烟草NtCIPK家族基因表达与其含钾量之间的关系分析

杨尚谕1,卓 维1,陈 倩1,蒋 垚1,童 铸1,李立芹1,任学良2,鲁黎明1

(1.四川农业大学 农学院,四川 成都 611130;2.贵州省烟草科学研究院,贵州 贵阳 550003)

摘要为探讨烟草NtCIPK家族基因的表达与烟草含钾量之间的关系,为烟草钾吸收的分子机制研究提供借鉴,对普通烟草品种K326、贵烟5号和云87进行3个不同钾浓度(6.0,1.0,0.2 mmol/L)的溶液培养,并测定其干质量和钾含量;同时,运用qRT-PCR的方法,分析了NtCIPK家族11个基因对不同钾浓度处理的诱导表达模式。结果表明,随着培养液钾浓度的提高,各参试品种的单株干质量和钾含量都呈升高趋势,且处理间有显著差异,其中,云87 在不同钾浓度(1.0,0.2 mmol/L)处理下,其单株干质量和钾含量均最高。NtCIPK家族11个基因的表达均受钾浓度变化的诱导,表现为随着K+浓度的下降而上调表达;只有K326的NtCIPK9和贵烟5号的NtCIPK24的表达呈现下调趋势。通径分析结果表明,在0.2 mmol/L K+浓度处理下,NtCIPK3和NtCIPK5的表达分别与K326和贵烟5号的单株含钾量呈现显著正相关关系;而在6.0 mmol/L K+浓度处理下,NtCIPK23的表达与云87的单株含钾量呈现显著负相关关系。烟草钾含量与其NtCIPK基因的表达密切相关,而NtCIPK基因的增强表达有助于烟草对钾的吸收和积累。

关键词烟草;钾含量;NtCIPK;基因表达

钾在植物中含量很高,是植物必需的大量元素之一,在植物的光合作用、气孔运动、蛋白合成和氧化代谢等生命活动中起重要作用[1-3]。缺钾时,会导致植物生长受限和代谢紊乱,严重缺钾时,植物甚至无法正常生长[4]

研究表明,不同植物的钾含量不同。胡笃敬等[5]研究了30种植物的含钾量,包括水生植物、陆生野生植物、绿肥植物、早稻和晚稻等,结果发现,不同植物间的钾含量差别很大。此外,同一植物的不同品种钾含量也不同,如大豆[6]、燕麦[7]、小麦[8]、香蕉[9]、甘薯[10]、甘蔗[11]、玉米[12]、西瓜[13]、油菜[14]等。烟草品种间的烟叶含钾量,也存在明显差异[15-17]。杨欢等[18]研究了93份烟草种质资源材料的烟叶钾含量,并根据钾含量的高低,将这些种质材料分为高钾基因型、普通型与低钾型。

在分子层面,植物对外界钾的吸收,主要通过高亲和与低亲和2类吸收机制进行[3]。其中,低亲和机制主要是由位于细胞质膜上的钾离子通道承担,是植物吸收钾离子的重要途径之一[19-20]。例如,拟南芥钾离子通道的AKT1,是拟南芥根从外界获取K+的主要组分之一[21]。CIPK是一类植物特有的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶[22],CBL-CIPK信号系统广泛参与了植物钾吸收调节过程[23]。研究表明,在AtCBL1/9的介导下,AtCIPK23通过磷酸化AKT1,激活该离子通道,从而增强了拟南芥在低K+条件下对K+的吸收[24]。在水稻中,OsCBL1-OsCIPK23同样通过调控OsAKT1,参与了水稻的K+吸收[25]。在胡杨中,PeCBL1-PeCIPK23通过磷酸化钾离子通道PeKC1、PeKC2,从而实现其对低钾胁迫的响应[26]。还有研究表明,AtCIPK23在烟草中的过表达导致了转基因烟草低K+耐受性的增加[27]。此外,甘蔗CIPK23[28]、水稻CIPK10[22]、林烟草CIPK3[29]、普通烟草CIPK2等[30]均可能参与了植物对K+的吸收调节过程。

烟草是我国重要的经济作物,烟叶含钾量高低,是衡量烟叶品质的重要指标之一[31]。然而,目前对于烟草钾吸收的分子机制研究尚不够深入,尤其是NtCIPK基因参与钾吸收调控的研究还较少,其调控机制尚不清楚。因此,本研究对3个烤烟品种进行了不同K+浓度的处理,研究了其干质量、钾含量及NtCIPK家族11个基因的表达模式,并分析了这3个品种钾含量和其NtCIPK基因表达之间的关系,旨在为烟草钾吸收调控的分子机制研究提供一定的参考。

1 材料和方法

1.1 材料及试剂

参试烤烟品种为K326、贵烟5号、云87。

试验所需的TRIzol试剂、cDNA合成试剂盒、SYBR Green Master mix等试剂购自宝生物工程(大连)有限公司。

1.2 试验方法

1.2.1 不同钾浓度培养溶液的配制 不同钾浓度的培养液,在霍格兰溶液配方基础上进行适当调整配制而成(表1)。用氯化钾调整培养溶液的钾浓度分别为6.0,1.0,0.2 mmol/L,其他不变。

表1 霍格兰溶液配方
Tab.1 Hoagland solution formulation

1.2.2 烟草幼苗的培养与处理 挑选大小一致且饱满的烟草种子,表面消毒后,分别播种在白色泡沫漂浮育苗盘(长65.5 cm、宽33.5 cm、高4.5 cm、162穴)中,然后,将育苗盘放置在育苗池中进行育苗。育苗池中加注K+浓度为6 mmol/L的霍格兰溶液。60 d后,每品种挑选长势一致的幼苗各90株,分为3组,分别放入K+浓度为6.0,1.0,0.2 mmol/L的霍格兰溶液中,进行处理。每个处理包括30株烟苗,10株烟苗为一个重复,共重复3次。

处理48 h后,对每个浓度每个品种的烟苗进行随机取样。取样时,取每个重复烟苗叶片混合样,在液氮中速冻后,置于-80 ℃冰箱中保存,用于RNA的提取。

处理28 d后,将参试的全部烟株取出,并将根部冲洗干净,用吸水纸吸干水分后,在烘箱中105 ℃杀青30 min,80 ℃下烘干至恒质量待用。

1.2.3 烟株干质量及钾含量的测定 用电子天平称取烟株的干质量。植株钾含量的测定采用火焰光度计法[32]进行。

1.2.4 NtCIPK基因的表达模式分析 RNA的提取:采用TRIzol法进行,cDNA的合成参照试剂盒说明,具体参照卓维等[30]的方法进行。

表2 引物序列
Tab.2 Primer sequences

引物设计:根据四川农业大学农学院的分子生物技术验室前期所克隆到的11个NtCIPK基因的cDNA序列,采用Primer Premier 5.0设计qPCR引物(表2)。

qPCR扩增:以反转录后的cDNA为模板,以烟草18S rRNA为内参进行qPCR扩增。qRT-PCR扩增体系为:2×Prime STAR Max 5.0 μL,上游引物 0.5 μL,下游引物 0.5 μL,cDNA 1 μL,ddH2O 3 μL。qRT-PCR扩增程序为:50 ℃反应2 min,95 ℃预变性3 min;然后,95 ℃变性10 s,65 ℃延伸45 s,进行39个循环。基因相对表达水平用2-ΔΔCt方法进行计算。

2 结果与分析

2.1 各处理烟草植株生物量比较

在不同K+浓度处理下,各品种生物量的测定结果如图1所示。随着培养液K+浓度的降低,各品种的植株干质量均呈下降趋势。在1.0,0.2 mmol/L K+浓度处理下,云87与贵烟5号的干质量差异不显著,但在0.2 mmol/L K+浓度处理下云87与贵烟5号的干质量均显著高于K326;在6.0 mmol/L K+浓度处理下,贵烟5号的植株干质量显著低于K326和云87,后二者之间的差异则不显著。烟草植株生物量的测定结果表明,外界供K+量的高低,显著影响到烟草植株的生长与干物质的积累。

图中每个浓度不同品种的不同小写
字母表示在P<0.05水平上差异显著。图2-3同。
Different lowercase letters in each concentration of the figure
indicate significant difference atP<0.05.The same as Fig.2-3.

图1 各品种烤烟不同K+浓度处理的干质量
Fig.1 Dry weight of different varieties of flue-cured tobacco treated with different K+ concentrations

2.2 不同处理烟草植株钾积累量比较

图2为不同K+浓度处理下,各处理烟草植株钾积累量(株/g)测定结果。随培养液中K+浓度的降低,各参试材料植株的钾积累量都呈下降趋势。在6.0,1.0 mmol/L K+浓度处理下,云87的钾积累量显著高于K326及贵烟5号;而在0.2 mmol/L K+浓度处理下,云87与贵烟5号和K326的钾积累量差异显著。钾积累量的测定结果表明,不同烟草品种在不同的外界K+浓度环境中,其植株的K+积累特性明显不同。

图2 各品种烤烟不同K+浓度处理的K+积累量
Fig.2 K+ accumulation of different K+ concentrations of flue-cured tobacco of different varieties

2.3 不同供钾浓度下NtCIPK基因的表达模式分析

对在不同K+浓度处理下,11个NtCIPK基因在各烟草品种中的表达进行了测定,结果如图3所示。

从图3可以看出,NtCIPK基因的表达均随着外界钾浓度的变化而改变。在低钾条件下(0.2 mmol/L),其表达量基本是上调的,其中,云87的11个NtCIPK基因表达量均高于对照K326,且存在显著性差异,显示这些基因的表达受低钾胁迫的诱导。但NtCIPK9和NtCIPK24分别在K326及贵烟5号中的表达,随着外界钾浓度的降低,却呈下调趋势,即随着K+浓度的降低而下调,都分别显著低于云87的表达量。在所检测的11个NtCIPK基因中,NtCIPK2、NtCIPK5、NtCIPK6、NtCIPK9、NtCIPK12、NtCIPK14、NtCIPK23和NtCIPK24随着K+浓度的降低,表达量变化较大。可以推测,这8个NtCIPK基因可能以某种直接或间接的方式参与了烟草钾吸收的调控。

图3 不同烤烟品种在不同K+浓度处理后的NtCIPK基因的相对表达量
Fig.3 Relative expression of NtCIPK gene after treatment with different K+ concentrations in different flue-cured tobacco varieties

2.4 烟草钾含量与其CIPK基因表达量之间的关系分析

2.4.1 逐步回归分析 将各处理烟草植株的K+积累量(Y)与11个NtCIPK基因的表达量进行逐步回归分析,得出了3个烟草品种在3个钾浓度处理下的逐步回归方程(表3)。

对K326来说,NtCIPK12(X7)、NtCIPK18(X9)和NtCIPK3(X2)的表达,分别在6.0,1.0,0.2 mmol/L条件下,对其K+积累量影响显著。贵烟5号的情况有所不同,其K+积累量在6.0,1.0 mmol/L条件下与NtCIPK5(X3)的表达密切相关;而在0.2 mmol/L条件下,则受NtCIPK3(X2)表达的显著影响。NtCIPK23(X10)的表达,在外界高K+浓度(6.0 mmol/L)下,与云87植株的K+积累量相关性显著;而在中(1.0 mmol/L)、低钾浓度(0.2 mmol/L)下,云87植株的K+积累量则与NtCIPK9(X5)的表达相关性显著。

2.4.2 通径分析 在回归分析的基础上,对NtCIPK3(X2)、NtCIPK5(X3)、NtCIPK9(X5)、NtCIPK12(X7)、NtCIPK18(X9)及NtCIPK23(X10)做了进一步的通径分析(表4)。

从逐步回归方程和通径分析结果来看,在外界0.2 mmol/L K+浓度下,NtCIPK3(X2)的表达与K326和贵烟5号的植株钾积累量分别呈显著正相关和显著负相关。同时,NtCIPK5(X3)在6.0 mmol/L浓度下的表达,与贵烟5号的植株钾积累量呈显著正相关。此外,在6.0 mmol/L K+浓度处理下,云87的植株钾积累量与NtCIPK23(X10)的表达显著负相关。

表3 各烤烟品种的K+含量和NtCIPK基因表达模式的逐步回归方程
Tab.3 Stepwise regression equations of K+ content and NtCIPK gene expression pattern of various flue-cured tobacco varieties

品种Variety处理/(mmol/L)Treatment逐步回归方程Stepwise regression equationK3266.0 Y=0.089 5-0.009 7X71.0Y=0.042 9-0.019 2X90.2Y=-0.039 2+0.107 9X2贵烟5号6.0 Y=-0.001 8+0.013 6X3Guiyan 51.0 Y=0.017 2+0.000 9X30.2Y=0.072 4-0.064 2X2云876.0 Y=0.119 4-0.011 3X10Yun 871.0 Y=0.139 7-0.012 8X50.2Y=0.066 8-0.005 9X5

注: Y.对应各浓度烤烟品种的K+含量;X1、X2、X3、X4、X5、X6、X7、X8、X9、X10、X11分别代表NtCIPK2、NtCIPK3、NtCIPK5、NtCIPK6、NtCIPK9、NtCIPK11、NtCIPK12、NtCIPK14、NtCIPK18、NtCIPK23、NtCIPK24基因的相对表达量。表4同。

Note: Y. The K+ content of the corresponding flue-cured tobacco varieties;X1, X2, X3, X4, X5, X6, X7, X8, X9, X10, and X11 represent relative expression levels ofNtCIPK2,NtCIPK3,NtCIPK5,NtCIPK6,NtCIPK9,NtCIPK11,NtCIPK12,NtCIPK14,NtCIPK18,NtCIPK23, andNtCIPK24 genes, respectively. The same as Tab.4.

表4 各烤烟品种的K+含量和NtCIPK基因表达模式的通径分析
Tab.4 Path analysis of K+ content and NtCIPK gene expression patterns of flue-cured tobacco varieties

品种Variety处理/(mmol/L)Treatment因变量Dependent variable自变量Independent variable相关系数Correlation coefficient通径系数Path coefficientt检验值t test value显著性检验值SigK3266.0YX7-0.009 7-0.879 8-1.851 30.315 31.0YX9-0.019 2-0.972 8-4.202 50.148 70.2YX20.107 90.999 845.929 40.013 9贵烟5号6.0YX30.013 60.998 820.217 70.031 5Guiyan 51.0YX30.000 90.996 311.546 30.055 00.2YX2-0.064 2-0.999 9-67.456 70.009 4云876.0YX10-0.011 3-0.998 7-19.767 40.032 2Yun 871.0YX5-0.012 8-0.971 7-4.116 30.151 70.2YX5-0.005 9-0.994 7-9.709 90.065 3

3 讨论

本研究通过对3个烟草品种进行不同K+浓度处理,测定了其干质量、钾积累量,并分析了11个NtCIPK基因在各个处理下的表达量,结果表明,NtCIPK基因的表达量与烟草的钾积累量密切相关。

前人研究结果表明,植物的CIPK基因在植物对K+的吸收调控过程中起着重要的作用[23-26]。在本研究中,烟草11个NtCIPK基因在不同品种中的表达量并不相同,并且均能够响应外界钾浓度的变化,这与前人的研究结果相一致[25,28-30]。此结果暗示,烟草的NtCIPK基因广泛参与了烟草对钾的吸收调控过程。

植物的CIPK基因参与钾吸收调控的机制较为复杂。一般情况下,其过表达能够增强植物对钾的吸收[24-27,33 ]。然而,拟南芥AtCIPK9[34]的过表达则导致对低K+敏感;玉米ZmCIPK9[33]的过量表达却提高了钾的吸收能力。由此说明,不同的NtCIPK基因在植物钾吸收过程中的调控机制不尽相同。本研究也发现,从NtCIPK基因的表达模式来看,随着外界钾浓度的降低,其表达可以分为上调及下调2种情况。有9个NtCIPK基因是上调表达,只有K326的NtCIPK9与贵烟5号的NtCIPK24的表达为下调。其中,上调表达的基因,就包括了与前人的研究结果相一致[29-30, 35]CIPK2、CIPK3、CIPK23基因。烟草NtCIPK基因的这种不同表达模式,在一定程度上说明了其参与烟草钾吸收调控时,存在正调控、负调控或者其他的复杂方式。

逐步回归和通径分析的结果同样说明,在11个NtCIPK基因中,其表达量与烟草钾积累量的相关性存在显著与不显著之别;即使对同一个基因来说,其在不同品种中的作用也不尽相同。例如,同样在0.2 mmol/L K+浓度处理下,NtCIPK3(X2)与K326的K+含量呈显著正相关;然而,与贵烟5号的K+含量则呈显著负相关。该结果同样说明了烟草NtCIPK基因行使钾吸收调控功能的复杂性。

虽然烟草NtCIPK基因广泛参与了烟草对钾的吸收与调控,然而,其参与的方式、调控的模式与功能行使的途径却十分复杂。而每一个NtCIPK基因在其中发挥作用的详细机制,则需更进一步地深入研究。

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Analysis of the Relationship Between NtCIPK Family Gene Expression and Potassium Content in Tobacco

YANG Shangyu1, ZHUO Wei1, CHEN Qian1, JIANG Yao1, TONG Zhu1, LI Liqin1, REN Xueliang2, LU Liming1

(1.College of Agronomy, Sichuan Agricultural University, Chengdu 611130, China; 2.Guizhou Provincial Tobacco Research Institute, Guiyang 550003, China)

Abstract To explore the relationship between tobacco NtCIPK family gene expression and the potassium content of tobacco, and to provide reference for the molecular mechanism of potassium absorption in tobacco. For common tobacco varieties K326, Guiyan 5 and Yun 87 three different potassium concentrations (6.0, 1.0,0.2 mmol/L) were cultured in solution and their dry weight and potassium content were measured. At the same time, 11 genes of the NtCIPK family were analyzed for different potassium concentrations using qRT-PCR. Induced expression pattern. With the increased of potassium concentration in the culture medium, the dry weight and potassium content of the tested plants showed an increasing trend, and there were significant differences between treatments. Among them, Yun 87 is treated with different potassium concentrations (1.0, 0.2 mmol/L). Dry weight and potassium content were the highest. The expression of 11 genes in the NtCIPK family was induced by the change of potassium concentration, and showed up-regulated expression with the decreased of K+ concentration; only the expression ofNtCIPK9 in K326 andNtCIPK24 in Guiyan 5 showed a downward trend. The results of path analysis showed that the expression ofNtCIPK3 andNtCIPK5 was significantly positively correlated with the potassium content of K326 and Guiyan 5, respectively, at the concentration of 0.2 mmol/L K+, whileNtCIPK23 was treated at the concentration of 6.0 mmol/L K+. The expression had a significant negative correlation with the potassium content per plant of Yun 87. The potassium content of tobacco was closely related to the expression of NtCIPK gene, and the enhanced expression of NtCIPK gene contributes to the absorption and accumulation of potassium by tobacco.

Key words: Tobacco; Potassium content; NtCIPK; Gene expression

中图分类号Q78;S572.03

文献标识码:A

文章编号:1000-7091(2018)06-0088-07

doi:10.7668/hbnxb.2018.06.012

收稿日期2018-08-10

基金项目贵州省烟草科学研究院科技项目(201752010040011)

作者简介杨尚谕(1992-),男,四川温江人,在读硕士,主要从事烟草分子生物学研究。

通讯作者

鲁黎明(1965-),男,河南正阳人,副教授,博士,硕士生导师,主要从事烟草钾营养及分子生物学研究。

任学良(1976-),男,山西孝义人,研究员,博士,硕士生导师,主要从事烟草遗传育种与分子生物学研究。