编码区编码464个氨基酸,分子质量为51.186 5 ku,该基因编码的蛋白比较稳定,亲水性较强;成功构建pCambia3300-GmUGT73植物表达载体,发根农杆菌介导法转化大豆东农50,获得的转基因阳性根中异黄酮含量和对照处理相比极显著提高(P<0.01),说明该基因可能具有合成大豆异黄酮的功能。

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Cloning and Preliminary Analysis on the Function of GmUGT73 Related with Soybean Isoflavone

WANG Jun,DONG Hairan,CHANG Hong,WANG Wei,BAO Dongfang, ZHAO Xiaoyue,ZHAO Xue,HAN Yingpeng

(Northeast Agricultural University,Harbin 150030,China)

Abstract UGT is a kind of glycosyltransferase,which performs glycosylation modification on flavonoids,synthesizes isoflavone glycosides,and plays an important role in the synthesis,transport and storage of isoflavones. In order to explore the function of related genes,the full-length CDS sequence of GmUGT73 gene was cloned from Zhongdou 27 by RT-PCR. The GmUGT73 protein sequence and physicochemical properties were analyzed by online software such as ProtParam tool. The results indicated that the coding region of GmUGT73 gene encoded 464 amino acids with a molecular mass of 51.186 5 ku,a theoretical isoelectric point(pI)of 6.27 and a total atomic number of 7 176. The molecular formula was C2281H3580N608O685S22. The total positive electroreactive residue of GmUGT7 protein was 37,the total number of negatively charged residues was 41,and the instability coefficient of protein was 36.93,indicating that the protein was stable. The protein had a fat solubility index of 86.19 and a GRAVY value of -0.111,indicating that the protein should be a hydrophilic protein. The linear plant expression vector was ligated to the target fragment,and the pCambia3300-GmUGT73 plant expression vector was successfully constructed. Transformation of soybean hairy roots by Agrobacterium rhizogenes-mediated transformation and obtained transgenic positive roots.The isoflavone content of roots were determined by high performance liquid chromatography. The results showed that the content of isoflavones in the positive roots of transgenic plants was extremely significantly higher than that of the control(P<0.01),indicating that the gene may have the function of promoting the synthesis of soy isoflavones.

Key words: Soybean;Isoflavone;Glycosyltransferase;Candidate gene;Agroinfiltration;Cloning;Functional identification of gene

收稿日期:2019-11-05

基金项目:国家科技重大专项和重点研发项目(课题)省级资助项目(GX17B002);黑龙江省杰出青年基金项目(JC2018007);黑龙江省博士后项目(LBH-Q17015);国家重点研发计划项目(2016YFD0100304);国家自然基金面上项目(31671717)

作者简介:王 俊(1993-),男,黑龙江牡丹江人,在读硕士,主要从事大豆遗传育种研究。

通讯作者:韩英鹏(1978-),男,黑龙江哈尔滨人,教授,博士,主要从事大豆遗传育种及生物技术研究。

中图分类号:Q78;S565.03

文献标识码:A

文章编号:1000-7091(2020)02-0043-05

doi:10.7668/hbnxb.20190325